RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264896.7

SCARB2-201, Transcript of scavenger receptor class B member 2, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SCARB2, Length 4,792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2-201ENST00000264896 CEP72Q9P209 647 aa19.12■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 NOD1Q9Y239 953 aa19.12■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa19.12■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa19.12■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa19.12■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 KAZNQ674X7 775 aa19.12■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 DCAF4Q8WV16 495 aa19.12■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 CDHR1Q96JP9 859 aa19.12■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 HESX1Q9UBX0 185 aa19.12■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 KCNJ6P48051 423 aa19.11■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 SARNPP82979 210 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 NEDD1Q8NHV4 660 aa19.11■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 PP2D1A8MPX8 630 aa19.11■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 NNTQ13423 1086 aa19.11■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 TAF12Q16514 161 aa19.11■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 CCDC125Q86Z20 511 aa19.11■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 RAD54LQ92698 747 aa19.11■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 ALCAMQ13740 583 aa19.11■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 SGO2Q562F6 1265 aa19.11■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 FAM160B1Q5W0V3 765 aa19.11■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 MMS19Q96T76 1030 aa19.11■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 USP17L15C9J2P7 530 aa19.11■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 USP17L13C9JLJ4 530 aa19.11■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 USP17L11C9JVI0 530 aa19.11■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 USP17L18D6R9N7 530 aa19.11■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 USP17L22D6RA61 530 aa19.11■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 USP17L17D6RBQ6 530 aa19.11■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 USP17L19D6RCP7 530 aa19.11■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 USP17L20D6RJB6 530 aa19.11■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 FDPSP14324 419 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 USP14P54578 494 aa19.11■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 ANTXR2P58335 489 aa19.11■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 USP17L24Q0WX57 530 aa19.11■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 BSPRYQ5W0U4 402 aa19.11■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 USP17L6PQ6QN14 398 aa19.11■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 HAUS1Q96CS2 278 aa19.11■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 GH2P01242 217 aa19.1■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 IFNAR2P48551 515 aa19.1■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 GEN1Q17RS7 908 aa19.1■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 PPP1R18Q6NYC8 613 aa19.1■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 SMC1BQ8NDV3 1235 aa19.1■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 TUBE1Q9UJT0 475 aa19.1■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 LRRC53A6NM62 1247 aa19.1■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 CCDC188H7C350 402 aa19.1■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 TMOD1P28289 359 aa19.1■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP19.1■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 PCDHA6Q9UN73 950 aa19.1■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa19.1■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 C1orf167Q5SNV9 1468 aa19.1■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa19.1■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 A0A1W2PQC6 194 aa19.1■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 ECEL1O95672 775 aa19.1■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 RAD17O75943 681 aa19.09■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 IFT88Q13099 833 aa19.09■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 ADAM21Q9UKJ8 722 aa19.09■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 STK38LQ9Y2H1 464 aa19.09■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 CCZ1BP86790 482 aa19.09■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP19.09■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 NCAPG2Q86XI2 1143 aa19.09■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 FAM20AQ96MK3 541 aa19.09■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa19.09■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 ADGRB1O14514 1584 aa19.09■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 E9PMD0 336 aa19.09■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 SRGAP2O75044 1071 aa19.09■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 KCNB1Q14721 858 aa19.09■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 C12orf60Q5U649 245 aa19.09■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 RILPQ96NA2 401 aa19.09■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 SFI1A8K8P3 1242 aa19.09■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 CACNB3P54284 484 aa19.09■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 LLGL1Q15334 1064 aa19.09■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP19.09■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 CTDNEP1O95476 244 aa19.08■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa19.08■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 CCDC197Q8NCU1 140 aa19.08■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 NFU1Q9UMS0 254 aa19.08■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 ARHGAP4P98171 946 aa19.08■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 COASYQ13057 564 aa19.08■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 FAM83BQ5T0W9 1011 aa19.08■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 SFR1Q86XK3 245 aa19.08■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 ZNF34Q8IZ26 560 aa19.08■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 PIGOQ8TEQ8 1089 aa19.08■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 FMO2Q99518 471 aa19.08■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa19.08■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP19.08■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 TMEM260Q9NX78 707 aa19.08■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 USP17L10C9JJH3 530 aa19.08■□□□□ 0.64
SCARB2-201ENST00000264896 SUN1O94901 812 aa19.08■□□□□ 0.64
SCARB2-201ENST00000264896 CA8P35219 290 aa19.08■□□□□ 0.64
SCARB2-201ENST00000264896 SNAP25P60880 206 aa19.08■□□□□ 0.64
SCARB2-201ENST00000264896 KCNH2Q12809 1159 aa19.08■□□□□ 0.64
SCARB2-201ENST00000264896 KRT27Q7Z3Y8 459 aa19.08■□□□□ 0.64
SCARB2-201ENST00000264896 RHOT2Q8IXI1 618 aa19.08■□□□□ 0.64
SCARB2-201ENST00000264896 STAG2Q8N3U4 1231 aa19.08■□□□□ 0.64
SCARB2-201ENST00000264896 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms