RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295718.6

PTPRN-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRN, Length 3,784 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-201ENST00000295718 TPH2Q8IWU9 490 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRN-201ENST00000295718 ERMNQ8TAM6 284 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRN-201ENST00000295718 AK8Q96MA6 479 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRN-201ENST00000295718 BRIP1Q9BX63 1249 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRN-201ENST00000295718 TMOD4Q9NZQ9 345 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRN-201ENST00000295718 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
PTPRN-201ENST00000295718 EEF2P13639 858 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
PTPRN-201ENST00000295718 BTDP43251 543 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRN-201ENST00000295718 UBXN2AP68543 259 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRN-201ENST00000295718 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
PTPRN-201ENST00000295718 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
PTPRN-201ENST00000295718 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
PTPRN-201ENST00000295718 CARD10Q9BWT7 1032 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRN-201ENST00000295718 USP17L15C9J2P7 530 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRN-201ENST00000295718 USP17L13C9JLJ4 530 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRN-201ENST00000295718 USP17L11C9JVI0 530 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRN-201ENST00000295718 USP17L18D6R9N7 530 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRN-201ENST00000295718 USP17L22D6RA61 530 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRN-201ENST00000295718 USP17L17D6RBQ6 530 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRN-201ENST00000295718 USP17L19D6RCP7 530 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRN-201ENST00000295718 USP17L20D6RJB6 530 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRN-201ENST00000295718 SCP2P22307 547 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRN-201ENST00000295718 CDC25CP30307 473 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRN-201ENST00000295718 PPP2R2AP63151 447 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRN-201ENST00000295718 USP17L24Q0WX57 530 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRN-201ENST00000295718 GJB7Q6PEY0 223 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRN-201ENST00000295718 USP17L6PQ6QN14 398 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRN-201ENST00000295718 PARP9Q8IXQ6 854 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRN-201ENST00000295718 PSTPIP2Q9H939 334 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRN-201ENST00000295718 DNM3Q9UQ16 869 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRN-201ENST00000295718 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa15.77■□□□□ 0.11
PTPRN-201ENST00000295718 UFL1O94874 794 aa15.77■□□□□ 0.11
PTPRN-201ENST00000295718 HSD17B3P37058 310 aa15.77■□□□□ 0.11
PTPRN-201ENST00000295718 SIK1P57059 783 aa15.77■□□□□ 0.11
PTPRN-201ENST00000295718 COASYQ13057 564 aa15.77■□□□□ 0.11
PTPRN-201ENST00000295718 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.11
PTPRN-201ENST00000295718 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.11
PTPRN-201ENST00000295718 GCNT4Q9P109 453 aa15.77■□□□□ 0.11
PTPRN-201ENST00000295718 RPL13P26373 211 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.11
PTPRN-201ENST00000295718 CALRP27797 417 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.11
PTPRN-201ENST00000295718 GSTO1P78417 241 aa15.77■□□□□ 0.11
PTPRN-201ENST00000295718 NAALADL2Q58DX5 795 aa15.77■□□□□ 0.11
