RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292377.3

GPC2-201, Transcript of glypican 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GPC2, Length 2,532 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC2-201ENST00000292377 ABCB11O95342 1321 aa20.24■□□□□ 0.83
GPC2-201ENST00000292377 APBA1Q02410 837 aa20.23■□□□□ 0.83
GPC2-201ENST00000292377 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
GPC2-201ENST00000292377 MAN2A1Q16706 1144 aa20.23■□□□□ 0.83
GPC2-201ENST00000292377 FAM160B2Q86V87 743 aa20.23■□□□□ 0.83
GPC2-201ENST00000292377 IKZF4Q9H2S9 585 aa20.23■□□□□ 0.83
GPC2-201ENST00000292377 SH2D4AQ9H788 454 aa20.23■□□□□ 0.83
GPC2-201ENST00000292377 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
GPC2-201ENST00000292377 HACL1Q9UJ83 578 aa20.23■□□□□ 0.83
GPC2-201ENST00000292377 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa20.23■□□□□ 0.83
GPC2-201ENST00000292377 PSMD10O75832 226 aa20.23■□□□□ 0.83
GPC2-201ENST00000292377 SLITRK3O94933 977 aa20.23■□□□□ 0.83
GPC2-201ENST00000292377 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
GPC2-201ENST00000292377 MAP3K9P80192 1104 aa20.23■□□□□ 0.83
GPC2-201ENST00000292377 SLC35F6Q8N357 371 aa20.23■□□□□ 0.83
GPC2-201ENST00000292377 IL31RAQ8NI17 732 aa20.23■□□□□ 0.83
GPC2-201ENST00000292377 HOOK2Q96ED9 719 aa20.23■□□□□ 0.83
GPC2-201ENST00000292377 KCTD10Q9H3F6 313 aa20.23■□□□□ 0.83
GPC2-201ENST00000292377 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
GPC2-201ENST00000292377 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
GPC2-201ENST00000292377 FRMD3A2A2Y4 597 aa20.22■□□□□ 0.83
GPC2-201ENST00000292377 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
GPC2-201ENST00000292377 MYBP10242 640 aa20.22■□□□□ 0.83
GPC2-201ENST00000292377 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
GPC2-201ENST00000292377 CEP55Q53EZ4 464 aa20.22■□□□□ 0.83
GPC2-201ENST00000292377 HSD17B14Q9BPX1 270 aa20.22■□□□□ 0.83
GPC2-201ENST00000292377 KIF5CO60282 957 aa20.22■□□□□ 0.83
GPC2-201ENST00000292377 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
GPC2-201ENST00000292377 HOXD13P35453 343 aa20.22■□□□□ 0.83
GPC2-201ENST00000292377 HERVK_113P62684 666 aa20.22■□□□□ 0.83
GPC2-201ENST00000292377 KCNA1Q09470 495 aa20.22■□□□□ 0.83
GPC2-201ENST00000292377 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
GPC2-201ENST00000292377 CCDC40Q4G0X9 1142 aa20.22■□□□□ 0.83
GPC2-201ENST00000292377 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa20.22■□□□□ 0.83
GPC2-201ENST00000292377 DEFB129Q9H1M3 183 aa20.22■□□□□ 0.83
GPC2-201ENST00000292377 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa20.22■□□□□ 0.83
GPC2-201ENST00000292377 ZBED6P86452 979 aa20.21■□□□□ 0.83
GPC2-201ENST00000292377 CYP27A1Q02318 531 aa20.21■□□□□ 0.83
GPC2-201ENST00000292377 MNS1Q8NEH6 495 aa20.21■□□□□ 0.83
GPC2-201ENST00000292377 CRACR2AQ9BSW2 395 aa20.21■□□□□ 0.83
GPC2-201ENST00000292377 MTFR1LQ9H019 292 aa20.21■□□□□ 0.83
GPC2-201ENST00000292377 GUCA1BQ9UMX6 200 aa20.21■□□□□ 0.83
GPC2-201ENST00000292377 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa20.21■□□□□ 0.83
GPC2-201ENST00000292377 MRFAP1Q9Y605 127 aa20.21■□□□□ 0.83
GPC2-201ENST00000292377 SPDYE4A6NLX3 237 aa20.21■□□□□ 0.83
GPC2-201ENST00000292377 ALAS1P13196 640 aa20.21■□□□□ 0.83
GPC2-201ENST00000292377 MTMR2Q13614 643 aa20.21■□□□□ 0.83
GPC2-201ENST00000292377 MUM1L1Q5H9M0 696 aa20.21■□□□□ 0.83
