RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027667.12

Pkp1-201, Transcript of Plakophilin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pkp1, Length 4,669 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Eif4a3Q91VC3 411 aaKnown RBP13.93□□□□□ -0.18
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sh2b1Q91ZM2 756 aa13.93□□□□□ -0.18
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dpf1Q9QX66 387 aa13.93□□□□□ -0.18
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Large1Q9Z1M7 756 aa13.93□□□□□ -0.18
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Spata32Q8C5V0 334 aa13.93□□□□□ -0.18
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gins2Q9D600 185 aa13.93□□□□□ -0.18
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Trpm1Q2TV84 1622 aa13.92□□□□□ -0.18
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dnajc21E9Q8D0 531 aa13.92□□□□□ -0.18
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vmn2r71L7N2D8 855 aa13.92□□□□□ -0.18
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sesn2P58043 480 aa13.92□□□□□ -0.18
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gcnt1Q09324 428 aa13.92□□□□□ -0.18
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Usp49Q6P9L4 685 aa13.92□□□□□ -0.18
Pkp1-201ENSMUST00000027667 RbsnQ80Y56 783 aa13.92□□□□□ -0.18
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Arhgap6O54834 987 aa13.92□□□□□ -0.18
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Epha7Q61772 998 aa13.92□□□□□ -0.18
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rpf1Q7TND5 349 aaKnown RBP13.92□□□□□ -0.18
Pkp1-201ENSMUST00000027667 P2ry10Q8BFU7 328 aa13.92□□□□□ -0.18
Pkp1-201ENSMUST00000027667 TbckQ8BM85 762 aa13.92□□□□□ -0.18
Pkp1-201ENSMUST00000027667 NptxrQ99J85 493 aa13.92□□□□□ -0.18
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sgpp1Q9JI99 430 aa13.92□□□□□ -0.18
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Veph1A1A535 833 aa13.92□□□□□ -0.18
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ms4a1P19437 291 aa13.92□□□□□ -0.18
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vwa3aQ3UVV9 1148 aa13.92□□□□□ -0.18
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ccdc57Q6PHN1 1016 aa13.92□□□□□ -0.18
Pkp1-201ENSMUST00000027667 MbipQ99LQ1 341 aa13.92□□□□□ -0.18
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Six6os1Q9CTN5 574 aa13.92□□□□□ -0.18
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Thap2Q9D305 217 aa13.92□□□□□ -0.18
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Kiaa0232Q80U59 1396 aaKnown RBP13.92□□□□□ -0.18
Pkp1-201ENSMUST00000027667 4933406M09RikG3XA12 479 aa13.91□□□□□ -0.18
Pkp1-201ENSMUST00000027667 S100bP50114 92 aa13.91□□□□□ -0.18
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nek1P51954 1203 aa13.91□□□□□ -0.18
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cracr2aQ3UP38 310 aa13.91□□□□□ -0.18
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ppp1r13bQ62415 1087 aa13.91□□□□□ -0.18
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Krt77Q6IFZ6 572 aa13.91□□□□□ -0.18
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cep70Q6IQY5 616 aa13.91□□□□□ -0.18
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Retreg2Q6NS82 541 aa13.91□□□□□ -0.18
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Micall1Q8BGT6 870 aa13.91□□□□□ -0.18
Pkp1-201ENSMUST00000027667 D130040H23RikQ8BII3 405 aa13.91□□□□□ -0.18
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Golph3lQ8R088 285 aaKnown RBP13.91□□□□□ -0.18
Pkp1-201ENSMUST00000027667 JmyQ9QXM1 983 aa13.91□□□□□ -0.18
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mtmr1Q9Z2C4 669 aa13.91□□□□□ -0.18
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rimbp3Q3V0F0 1606 aa13.91□□□□□ -0.18
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Flvcr1B2RXV4 560 aa13.91□□□□□ -0.18
Pkp1-201ENSMUST00000027667 P01734 135 aa13.91□□□□□ -0.18
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dpcr1Q3TNW5 500 aa13.91□□□□□ -0.18
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ppp1r1bQ60829 194 aa13.91□□□□□ -0.18
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fbxo28Q8BIG4 368 aa13.91□□□□□ -0.18
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mei4Q8BRM6 389 aa13.91□□□□□ -0.18
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Phf23Q8BSN5 401 aa13.91□□□□□ -0.18
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tmem63cQ8CBX0 802 aa13.91□□□□□ -0.18
