RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579816.1

ASIC2-204, Transcript of acid sensing ion channel subunit 2, human

TSL 4

Gene ASIC2, Length 559 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ASIC2-204	ENST00000579816	PTPN11	Q06124	597 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
ASIC2-204	ENST00000579816	SSRP1	Q08945	709 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
ASIC2-204	ENST00000579816	TMEM31	Q5JXX7	168 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ASIC2-204	ENST00000579816	KRT40	Q6A162	431 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ASIC2-204	ENST00000579816	MCTP1	Q6DN14	999 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ASIC2-204	ENST00000579816	SLC30A10	Q6XR72	485 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ASIC2-204	ENST00000579816	RNF207	Q6ZRF8	634 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ASIC2-204	ENST00000579816	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ASIC2-204	ENST00000579816	DGKH	Q86XP1	1220 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ASIC2-204	ENST00000579816	TRIM22	Q8IYM9	498 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ASIC2-204	ENST00000579816	CTCFL	Q8NI51	663 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
ASIC2-204	ENST00000579816	WASF1	Q92558	559 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ASIC2-204	ENST00000579816	GPCPD1	Q9NPB8	672 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ASIC2-204	ENST00000579816	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
ASIC2-204	ENST00000579816	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
ASIC2-204	ENST00000579816	TANC1	Q9C0D5	1861 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ASIC2-204	ENST00000579816	EPOP	A6NHQ4	379 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ASIC2-204	ENST00000579816	IQCF3	P0C7M6	154 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ASIC2-204	ENST00000579816	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
ASIC2-204	ENST00000579816	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
ASIC2-204	ENST00000579816	TTBK2	Q6IQ55	1244 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ASIC2-204	ENST00000579816	FANCB	Q8NB91	859 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ASIC2-204	ENST00000579816	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ASIC2-204	ENST00000579816	VWCE	Q96DN2	955 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ASIC2-204	ENST00000579816	IL17RB	Q9NRM6	502 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ASIC2-204	ENST00000579816	MTMR6	Q9Y217	621 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ASIC2-204	ENST00000579816	NID2	Q14112	1375 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ASIC2-204	ENST00000579816	MYH15	Q9Y2K3	1946 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ASIC2-204	ENST00000579816	LCT	P09848	1927 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ASIC2-204	ENST00000579816	SCN5A	Q14524	2016 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ASIC2-204	ENST00000579816	RBM47	A0AV96	593 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
ASIC2-204	ENST00000579816	TOP1	P11387	765 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
ASIC2-204	ENST00000579816	CDC27	P30260	824 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ASIC2-204	ENST00000579816	KIF5B	P33176	963 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ASIC2-204	ENST00000579816	GRB10	Q13322	594 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ASIC2-204	ENST00000579816	TRIM29	Q14134	588 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ASIC2-204	ENST00000579816	PTGIS	Q16647	500 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ASIC2-204	ENST00000579816	CAGE1	Q8TC20	777 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ASIC2-204	ENST00000579816	AFAP1L1	Q8TED9	768 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ASIC2-204	ENST00000579816	ANKS1A	Q92625	1134 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ASIC2-204	ENST00000579816	C8orf76	Q96K31	380 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ASIC2-204	ENST00000579816	LRFN3	Q9BTN0	628 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ASIC2-204	ENST00000579816	SLC26A6	Q9BXS9	759 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ASIC2-204	ENST00000579816	TRANK1	O15050	2925 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ASIC2-204	ENST00000579816	PPFIA3	O75145	1194 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ASIC2-204	ENST00000579816	IFNAR1	P17181	557 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ASIC2-204	ENST00000579816	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