PTPRN-201ENST00000295718 SEL1L2Q5TEA6 688 aa15.77■□□□□ 0.11
PTPRN-201ENST00000295718 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa15.77■□□□□ 0.11
PTPRN-201ENST00000295718 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.11
PTPRN-201ENST00000295718 TPTE2Q6XPS3 522 aa15.77■□□□□ 0.11
PTPRN-201ENST00000295718 KLHL29Q96CT2 875 aa15.77■□□□□ 0.11
PTPRN-201ENST00000295718 CCSER1Q9C0I3 900 aa15.77■□□□□ 0.11
PTPRN-201ENST00000295718 CUEDC2Q9H467 287 aa15.77■□□□□ 0.11
PTPRN-201ENST00000295718 SERPINA10Q9UK55 444 aa15.77■□□□□ 0.11
PTPRN-201ENST00000295718 GNPATO15228 680 aa15.76■□□□□ 0.11
PTPRN-201ENST00000295718 EXOC3O60645 756 aa15.76■□□□□ 0.11
PTPRN-201ENST00000295718 ITGA4P13612 1032 aa15.76■□□□□ 0.11
PTPRN-201ENST00000295718 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
PTPRN-201ENST00000295718 PLCB3Q01970 1234 aa15.76■□□□□ 0.11
PTPRN-201ENST00000295718 KIAA0895Q8NCT3 520 aa15.76■□□□□ 0.11
PTPRN-201ENST00000295718 FBF1Q8TES7 1133 aa15.76■□□□□ 0.11
PTPRN-201ENST00000295718 AZI2Q9H6S1 392 aa15.76■□□□□ 0.11
PTPRN-201ENST00000295718 BARHL2Q9NY43 387 aa15.76■□□□□ 0.11
PTPRN-201ENST00000295718 ZNF233A6NK53 670 aa15.76■□□□□ 0.11
PTPRN-201ENST00000295718 PLA2G4BP0C869 781 aa15.76■□□□□ 0.11
PTPRN-201ENST00000295718 FAM182BQ5T319 152 aa15.76■□□□□ 0.11
PTPRN-201ENST00000295718 GLYCTKQ8IVS8 523 aa15.76■□□□□ 0.11
PTPRN-201ENST00000295718 KIF2BQ8N4N8 673 aa15.76■□□□□ 0.11
PTPRN-201ENST00000295718 PLA2G12BQ9BX93 195 aa15.76■□□□□ 0.11
PTPRN-201ENST00000295718 RAB17Q9H0T7 212 aa15.76■□□□□ 0.11
PTPRN-201ENST00000295718 SALL4Q9UJQ4 1053 aa15.76■□□□□ 0.11
PTPRN-201ENST00000295718 CETN1Q12798 172 aa15.76■□□□□ 0.11
PTPRN-201ENST00000295718 GLG1Q92896 1179 aa15.76■□□□□ 0.11
PTPRN-201ENST00000295718 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
PTPRN-201ENST00000295718 SEC16BQ96JE7 1060 aa15.76■□□□□ 0.11
PTPRN-201ENST00000295718 ZNF804BA4D1E1 1349 aa15.75■□□□□ 0.11
PTPRN-201ENST00000295718 POTEFA5A3E0 1075 aa15.75■□□□□ 0.11
PTPRN-201ENST00000295718 POTEIP0CG38 1075 aa15.75■□□□□ 0.11
PTPRN-201ENST00000295718 ERFP50548 548 aa15.75■□□□□ 0.11
PTPRN-201ENST00000295718 NUGGCQ68CJ6 796 aa15.75■□□□□ 0.11
PTPRN-201ENST00000295718 POTEGQ6S5H5 508 aa15.75■□□□□ 0.11
PTPRN-201ENST00000295718 POTEEQ6S8J3 1075 aa15.75■□□□□ 0.11
PTPRN-201ENST00000295718 FAM47EQ6ZV65 393 aa15.75■□□□□ 0.11
PTPRN-201ENST00000295718 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
PTPRN-201ENST00000295718 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
PTPRN-201ENST00000295718 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
PTPRN-201ENST00000295718 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
PTPRN-201ENST00000295718 STX2P32856 288 aa15.75■□□□□ 0.11
PTPRN-201ENST00000295718 SCNN1DP51172 638 aa15.75■□□□□ 0.11
PTPRN-201ENST00000295718 LRRC63Q05C16 580 aa15.75■□□□□ 0.11
PTPRN-201ENST00000295718 SHISA4Q96DD7 197 aa15.75■□□□□ 0.11
PTPRN-201ENST00000295718 CEP95Q96GE4 821 aa15.75■□□□□ 0.11
PTPRN-201ENST00000295718 CEP72Q9P209 647 aa15.75■□□□□ 0.11
PTPRN-201ENST00000295718 MON2Q7Z3U7 1717 aa15.75■□□□□ 0.11
PTPRN-201ENST00000295718 H0Y3Z8 333 aa15.75■□□□□ 0.11
PTPRN-201ENST00000295718 FGFR4P22455 802 aa15.75■□□□□ 0.11
PTPRN-201ENST00000295718 PTK2Q05397 1052 aa15.75■□□□□ 0.11
PTPRN-201ENST00000295718 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
PTPRN-201ENST00000295718 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
PTPRN-201ENST00000295718 MFSD14BQ5SR56 506 aa15.75■□□□□ 0.11
PTPRN-201ENST00000295718 ZNF507Q8TCN5 953 aa15.75■□□□□ 0.11
PTPRN-201ENST00000295718 ERGIC2Q96RQ1 377 aa15.75■□□□□ 0.11
PTPRN-201ENST00000295718 PSMD1Q99460 953 aa15.75■□□□□ 0.11
PTPRN-201ENST00000295718 NUDT12Q9BQG2 462 aa15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.4 ms