RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640586.1

HADH-222, Transcript of hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, human

TSL 5

Gene HADH, Length 3,308 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HADH-222	ENST00000640586	NFIX	Q14938	502 aa		10.66	□□□□□ -0.7
HADH-222	ENST00000640586	HERC4	Q5GLZ8	1057 aa	Predicted RBP	10.66	□□□□□ -0.7
HADH-222	ENST00000640586	PROCA1	Q8NCQ7	364 aa	Predicted RBP	10.66	□□□□□ -0.7
HADH-222	ENST00000640586	CAVIN3	Q969G5	261 aa		10.66	□□□□□ -0.7
HADH-222	ENST00000640586	RNPC3	Q96LT9	517 aa	Known RBP	10.66	□□□□□ -0.7
HADH-222	ENST00000640586	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		10.66	□□□□□ -0.7
HADH-222	ENST00000640586	PANK4	Q9NVE7	773 aa		10.66	□□□□□ -0.7
HADH-222	ENST00000640586	NPHP3-ACAD11	A0A0J9YXS1	232 aa		10.65	□□□□□ -0.7
HADH-222	ENST00000640586	SSU72P8	A0A1W2PR75	194 aa		10.65	□□□□□ -0.7
HADH-222	ENST00000640586	MPHOSPH10	O00566	681 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
HADH-222	ENST00000640586	COASY	Q13057	564 aa		10.65	□□□□□ -0.7
HADH-222	ENST00000640586	TCERG1L	Q5VWI1	586 aa		10.65	□□□□□ -0.7
HADH-222	ENST00000640586	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		10.65	□□□□□ -0.7
HADH-222	ENST00000640586	ANKS1A	Q92625	1134 aa		10.65	□□□□□ -0.7
HADH-222	ENST00000640586	SPAG5	Q96R06	1193 aa		10.65	□□□□□ -0.7
HADH-222	ENST00000640586	PACSIN1	Q9BY11	444 aa		10.65	□□□□□ -0.7
HADH-222	ENST00000640586	RIC8A	Q9NPQ8	531 aa		10.65	□□□□□ -0.7
HADH-222	ENST00000640586	CEP72	Q9P209	647 aa		10.65	□□□□□ -0.7
HADH-222	ENST00000640586		A6NNZ2	444 aa		10.65	□□□□□ -0.7
HADH-222	ENST00000640586	UFL1	O94874	794 aa		10.65	□□□□□ -0.7
HADH-222	ENST00000640586	SLC16A2	P36021	539 aa		10.65	□□□□□ -0.7
HADH-222	ENST00000640586	USP8	P40818	1118 aa		10.65	□□□□□ -0.7
HADH-222	ENST00000640586	TRADD	Q15628	312 aa		10.65	□□□□□ -0.7
HADH-222	ENST00000640586	ASIC2	Q16515	512 aa		10.65	□□□□□ -0.7
HADH-222	ENST00000640586	TUBB8	Q3ZCM7	444 aa		10.65	□□□□□ -0.7
HADH-222	ENST00000640586	LRRC55	Q6ZSA7	311 aa		10.65	□□□□□ -0.7
HADH-222	ENST00000640586	ZNF572	Q7Z3I7	529 aa	Predicted RBP	10.65	□□□□□ -0.7
HADH-222	ENST00000640586	PPAN	Q9NQ55	473 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
HADH-222	ENST00000640586	RNF14	Q9UBS8	474 aa		10.65	□□□□□ -0.7
HADH-222	ENST00000640586	ABCA3	Q99758	1704 aa		10.65	□□□□□ -0.7
HADH-222	ENST00000640586	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		10.65	□□□□□ -0.7
HADH-222	ENST00000640586	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.71
HADH-222	ENST00000640586		E7EVH7	732 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HADH-222	ENST00000640586	PJA2	O43164	708 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HADH-222	ENST00000640586	CEP104	O60308	925 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HADH-222	ENST00000640586	LCA5L	O95447	670 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HADH-222	ENST00000640586	EPB41	P11171	864 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
HADH-222	ENST00000640586	LSP1	P33241	339 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HADH-222	ENST00000640586	KCNMA1	Q12791	1236 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HADH-222	ENST00000640586	RPS6KA1	Q15418	735 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HADH-222	ENST00000640586	MICALCL	Q6ZW33	695 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HADH-222	ENST00000640586	GPATCH11	Q8N954	259 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HADH-222	ENST00000640586	NUCKS1	Q9H1E3	243 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
HADH-222	ENST00000640586	DDX25	Q9UHL0	483 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
HADH-222	ENST00000640586	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HADH-222	ENST00000640586		A0A087X0T9	212 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HADH-222	ENST00000640586	ZNF233	A6NK53	670 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HADH-222	ENST00000640586		E9PMD0	336 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HADH-222	ENST00000640586	FAM228B	P0C875	321 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HADH-222	ENST00000640586	SEC24C	P53992	1094 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HADH-222	ENST00000640586	DCAF17	Q5H9S7	520 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