ASIC2-204	ENST00000579816	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ASIC2-204	ENST00000579816	FOXD4L6	Q3SYB3	417 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
ASIC2-204	ENST00000579816	BTNL9	Q6UXG8	535 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ASIC2-204	ENST00000579816	FOXD4L3	Q6VB84	417 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
ASIC2-204	ENST00000579816	PNMA1	Q8ND90	353 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ASIC2-204	ENST00000579816	DNER	Q8NFT8	737 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ASIC2-204	ENST00000579816	GDPD5	Q8WTR4	605 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ASIC2-204	ENST00000579816	COPS5	Q92905	334 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ASIC2-204	ENST00000579816	ALG1	Q9BT22	464 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ASIC2-204	ENST00000579816	EPHX3	Q9H6B9	360 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ASIC2-204	ENST00000579816	STK36	Q9NRP7	1315 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ASIC2-204	ENST00000579816	COL4A4	P53420	1690 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
ASIC2-204	ENST00000579816	REV3L	O60673	3130 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ASIC2-204	ENST00000579816		A6NJR5	290 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ASIC2-204	ENST00000579816	ARHGEF15	O94989	841 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ASIC2-204	ENST00000579816	GNAQ	P50148	359 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ASIC2-204	ENST00000579816	WDR5	P61964	334 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
ASIC2-204	ENST00000579816	RPS6	P62753	249 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
ASIC2-204	ENST00000579816	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
ASIC2-204	ENST00000579816	USH1G	Q495M9	461 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ASIC2-204	ENST00000579816	LRRC8D	Q7L1W4	858 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ASIC2-204	ENST00000579816	FERMT3	Q86UX7	667 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ASIC2-204	ENST00000579816	TMEM47	Q9BQJ4	181 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ASIC2-204	ENST00000579816	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
ASIC2-204	ENST00000579816	FAM217B	Q9NTX9	383 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
ASIC2-204	ENST00000579816	MTUS1	Q9ULD2	1270 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ASIC2-204	ENST00000579816	ARIH1	Q9Y4X5	557 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
ASIC2-204	ENST00000579816	NCOR1	O75376	2440 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ASIC2-204	ENST00000579816	DEXI	O95424	95 aa		13.5	□□□□□ -0.25
ASIC2-204	ENST00000579816	PARN	O95453	639 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
ASIC2-204	ENST00000579816	FDPS	P14324	419 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
ASIC2-204	ENST00000579816	SELP	P16109	830 aa		13.5	□□□□□ -0.25
ASIC2-204	ENST00000579816	XBP1	P17861	261 aa		13.5	□□□□□ -0.25
ASIC2-204	ENST00000579816	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
ASIC2-204	ENST00000579816	NTRK3	Q16288	839 aa		13.5	□□□□□ -0.25
ASIC2-204	ENST00000579816	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		13.5	□□□□□ -0.25
ASIC2-204	ENST00000579816	CLEC4D	Q8WXI8	215 aa		13.5	□□□□□ -0.25
ASIC2-204	ENST00000579816	PHKB	Q93100	1093 aa		13.5	□□□□□ -0.25
ASIC2-204	ENST00000579816	MAP3K14	Q99558	947 aa		13.5	□□□□□ -0.25
ASIC2-204	ENST00000579816	LMCD1	Q9NZU5	365 aa		13.5	□□□□□ -0.25
ASIC2-204	ENST00000579816	SCN10A	Q9Y5Y9	1956 aa		13.5	□□□□□ -0.25
ASIC2-204	ENST00000579816	XIRP2	A4UGR9	3374 aa		13.5	□□□□□ -0.25
ASIC2-204	ENST00000579816	PRRC2B	Q5JSZ5	2229 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
ASIC2-204	ENST00000579816	LCHN	A4D1U4	455 aa		13.49	□□□□□ -0.25
ASIC2-204	ENST00000579816	FAM86C2P	A6NEL3	165 aa		13.49	□□□□□ -0.25
ASIC2-204	ENST00000579816	EFCAB14	O75071	495 aa		13.49	□□□□□ -0.25
ASIC2-204	ENST00000579816	GH1	P01241	217 aa		13.49	□□□□□ -0.25
ASIC2-204	ENST00000579816	EDNRB	P24530	442 aa		13.49	□□□□□ -0.25
ASIC2-204	ENST00000579816	KRT85	P78386	507 aa		13.49	□□□□□ -0.25
ASIC2-204	ENST00000579816	GUCY1B3	Q02153	619 aa		13.49	□□□□□ -0.25
ASIC2-204	ENST00000579816	TROAP	Q12815	778 aa		13.49	□□□□□ -0.25
ASIC2-204	ENST00000579816	SEPT14	Q6ZU15	432 aa		13.49	□□□□□ -0.25
ASIC2-204	ENST00000579816	CCDC82	Q8N4S0	544 aa		13.49	□□□□□ -0.25

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.4 ms