RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000042850.8

Svep1-201, Transcript of Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Svep1, Length 11,629 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Svep1-201ENSMUST00000042850 Acbd5Q5XG73 508 aa9.96□□□□□ -0.81
Svep1-201ENSMUST00000042850 Meis1Q60954 390 aa9.96□□□□□ -0.81
Svep1-201ENSMUST00000042850 E330017A01RikQ8BU47 192 aa9.96□□□□□ -0.81
Svep1-201ENSMUST00000042850 Prpf4Q9DAW6 521 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
Svep1-201ENSMUST00000042850 Orc3Q9JK30 715 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
Svep1-201ENSMUST00000042850 Kdm5aQ3UXZ9 1690 aa9.96□□□□□ -0.81
Svep1-201ENSMUST00000042850 Prss51A0A286YDY8 319 aa9.96□□□□□ -0.81
Svep1-201ENSMUST00000042850 Pcdhb11Q91UZ8 797 aa9.96□□□□□ -0.81
Svep1-201ENSMUST00000042850 Ascc2Q91WR3 749 aa9.96□□□□□ -0.81
Svep1-201ENSMUST00000042850 DffaO54786 331 aa9.96□□□□□ -0.82
Svep1-201ENSMUST00000042850 Vamp4O70480 141 aa9.96□□□□□ -0.82
Svep1-201ENSMUST00000042850 Pde11aP0C1Q2 933 aa9.96□□□□□ -0.82
Svep1-201ENSMUST00000042850 Plbd2Q3TCN2 594 aa9.96□□□□□ -0.82
Svep1-201ENSMUST00000042850 Nme8Q715T0 586 aa9.96□□□□□ -0.82
Svep1-201ENSMUST00000042850 Ttc23Q8CHY7 488 aa9.96□□□□□ -0.82
Svep1-201ENSMUST00000042850 Trpv6Q91WD2 767 aa9.96□□□□□ -0.82
Svep1-201ENSMUST00000042850 Nde1Q9CZA6 344 aa9.96□□□□□ -0.82
Svep1-201ENSMUST00000042850 Copb1Q9JIF7 953 aa9.96□□□□□ -0.82
Svep1-201ENSMUST00000042850 Shroom2A2ALU4 1481 aa9.96□□□□□ -0.82
Svep1-201ENSMUST00000042850 WizO88286 1684 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
Svep1-201ENSMUST00000042850 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa9.96□□□□□ -0.82
Svep1-201ENSMUST00000042850 Mmrn1B2RPV6 1210 aa9.96□□□□□ -0.82
Svep1-201ENSMUST00000042850 Tlr7P58681 1050 aa9.96□□□□□ -0.82
Svep1-201ENSMUST00000042850 Sap130Q8BIH0 1057 aa9.96□□□□□ -0.82
Svep1-201ENSMUST00000042850 Ttll1Q91V51 423 aa9.96□□□□□ -0.82
Svep1-201ENSMUST00000042850 Kdm6aO70546 1401 aa9.96□□□□□ -0.82
Svep1-201ENSMUST00000042850 Rbbp7Q60973 425 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
Svep1-201ENSMUST00000042850 Vmn1r191Q8K4D0 298 aa9.96□□□□□ -0.82
Svep1-201ENSMUST00000042850 Vps33aQ9D2N9 598 aa9.96□□□□□ -0.82
Svep1-201ENSMUST00000042850 Foxp1P58462 705 aa9.96□□□□□ -0.82
Svep1-201ENSMUST00000042850 Cct7P80313 544 aa9.96□□□□□ -0.82
Svep1-201ENSMUST00000042850 Prpf38aQ4FK66 312 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
Svep1-201ENSMUST00000042850 ScinQ60604 715 aa9.96□□□□□ -0.82
Svep1-201ENSMUST00000042850 QarsQ8BML9 775 aa9.96□□□□□ -0.82
Svep1-201ENSMUST00000042850 Gm3755K7N743 167 aa9.96□□□□□ -0.82
Svep1-201ENSMUST00000042850 Gm8897L7N294 181 aa9.96□□□□□ -0.82
Svep1-201ENSMUST00000042850 OsbpQ3B7Z2 805 aa9.96□□□□□ -0.82
Svep1-201ENSMUST00000042850 Pcgf5Q3UK78 256 aa9.96□□□□□ -0.82
Svep1-201ENSMUST00000042850 Glrx3Q9CQM9 337 aa9.96□□□□□ -0.82
Svep1-201ENSMUST00000042850 Slc30a9Q5IRJ6 567 aa9.95□□□□□ -0.82
Svep1-201ENSMUST00000042850 Man1c1Q6NXK9 625 aa9.95□□□□□ -0.82
Svep1-201ENSMUST00000042850 Ddx42Q810A7 929 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
Svep1-201ENSMUST00000042850 Cd209bQ8CJ91 325 aa9.95□□□□□ -0.82
Svep1-201ENSMUST00000042850 HaspinQ9Z0R0 754 aa9.95□□□□□ -0.82
Svep1-201ENSMUST00000042850 Lrrc6O88978 473 aa9.95□□□□□ -0.82
Svep1-201ENSMUST00000042850 Hoxc9P09633 260 aa9.95□□□□□ -0.82
Svep1-201ENSMUST00000042850 Palb2Q3U0P1 1104 aa9.95□□□□□ -0.82
Svep1-201ENSMUST00000042850 SpdyaQ5IBH7 310 aa9.95□□□□□ -0.82
Svep1-201ENSMUST00000042850 Atp5c1Q91VR2 298 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
