RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559357.5

USP3-AS1-202, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene USP3-AS1, Length 455 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-202ENST00000559357 RRP1P56182 461 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 OLFML2BQ68BL8 750 aa7.02□□□□□ -1.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 MCM10Q7L590 875 aa7.02□□□□□ -1.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 TMEFF1Q8IYR6 380 aa7.02□□□□□ -1.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 SLC9A7Q96T83 725 aa7.02□□□□□ -1.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 NT5C1AQ9BXI3 368 aa7.02□□□□□ -1.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 PRR13Q9NZ81 148 aa7.02□□□□□ -1.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 CPDO75976 1380 aa7.02□□□□□ -1.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 MAP3K5Q99683 1374 aa7.01□□□□□ -1.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 MEIS1O00470 390 aa7.01□□□□□ -1.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 PLIN1O60240 522 aa7.01□□□□□ -1.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 VAV1P15498 845 aa7.01□□□□□ -1.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 MCM4P33991 863 aa7.01□□□□□ -1.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 LAPTM5Q13571 262 aa7.01□□□□□ -1.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 AUHQ13825 339 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 MZB1Q8WU39 189 aa7.01□□□□□ -1.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa7.01□□□□□ -1.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 ACSL6Q9UKU0 697 aa7.01□□□□□ -1.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 JAG2Q9Y219 1238 aa7.01□□□□□ -1.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 WNK3Q9BYP7 1800 aa7.01□□□□□ -1.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 PKD1L3Q7Z443 1732 aa7.01□□□□□ -1.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 MEGF6O75095 1541 aa7.01□□□□□ -1.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 NCAPD2Q15021 1401 aa7.01□□□□□ -1.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 IL16Q14005 1332 aa7.01□□□□□ -1.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 A0A1W2PQY0 241 aa7□□□□□ -1.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 MPOP05164 745 aa7□□□□□ -1.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 PRKCAP17252 672 aa7□□□□□ -1.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 EVA1CP58658 441 aa7□□□□□ -1.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 CRTC3Q6UUV7 619 aa7□□□□□ -1.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa7□□□□□ -1.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 IGDCC3Q8IVU1 814 aa7□□□□□ -1.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 TMEM52Q8NDY8 209 aa7□□□□□ -1.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa7□□□□□ -1.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 NKD1Q969G9 470 aa7□□□□□ -1.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 CDADC1Q9BWV3 514 aa7□□□□□ -1.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 BCL2L13Q9BXK5 485 aa7□□□□□ -1.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 XYLT2Q9H1B5 865 aa7□□□□□ -1.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 RTEL1Q9NZ71 1219 aa7□□□□□ -1.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 FBXL21Q9UKT6 434 aa7□□□□□ -1.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 NRAPQ86VF7 1730 aa7□□□□□ -1.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 SHANK3Q9BYB0 1731 aa6.99□□□□□ -1.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 SHOXO15266 292 aa6.99□□□□□ -1.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 BCAR3O75815 825 aa6.99□□□□□ -1.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 ACRP10323 421 aa6.99□□□□□ -1.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 CANXP27824 592 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 ARL4AP40617 200 aa6.99□□□□□ -1.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 GNAI1P63096 354 aa6.99□□□□□ -1.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 C1orf141Q5JVX7 400 aa6.99□□□□□ -1.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 RTP2Q5QGT7 225 aa6.99□□□□□ -1.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 TMC6Q7Z403 805 aa6.99□□□□□ -1.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 LDHDQ86WU2 507 aa6.99□□□□□ -1.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 AP5S1Q9NUS5 200 aa6.99□□□□□ -1.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 IFT57Q9NWB7 429 aa6.99□□□□□ -1.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 SCN11AQ9UI33 1791 aa6.99□□□□□ -1.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 RNF123Q5XPI4 1314 aa6.99□□□□□ -1.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 WDR17Q8IZU2 1322 aa6.99□□□□□ -1.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 KDM3BQ7LBC6 1761 aa6.98□□□□□ -1.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 CYP4F8P98187 520 aa6.98□□□□□ -1.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 NFIXQ14938 502 aa6.98□□□□□ -1.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 LDLRAD1Q5T700 205 aa6.98□□□□□ -1.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 FAM129CQ86XR2 697 aa6.98□□□□□ -1.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 NUP43Q8NFH3 380 aa6.98□□□□□ -1.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 GIPC2Q8TF65 315 aa6.98□□□□□ -1.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 JMJD8Q96S16 334 aa6.98□□□□□ -1.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 BTG4Q9NY30 223 aa6.98□□□□□ -1.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 MIS18AQ9NYP9 233 aa6.98□□□□□ -1.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 USP35Q9P2H5 1018 aa6.98□□□□□ -1.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 CRB1P82279 1406 aa6.98□□□□□ -1.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 C9IYK1 514 aa6.97□□□□□ -1.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 GSNP06396 782 aa6.97□□□□□ -1.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 RARSP54136 660 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 TMEM62Q0P6H9 643 aa6.97□□□□□ -1.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 RAB3GAP1Q15042 981 aa6.97□□□□□ -1.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 AMOTQ4VCS5 1084 aa6.97□□□□□ -1.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 CNKSR3Q6P9H4 555 aa6.97□□□□□ -1.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 C7orf61Q8IZ16 206 aa6.97□□□□□ -1.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 SMC4Q9NTJ3 1288 aa6.97□□□□□ -1.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 IMPACTQ9P2X3 320 aa6.97□□□□□ -1.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 TSPYL4Q9UJ04 414 aa6.97□□□□□ -1.29
USP3-AS1-202ENST00000559357 NWD2Q9ULI1 1742 aa6.97□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.8 ms