HADH-222	ENST00000640586	HGSNAT	Q68CP4	663 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HADH-222	ENST00000640586	GPBP1	Q86WP2	473 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HADH-222	ENST00000640586	CASKIN2	Q8WXE0	1202 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HADH-222	ENST00000640586	KAT2B	Q92831	832 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HADH-222	ENST00000640586	FGFBP2	Q9BYJ0	223 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HADH-222	ENST00000640586	KIAA1024	Q9UPX6	916 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HADH-222	ENST00000640586	PLAA	Q9Y263	795 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HADH-222	ENST00000640586	FAM98C	Q17RN3	349 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
HADH-222	ENST00000640586	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
HADH-222	ENST00000640586	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
HADH-222	ENST00000640586	RAD51C	O43502	376 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HADH-222	ENST00000640586	SKOR1	P84550	965 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HADH-222	ENST00000640586	NAB2	Q15742	525 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HADH-222	ENST00000640586	SLC18A3	Q16572	532 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HADH-222	ENST00000640586	NEDD1	Q8NHV4	660 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HADH-222	ENST00000640586	AP1M1	Q9BXS5	423 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HADH-222	ENST00000640586	POTEB3	A0JP26	581 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HADH-222	ENST00000640586	POTEC	B2RU33	542 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HADH-222	ENST00000640586	TLR2	O60603	784 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HADH-222	ENST00000640586	CP	P00450	1065 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HADH-222	ENST00000640586	ACTN1	P12814	892 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HADH-222	ENST00000640586	GUCY2C	P25092	1073 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HADH-222	ENST00000640586	FXR2	P51116	673 aa	Known RBP eCLIP	10.63	□□□□□ -0.71
HADH-222	ENST00000640586	PSMD2	Q13200	908 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HADH-222	ENST00000640586	ASTE1	Q2TB18	679 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
HADH-222	ENST00000640586	COBLL1	Q53SF7	1204 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HADH-222	ENST00000640586	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HADH-222	ENST00000640586	POTEB	Q6S5H4	581 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HADH-222	ENST00000640586	CCDC65	Q8IXS2	484 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HADH-222	ENST00000640586	PROM2	Q8N271	834 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HADH-222	ENST00000640586	UBLCP1	Q8WVY7	318 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
HADH-222	ENST00000640586	EDEM3	Q9BZQ6	932 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HADH-222	ENST00000640586	GDF3	Q9NR23	364 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HADH-222	ENST00000640586	PCDHA12	Q9UN75	941 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HADH-222	ENST00000640586	PHLPP1	O60346	1717 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HADH-222	ENST00000640586	ABCB11	O95342	1321 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HADH-222	ENST00000640586	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HADH-222	ENST00000640586	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
HADH-222	ENST00000640586	PPP1R37	O75864	691 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HADH-222	ENST00000640586	MYZAP	P0CAP1	466 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HADH-222	ENST00000640586	HNRNPH1	P31943	449 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
HADH-222	ENST00000640586	ADAM9	Q13443	819 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HADH-222	ENST00000640586	ECM1	Q16610	540 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HADH-222	ENST00000640586	FAM182B	Q5T319	152 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HADH-222	ENST00000640586	MCTP2	Q6DN12	878 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HADH-222	ENST00000640586	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HADH-222	ENST00000640586	IQCK	Q8N0W5	287 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HADH-222	ENST00000640586	OR2W6P	Q8NHA6	318 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HADH-222	ENST00000640586	WHAMM	Q8TF30	809 aa		10.63	□□□□□ -0.71

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