GPC2-201ENST00000292377 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
GPC2-201ENST00000292377 NUP58Q9BVL2 599 aa20.21■□□□□ 0.83
GPC2-201ENST00000292377 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
GPC2-201ENST00000292377 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa20.21■□□□□ 0.83
GPC2-201ENST00000292377 RCCD1A6NED2 376 aa20.2■□□□□ 0.82
GPC2-201ENST00000292377 PLA2G6O60733 806 aa20.2■□□□□ 0.82
GPC2-201ENST00000292377 GAS7O60861 476 aa20.2■□□□□ 0.82
GPC2-201ENST00000292377 ITGB5P18084 799 aa20.2■□□□□ 0.82
GPC2-201ENST00000292377 KCNMA1Q12791 1236 aa20.2■□□□□ 0.82
GPC2-201ENST00000292377 MEA1Q16626 185 aa20.2■□□□□ 0.82
GPC2-201ENST00000292377 CLEC4DQ8WXI8 215 aa20.2■□□□□ 0.82
GPC2-201ENST00000292377 SLC5A5Q92911 643 aa20.2■□□□□ 0.82
GPC2-201ENST00000292377 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
GPC2-201ENST00000292377 WNK4Q96J92 1243 aa20.2■□□□□ 0.82
GPC2-201ENST00000292377 ZNF577Q9BSK1 485 aa20.2■□□□□ 0.82
GPC2-201ENST00000292377 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
GPC2-201ENST00000292377 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa20.2■□□□□ 0.82
GPC2-201ENST00000292377 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
GPC2-201ENST00000292377 ICAM1P05362 532 aa20.2■□□□□ 0.82
GPC2-201ENST00000292377 KRT26Q7Z3Y9 468 aa20.2■□□□□ 0.82
GPC2-201ENST00000292377 UNC45AQ9H3U1 944 aa20.2■□□□□ 0.82
GPC2-201ENST00000292377 ADAM9Q13443 819 aa20.19■□□□□ 0.82
GPC2-201ENST00000292377 RINT1Q6NUQ1 792 aa20.19■□□□□ 0.82
GPC2-201ENST00000292377 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
GPC2-201ENST00000292377 ATAD5Q96QE3 1844 aa20.19■□□□□ 0.82
GPC2-201ENST00000292377 TADA3O75528 432 aa20.19■□□□□ 0.82
GPC2-201ENST00000292377 FLOT1O75955 427 aa20.19■□□□□ 0.82
GPC2-201ENST00000292377 TRAF1Q13077 416 aa20.19■□□□□ 0.82
GPC2-201ENST00000292377 KSR1Q8IVT5 923 aa20.19■□□□□ 0.82
GPC2-201ENST00000292377 RETREG2Q8NC44 543 aa20.19■□□□□ 0.82
GPC2-201ENST00000292377 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
GPC2-201ENST00000292377 WDR11Q9BZH6 1224 aa20.19■□□□□ 0.82
GPC2-201ENST00000292377 DUSP10Q9Y6W6 482 aa20.19■□□□□ 0.82
GPC2-201ENST00000292377 ZNF541Q9H0D2 1346 aa20.18■□□□□ 0.82
GPC2-201ENST00000292377 EYA4O95677 639 aa20.18■□□□□ 0.82
GPC2-201ENST00000292377 PPP2R3AQ06190 1150 aa20.18■□□□□ 0.82
GPC2-201ENST00000292377 SPP2Q13103 211 aa20.18■□□□□ 0.82
GPC2-201ENST00000292377 RRAGAQ7L523 313 aa20.18■□□□□ 0.82
GPC2-201ENST00000292377 BANK1Q8NDB2 785 aa20.18■□□□□ 0.82
GPC2-201ENST00000292377 NLGN2Q8NFZ4 835 aa20.18■□□□□ 0.82
GPC2-201ENST00000292377 LACRTQ9GZZ8 138 aa20.18■□□□□ 0.82
GPC2-201ENST00000292377 ZNF263O14978 683 aa20.18■□□□□ 0.82
GPC2-201ENST00000292377 TNFAIP1Q13829 316 aa20.18■□□□□ 0.82
GPC2-201ENST00000292377 NLRC4Q9NPP4 1024 aa20.18■□□□□ 0.82
GPC2-201ENST00000292377 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
GPC2-201ENST00000292377 LRRC53A6NM62 1247 aa20.17■□□□□ 0.82
GPC2-201ENST00000292377 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
GPC2-201ENST00000292377 VCAM1P19320 739 aa20.17■□□□□ 0.82
GPC2-201ENST00000292377 NR2F2P24468 414 aa20.17■□□□□ 0.82
GPC2-201ENST00000292377 PPP2R5CQ13362 524 aa20.17■□□□□ 0.82
GPC2-201ENST00000292377 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
GPC2-201ENST00000292377 UBXN4Q92575 508 aa20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.3 ms