Svep1-201ENSMUST00000042850 Dnajc17Q91WT4 303 aa9.95□□□□□ -0.82
Svep1-201ENSMUST00000042850 Ireb2Q811J3 963 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
Svep1-201ENSMUST00000042850 Ferd3lQ923Z4 168 aa9.95□□□□□ -0.82
Svep1-201ENSMUST00000042850 Fbxo3Q9DC63 480 aa9.95□□□□□ -0.82
Svep1-201ENSMUST00000042850 NfkbizQ9EST8 728 aa9.95□□□□□ -0.82
Svep1-201ENSMUST00000042850 Anxa1P10107 346 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
Svep1-201ENSMUST00000042850 Armcx2Q6A058 784 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
Svep1-201ENSMUST00000042850 Ndel1Q9ERR1 345 aa9.95□□□□□ -0.82
Svep1-201ENSMUST00000042850 Dnajc6Q80TZ3 938 aa9.95□□□□□ -0.82
Svep1-201ENSMUST00000042850 Slc12a7Q9WVL3 1083 aa9.95□□□□□ -0.82
Svep1-201ENSMUST00000042850 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
Svep1-201ENSMUST00000042850 Gm5483B2RV77 97 aa9.95□□□□□ -0.82
Svep1-201ENSMUST00000042850 Psmc1P62192 440 aa9.95□□□□□ -0.82
Svep1-201ENSMUST00000042850 Olfr1415Q7TQS4 311 aa9.95□□□□□ -0.82
Svep1-201ENSMUST00000042850 Olfr1416Q8VGU4 312 aa9.95□□□□□ -0.82
Svep1-201ENSMUST00000042850 Afg3l1Q920A7 789 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
Svep1-201ENSMUST00000042850 Olfm4Q3UZZ4 505 aa9.95□□□□□ -0.82
Svep1-201ENSMUST00000042850 Tas2r124Q7M718 309 aa9.95□□□□□ -0.82
Svep1-201ENSMUST00000042850 TrabdQ99JY4 376 aa9.95□□□□□ -0.82
Svep1-201ENSMUST00000042850 1700109H08RikQ9D9C0 210 aa9.95□□□□□ -0.82
Svep1-201ENSMUST00000042850 Phkg2Q9DB30 406 aa9.95□□□□□ -0.82
Svep1-201ENSMUST00000042850 Slc5a4aQ9ET37 656 aa9.95□□□□□ -0.82
Svep1-201ENSMUST00000042850 Lrch1P62046 709 aa9.95□□□□□ -0.82
Svep1-201ENSMUST00000042850 Mapre1Q61166 268 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
Svep1-201ENSMUST00000042850 Papd5Q68ED3 633 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
Svep1-201ENSMUST00000042850 DtnaQ9D2N4 746 aa9.95□□□□□ -0.82
Svep1-201ENSMUST00000042850 Cylc2B1AWN8 422 aa9.95□□□□□ -0.82
Svep1-201ENSMUST00000042850 Tex28B1AYN9 409 aa9.95□□□□□ -0.82
Svep1-201ENSMUST00000042850 Cops2P61202 443 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
Svep1-201ENSMUST00000042850 RnaselQ05921 735 aa9.95□□□□□ -0.82
Svep1-201ENSMUST00000042850 AlcamQ61490 583 aa9.95□□□□□ -0.82
Svep1-201ENSMUST00000042850 Tfap4Q9JIZ5 338 aa9.95□□□□□ -0.82
Svep1-201ENSMUST00000042850 Shcbp1Q9Z179 668 aa9.95□□□□□ -0.82
Svep1-201ENSMUST00000042850 Rgl1Q60695 768 aa9.94□□□□□ -0.82
Svep1-201ENSMUST00000042850 Rd3Q8BRE0 195 aa9.94□□□□□ -0.82
Svep1-201ENSMUST00000042850 TraipQ8VIG6 470 aa9.94□□□□□ -0.82
Svep1-201ENSMUST00000042850 Rfc4Q99J62 364 aa9.94□□□□□ -0.82
Svep1-201ENSMUST00000042850 CenpsQ9D084 142 aa9.94□□□□□ -0.82
Svep1-201ENSMUST00000042850 Ddit3P35639 168 aa9.94□□□□□ -0.82
Svep1-201ENSMUST00000042850 Nudt18Q3U2V3 323 aa9.94□□□□□ -0.82
Svep1-201ENSMUST00000042850 Yipf3Q3UDR8 347 aa9.94□□□□□ -0.82
Svep1-201ENSMUST00000042850 Scaf1Q5U4C3 1256 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
Svep1-201ENSMUST00000042850 Trim8Q99PJ2 551 aa9.94□□□□□ -0.82
Svep1-201ENSMUST00000042850 PtprkP35822 1457 aa9.94□□□□□ -0.82
Svep1-201ENSMUST00000042850 Plb1Q3TTY0 1478 aa9.94□□□□□ -0.82
Svep1-201ENSMUST00000042850 Ifit3bE9PV48 403 aa9.94□□□□□ -0.82
Svep1-201ENSMUST00000042850 Gm21962L7N280 338 aa9.94□□□□□ -0.82
Svep1-201ENSMUST00000042850 Stx3Q64704 289 aa9.94□□□□□ -0.82
Svep1-201ENSMUST00000042850 Tp53bp2Q8CG79 1128 aa9.94□□□□□ -0.82
Svep1-201ENSMUST00000042850 Pdia6Q922R8 440 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
Svep1-201ENSMUST00000042850 HibadhQ99L13 335 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 19.2 ms