RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299314.11

GNPTAB-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 5,701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-201ENST00000299314 COA7Q96BR5 231 aa26.08■■□□□ 1.77
GNPTAB-201ENST00000299314 FIS1Q9Y3D6 152 aa26.08■■□□□ 1.77
GNPTAB-201ENST00000299314 APOL6Q9BWW8 343 aa26.08■■□□□ 1.77
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa26.08■■□□□ 1.77
GNPTAB-201ENST00000299314 ZSWIM5Q9P217 1185 aa26.08■■□□□ 1.77
GNPTAB-201ENST00000299314 INTUQ9ULD6 942 aa26.08■■□□□ 1.77
GNPTAB-201ENST00000299314 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
GNPTAB-201ENST00000299314 LPXNO60711 386 aa26.08■■□□□ 1.77
GNPTAB-201ENST00000299314 PI4K2BQ8TCG2 481 aa26.08■■□□□ 1.77
GNPTAB-201ENST00000299314 TLK1Q9UKI8 766 aa26.08■■□□□ 1.77
GNPTAB-201ENST00000299314 AATKQ6ZMQ8 1374 aa26.08■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 SYNMO15061 1565 aa26.07■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 POLE2P56282 527 aa26.07■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 TERF2Q15554 542 aa26.07■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 SPC25Q9HBM1 224 aa26.07■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 PPME1Q9Y570 386 aa26.07■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 LRRC63Q05C16 580 aa26.07■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 AIFM3Q96NN9 605 aa26.07■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 ANLNQ9NQW6 1124 aa26.07■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 TTI1O43156 1089 aa26.07■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 MED7O43513 233 aa26.07■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 XDHP47989 1333 aa26.07■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa26.07■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 MAPK13O15264 365 aa26.07■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 NECTIN1Q15223 517 aa26.07■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 E2F4Q16254 413 aa26.07■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa26.07■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 CALN1Q9BXU9 219 aa26.07■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC7A3Q8WY07 619 aa26.06■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 MAML1Q92585 1016 aa26.06■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 ATP6V1E2Q96A05 226 aa26.06■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa26.06■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 ATP10AO60312 1499 aa26.06■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 PI16Q6UXB8 463 aa26.05■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 PARVGQ9HBI0 331 aa26.05■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 GSTA4O15217 222 aa26.05■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 ARL4AP40617 200 aa26.05■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM149B1Q96BN6 582 aa26.05■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 ART3Q13508 389 aa26.05■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa26.05■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 ACSL3O95573 720 aa26.05■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 FGGP02679 453 aa26.05■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 MXI1P50539 228 aa26.05■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 CCDC138Q96M89 665 aa26.05■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa26.05■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 PTPREP23469 700 aa26.05■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 NUGGCQ68CJ6 796 aa26.05■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 CA4P22748 312 aa26.04■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 BBS9Q3SYG4 887 aa26.04■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 SIRT2Q8IXJ6 389 aa26.04■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF521Q96K83 1311 aa26.04■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 IQCB1Q15051 598 aa26.04■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 TMTC4Q5T4D3 741 aa26.04■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 USPL1Q5W0Q7 1092 aa26.04■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 PCGF5Q86SE9 256 aa26.04■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 LEMD3Q9Y2U8 911 aa26.04■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.04■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 XPOTO43592 962 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 DDIT3P35638 169 aa26.04■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP26.04■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 ATG16L1Q676U5 607 aa26.04■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 SPOPLQ6IQ16 392 aa26.04■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 KRT80Q6KB66 452 aa26.04■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 CENPUQ71F23 418 aa26.04■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 CEP170P1Q96L14 293 aa26.04■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.04■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 ATG3Q9NT62 314 aa26.04■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 RWDD2BP57060 319 aa26.03■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC12A1Q13621 1099 aa26.03■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 UBE2SQ16763 222 aa26.03■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 SNX25Q9H3E2 840 aa26.03■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 BBS5Q8N3I7 341 aa26.03■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 GINM1Q9NU53 330 aa26.03■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 MMEP08473 750 aa26.03■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 MAGEA9P43362 315 aa26.03■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 PDCLQ13371 301 aa26.03■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa26.03■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 PALMO75781 387 aa26.03■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 PYROXD1Q8WU10 500 aa26.03■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 SERPINI1Q99574 410 aa26.03■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 AKT3Q9Y243 479 aa26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms