RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575194.5

SPNS3-204, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SPNS3, Length 1,721 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-204ENST00000575194 SPIRE1Q08AE8 756 aa20.81■□□□□ 0.92
SPNS3-204ENST00000575194 ECM1Q16610 540 aa20.81■□□□□ 0.92
SPNS3-204ENST00000575194 NCAPH2Q6IBW4 605 aa20.81■□□□□ 0.92
SPNS3-204ENST00000575194 MOB2Q70IA6 237 aa20.81■□□□□ 0.92
SPNS3-204ENST00000575194 MB21D1Q8N884 522 aa20.81■□□□□ 0.92
SPNS3-204ENST00000575194 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
SPNS3-204ENST00000575194 GJA10Q969M2 543 aa20.81■□□□□ 0.92
SPNS3-204ENST00000575194 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
SPNS3-204ENST00000575194 OTOFQ9HC10 1997 aa20.81■□□□□ 0.92
SPNS3-204ENST00000575194 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
SPNS3-204ENST00000575194 POTEB3A0JP26 581 aa20.81■□□□□ 0.92
SPNS3-204ENST00000575194 FAM86B1E9PN63 330 aa20.81■□□□□ 0.92
SPNS3-204ENST00000575194 GYPCP04921 128 aa20.81■□□□□ 0.92
SPNS3-204ENST00000575194 FAM86B2P0C5J1 330 aa20.81■□□□□ 0.92
SPNS3-204ENST00000575194 FECHP22830 423 aa20.81■□□□□ 0.92
SPNS3-204ENST00000575194 RPA1P27694 616 aa20.81■□□□□ 0.92
SPNS3-204ENST00000575194 IREB2P48200 963 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
SPNS3-204ENST00000575194 COASYQ13057 564 aa20.81■□□□□ 0.92
SPNS3-204ENST00000575194 POTEBQ6S5H4 581 aa20.81■□□□□ 0.92
SPNS3-204ENST00000575194 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa20.81■□□□□ 0.92
SPNS3-204ENST00000575194 PANK4Q9NVE7 773 aa20.81■□□□□ 0.92
SPNS3-204ENST00000575194 PNMA2Q9UL42 364 aa20.81■□□□□ 0.92
SPNS3-204ENST00000575194 MSH4O15457 936 aa20.8■□□□□ 0.92
SPNS3-204ENST00000575194 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP20.8■□□□□ 0.92
SPNS3-204ENST00000575194 CASP14P31944 242 aa20.8■□□□□ 0.92
SPNS3-204ENST00000575194 GPBP1Q86WP2 473 aa20.8■□□□□ 0.92
SPNS3-204ENST00000575194 DNAJC19Q96DA6 116 aa20.8■□□□□ 0.92
SPNS3-204ENST00000575194 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa20.8■□□□□ 0.92
SPNS3-204ENST00000575194 TRPM7Q96QT4 1865 aa20.8■□□□□ 0.92
SPNS3-204ENST00000575194 PES1O00541 588 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
SPNS3-204ENST00000575194 ICAM1P05362 532 aa20.79■□□□□ 0.92
SPNS3-204ENST00000575194 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
SPNS3-204ENST00000575194 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
SPNS3-204ENST00000575194 PTPRAP18433 802 aa20.79■□□□□ 0.92
SPNS3-204ENST00000575194 STAT3P40763 770 aa20.79■□□□□ 0.92
SPNS3-204ENST00000575194 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
SPNS3-204ENST00000575194 VGLL4Q14135 290 aa20.79■□□□□ 0.92
SPNS3-204ENST00000575194 FAM26FQ5R3K3 315 aa20.79■□□□□ 0.92
SPNS3-204ENST00000575194 LDLRAD1Q5T700 205 aa20.79■□□□□ 0.92
SPNS3-204ENST00000575194 CST9Q5W186 159 aa20.79■□□□□ 0.92
SPNS3-204ENST00000575194 ARMC9Q7Z3E5 817 aa20.79■□□□□ 0.92
SPNS3-204ENST00000575194 MYOCDQ8IZQ8 938 aa20.79■□□□□ 0.92
SPNS3-204ENST00000575194 CPLX3Q8WVH0 158 aa20.79■□□□□ 0.92
SPNS3-204ENST00000575194 IQCDQ96DY2 449 aa20.79■□□□□ 0.92
SPNS3-204ENST00000575194 SLF1Q9BQI6 1058 aa20.79■□□□□ 0.92
SPNS3-204ENST00000575194 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
SPNS3-204ENST00000575194 VAV3Q9UKW4 847 aa20.79■□□□□ 0.92
SPNS3-204ENST00000575194 DNM3Q9UQ16 869 aa20.79■□□□□ 0.92
SPNS3-204ENST00000575194 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa20.79■□□□□ 0.92
SPNS3-204ENST00000575194 E9PMD0 336 aa20.78■□□□□ 0.92
SPNS3-204ENST00000575194 MED24O75448 989 aa20.78■□□□□ 0.92
SPNS3-204ENST00000575194 KRT18P05783 430 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
SPNS3-204ENST00000575194 FKBP1BP68106 108 aa20.78■□□□□ 0.92
SPNS3-204ENST00000575194 SETQ01105 290 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
SPNS3-204ENST00000575194 TMTC1Q8IUR5 882 aa20.78■□□□□ 0.92
SPNS3-204ENST00000575194 REXO1L1PQ8IX06 675 aa20.78■□□□□ 0.92
SPNS3-204ENST00000575194 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa20.78■□□□□ 0.92
SPNS3-204ENST00000575194 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
SPNS3-204ENST00000575194 ZNF507Q8TCN5 953 aa20.78■□□□□ 0.92
SPNS3-204ENST00000575194 NUP58Q9BVL2 599 aa20.78■□□□□ 0.92
SPNS3-204ENST00000575194 SEMA6BQ9H3T3 888 aa20.78■□□□□ 0.92
SPNS3-204ENST00000575194 ZNF408Q9H9D4 720 aa20.78■□□□□ 0.92
SPNS3-204ENST00000575194 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa20.78■□□□□ 0.92
SPNS3-204ENST00000575194 PHIPQ8WWQ0 1821 aa20.78■□□□□ 0.92
SPNS3-204ENST00000575194 PASKQ96RG2 1323 aa20.78■□□□□ 0.92
SPNS3-204ENST00000575194 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa20.78■□□□□ 0.92
SPNS3-204ENST00000575194 TOMM70O94826 608 aa20.78■□□□□ 0.92
SPNS3-204ENST00000575194 CELF2O95319 508 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
SPNS3-204ENST00000575194 CCDC175P0C221 793 aa20.78■□□□□ 0.92
SPNS3-204ENST00000575194 ETF1P62495 437 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
SPNS3-204ENST00000575194 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
SPNS3-204ENST00000575194 FKBP15Q5T1M5 1219 aa20.78■□□□□ 0.92
SPNS3-204ENST00000575194 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
SPNS3-204ENST00000575194 RETREG2Q8NC44 543 aa20.78■□□□□ 0.92
SPNS3-204ENST00000575194 HPS3Q969F9 1004 aa20.78■□□□□ 0.92
SPNS3-204ENST00000575194 PICK1Q9NRD5 415 aa20.78■□□□□ 0.92
SPNS3-204ENST00000575194 ABHD10Q9NUJ1 306 aa20.78■□□□□ 0.92
SPNS3-204ENST00000575194 CCPG1Q9ULG6 757 aa20.78■□□□□ 0.92
SPNS3-204ENST00000575194 UNCXA6NJT0 531 aa20.77■□□□□ 0.92
SPNS3-204ENST00000575194 CTIFO43310 598 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
SPNS3-204ENST00000575194 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP20.77■□□□□ 0.92
SPNS3-204ENST00000575194 USP14P54578 494 aa20.77■□□□□ 0.92
SPNS3-204ENST00000575194 SYCP1Q15431 976 aa20.77■□□□□ 0.92
SPNS3-204ENST00000575194 MCF2L2Q86YR7 1114 aa20.77■□□□□ 0.92
SPNS3-204ENST00000575194 SAMD3Q8N6K7 520 aa20.77■□□□□ 0.92
SPNS3-204ENST00000575194 SMC1BQ8NDV3 1235 aa20.77■□□□□ 0.92
SPNS3-204ENST00000575194 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
SPNS3-204ENST00000575194 POTEFA5A3E0 1075 aa20.76■□□□□ 0.91
SPNS3-204ENST00000575194 CYP11B2P19099 503 aa20.76■□□□□ 0.91
SPNS3-204ENST00000575194 SLC12A3P55017 1021 aa20.76■□□□□ 0.91
SPNS3-204ENST00000575194 POTEGQ6S5H5 508 aa20.76■□□□□ 0.91
SPNS3-204ENST00000575194 POTEEQ6S8J3 1075 aa20.76■□□□□ 0.91
SPNS3-204ENST00000575194 CYP26C1Q6V0L0 522 aa20.76■□□□□ 0.91
SPNS3-204ENST00000575194 CATSPER3Q86XQ3 398 aa20.76■□□□□ 0.91
SPNS3-204ENST00000575194 CLMNQ96JQ2 1002 aa20.76■□□□□ 0.91
SPNS3-204ENST00000575194 WDR18Q9BV38 432 aa20.76■□□□□ 0.91
SPNS3-204ENST00000575194 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
SPNS3-204ENST00000575194 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
SPNS3-204ENST00000575194 FBXO28Q9NVF7 368 aa20.76■□□□□ 0.91
SPNS3-204ENST00000575194 CSADQ9Y600 493 aa20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms