RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000036992.8

Lmo1-201, Transcript of Rhombotin-1, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Lmo1, Length 1,282 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Slc39a2G3X943 309 aa21.58■■□□□ 1.05
Lmo1-201ENSMUST00000036992 U2af2P26369 475 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Gm3414Q3TNU4 584 aa21.58■■□□□ 1.05
Lmo1-201ENSMUST00000036992 FcgrtQ61559 365 aa21.58■■□□□ 1.05
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Gga3Q8BMI3 718 aa21.58■■□□□ 1.05
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Ppp2r5dQ91V89 594 aa21.58■■□□□ 1.05
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Slc25a38Q91XD8 326 aa21.58■■□□□ 1.05
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Dnajc19Q9CQV7 116 aa21.58■■□□□ 1.05
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Pold3Q9EQ28 462 aa21.58■■□□□ 1.05
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Fbxo16Q9QZM9 334 aa21.58■■□□□ 1.05
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Gm5737A0A140LI11 423 aa21.57■■□□□ 1.04
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Sptbn5F6UCX4 1208 aa21.57■■□□□ 1.04
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Hoxc8P09025 242 aa21.57■■□□□ 1.04
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Aldh1a1P24549 501 aa21.57■■□□□ 1.04
Lmo1-201ENSMUST00000036992 CgnP59242 1191 aa21.57■■□□□ 1.04
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Lman2lP59481 347 aa21.57■■□□□ 1.04
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Znf800Q0VEE6 662 aa21.57■■□□□ 1.04
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Dph1Q5NCQ5 438 aa21.57■■□□□ 1.04
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Icam5Q60625 917 aa21.57■■□□□ 1.04
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Kcnj11Q61743 390 aa21.57■■□□□ 1.04
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Ccdc189Q6NZQ0 333 aa21.57■■□□□ 1.04
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Trim47Q8C0E3 641 aa21.57■■□□□ 1.04
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Ccdc15Q8C9M2 810 aa21.57■■□□□ 1.04
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Etv3Q8R4Z4 513 aa21.57■■□□□ 1.04
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Plcb4Q91UZ1 1175 aa21.57■■□□□ 1.04
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Atp6ap2Q9CYN9 350 aa21.57■■□□□ 1.04
Lmo1-201ENSMUST00000036992 NapaQ9DB05 295 aa21.57■■□□□ 1.04
Lmo1-201ENSMUST00000036992 GdaQ9R111 454 aa21.57■■□□□ 1.04
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Wnt8bQ9WUD6 350 aa21.57■■□□□ 1.04
Lmo1-201ENSMUST00000036992 1110002E22RikE0CYV9 1786 aa21.56■■□□□ 1.04
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Esr2O08537 530 aa21.56■■□□□ 1.04
Lmo1-201ENSMUST00000036992 UgcgO88693 394 aa21.56■■□□□ 1.04
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Rnf19aP50636 840 aa21.56■■□□□ 1.04
Lmo1-201ENSMUST00000036992 DSCC1Q14AI0 399 aa21.56■■□□□ 1.04
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Ano1Q8BHY3 960 aa21.56■■□□□ 1.04
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Rad9aQ9Z0F6 389 aa21.56■■□□□ 1.04
Lmo1-201ENSMUST00000036992 BC025446A0A087WQT1 134 aa21.55■■□□□ 1.04
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Zscan4-ps1A0A1C7CYV3 506 aa21.55■■□□□ 1.04
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Tbkbp1A2A9T0 611 aa21.55■■□□□ 1.04
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Gm12800B1AUV4 484 aa21.55■■□□□ 1.04
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Mroh8E9PYI4 1049 aa21.55■■□□□ 1.04
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Gm3095E9Q058 166 aa21.55■■□□□ 1.04
Lmo1-201ENSMUST00000036992 TrdnE9Q9K5 693 aa21.55■■□□□ 1.04
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Gm12794L7MTS5 483 aa21.55■■□□□ 1.04
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Kpna6O35345 536 aa21.55■■□□□ 1.04
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Hoxc13P50207 328 aa21.55■■□□□ 1.04
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Entpd7Q3TCT4 606 aa21.55■■□□□ 1.04
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Rufy4Q3TYX8 563 aa21.55■■□□□ 1.04
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Prkag3Q8BGM7 489 aa21.55■■□□□ 1.04
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Cyp4f39Q8BGU0 532 aa21.55■■□□□ 1.04