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tcp11l2Q8K1H7 517 aa13.91□□□□□ -0.18
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tmem134Q8R0J4 195 aa13.91□□□□□ -0.18
Pkp1-201ENSMUST00000027667 PdclQ9DBX2 301 aa13.91□□□□□ -0.18
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Kcnma1Q08460 1209 aa13.91□□□□□ -0.18
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gucy2cQ3UWA6 1072 aa13.91□□□□□ -0.18
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mars2Q499X9 586 aaKnown RBP13.91□□□□□ -0.18
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Oxsr1Q6P9R2 527 aa13.91□□□□□ -0.18
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ece2Q80Z60 881 aa13.91□□□□□ -0.18
Pkp1-201ENSMUST00000027667 IydQ9DCX8 285 aa13.91□□□□□ -0.18
Pkp1-201ENSMUST00000027667 1700016G14RikA0A286YCZ6 238 aa13.91□□□□□ -0.18
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Orc4O88708 433 aa13.91□□□□□ -0.18
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rbp3P49194 1234 aa13.91□□□□□ -0.18
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Arid5bQ8BM75 1188 aaKnown RBP13.91□□□□□ -0.18
Pkp1-201ENSMUST00000027667 N4bp3Q8C7U1 537 aa13.91□□□□□ -0.18
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr397Q8VEZ6 315 aa13.91□□□□□ -0.18
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nr3c2Q8VII8 978 aa13.91□□□□□ -0.18
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pla2g12bQ99P27 195 aa13.91□□□□□ -0.18
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm14525B1AZA0 212 aa13.9□□□□□ -0.18
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm2012B1B0R1 212 aa13.9□□□□□ -0.18
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm14819Q62478 212 aa13.9□□□□□ -0.18
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Col23a1Q8K4G2 532 aa13.9□□□□□ -0.18
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm6657A0A1B0GRJ3 277 aa13.9□□□□□ -0.18
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slc7a1Q09143 622 aa13.9□□□□□ -0.18
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cyp11b1Q3TG86 501 aa13.9□□□□□ -0.18
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Acot5Q6Q2Z6 421 aa13.9□□□□□ -0.18
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Trim9Q8C7M3 817 aa13.9□□□□□ -0.18
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ribc1Q9D0B8 379 aa13.9□□□□□ -0.18
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Wdr64Q9D565 1086 aa13.9□□□□□ -0.18
Pkp1-201ENSMUST00000027667 SynrgQ5SV85 1306 aa13.9□□□□□ -0.18
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Lrch2Q3UMG5 773 aa13.9□□□□□ -0.18
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Elp3Q9CZX0 547 aa13.9□□□□□ -0.18
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Abcb5B5X0E4 1255 aa13.9□□□□□ -0.19
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gad1P48318 593 aa13.9□□□□□ -0.19
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Foxn3Q499D0 457 aa13.9□□□□□ -0.19
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Thrap3Q569Z6 951 aaKnown RBP13.9□□□□□ -0.19
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tsga10Q6NY15 697 aa13.9□□□□□ -0.19
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Kctd3Q8BFX3 815 aa13.9□□□□□ -0.19
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Wdr3Q8BHB4 942 aaKnown RBP13.9□□□□□ -0.19
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ttc38A3KMP2 465 aa13.89□□□□□ -0.19
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Kcnh2O35219 1162 aa13.89□□□□□ -0.19
Pkp1-201ENSMUST00000027667 VimP20152 466 aaKnown RBP13.89□□□□□ -0.19
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Bace1P56818 501 aa13.89□□□□□ -0.19
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Anks1aP59672 1150 aa13.89□□□□□ -0.19
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ppp2r5eQ61151 467 aa13.89□□□□□ -0.19
Pkp1-201ENSMUST00000027667 MmeQ61391 750 aa13.89□□□□□ -0.19
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ints4Q8CIM8 964 aa13.89□□□□□ -0.19
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Alg3Q8K2A8 438 aa13.89□□□□□ -0.19
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tgs1Q923W1 853 aa13.89□□□□□ -0.19
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vwa5aQ99KC8 793 aaKnown RBP13.89□□□□□ -0.19
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Krtap5-3Q9D226 196 aa13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 31.9 ms