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Grik4Q8BMF5 956 aa21.55■■□□□ 1.04
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Nod2Q8K3Z0 1020 aa21.55■■□□□ 1.04
Lmo1-201ENSMUST00000036992 GlyctkQ8QZY2 523 aa21.55■■□□□ 1.04
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Lmcd1Q8VEE1 365 aa21.55■■□□□ 1.04
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Zfp213E9QAW0 468 aa21.54■■□□□ 1.04
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Gm3383J3QQ59 259 aa21.54■■□□□ 1.04
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Api5O35841 504 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
Lmo1-201ENSMUST00000036992 MafgO54790 162 aa21.54■■□□□ 1.04
Lmo1-201ENSMUST00000036992 MafbP54841 323 aa21.54■■□□□ 1.04
Lmo1-201ENSMUST00000036992 C6.1alQ7M757 291 aa21.54■■□□□ 1.04
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Eif4bQ8BGD9 611 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
Lmo1-201ENSMUST00000036992 NcaphQ8C156 731 aa21.54■■□□□ 1.04
Lmo1-201ENSMUST00000036992 N4bp3Q8C7U1 537 aa21.54■■□□□ 1.04
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Spred2Q924S7 410 aa21.54■■□□□ 1.04
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Ranbp17Q99NF8 1088 aa21.54■■□□□ 1.04
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Gdpd2Q9ESM6 539 aa21.54■■□□□ 1.04
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Eif2ak1Q9Z2R9 619 aa21.54■■□□□ 1.04
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Barx2O08686 283 aa21.53■■□□□ 1.04
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Ppm1aP49443 382 aa21.53■■□□□ 1.04
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Epha2Q03145 977 aa21.53■■□□□ 1.04
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Col9a2Q07643 688 aa21.53■■□□□ 1.04
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Gpatch11Q3UFS4 262 aa21.53■■□□□ 1.04
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Ppp2r5cQ60996 524 aa21.53■■□□□ 1.04
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Mcf2lQ64096 1149 aa21.53■■□□□ 1.04
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Cdca8Q8BHX3 289 aa21.53■■□□□ 1.04
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Arhgef19Q8BWA8 802 aa21.53■■□□□ 1.04
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Dmtf1Q8CE22 761 aa21.53■■□□□ 1.04
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Bag4Q8CI61 457 aa21.53■■□□□ 1.04
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Tspyl4Q8VD63 406 aa21.53■■□□□ 1.04
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Tmod3Q9JHJ0 352 aa21.53■■□□□ 1.04
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Mad1l1Q9WTX8 717 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Atp1a4Q9WV27 1032 aa21.53■■□□□ 1.04
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Gon4lQ9DB00 2260 aa21.53■■□□□ 1.04
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Gm43738A0A0G2JEA5 862 aa21.52■■□□□ 1.04
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Cyp26c1B2RXA7 518 aa21.52■■□□□ 1.04
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Trappc10Q3TLI0 1259 aa21.52■■□□□ 1.04
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Islr2Q5RKR3 745 aa21.52■■□□□ 1.04
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Trak2Q6P9N8 913 aa21.52■■□□□ 1.04
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Nsun6Q7TS68 476 aa21.52■■□□□ 1.04
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Sestd1Q80UK0 696 aa21.52■■□□□ 1.04
Lmo1-201ENSMUST00000036992 VcpkmtQ8C436 228 aa21.52■■□□□ 1.04
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Olfr397Q8VEZ6 315 aa21.52■■□□□ 1.04
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Nrbp2Q91V36 499 aa21.52■■□□□ 1.04
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Dmrtc1Q9D9R7 182 aa21.52■■□□□ 1.04
Lmo1-201ENSMUST00000036992 IydQ9DCX8 285 aa21.52■■□□□ 1.04
Lmo1-201ENSMUST00000036992 DgkeQ9R1C6 564 aa21.52■■□□□ 1.04
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Gm45861A0A1B0GRY3 1923 aa21.51■■□□□ 1.03
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Tbc1d2B1AVH7 922 aa21.51■■□□□ 1.03
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Ccng2O08918 344 aa21.51■■□□□ 1.03
Lmo1-201ENSMUST00000036992 P01644 108 aa21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 105.9 ms