RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553309.5

ATXN3-218, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 1,022 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-218ENST00000553309 TEX2Q8IWB9 1127 aa7.36□□□□□ -1.23
ATXN3-218ENST00000553309 PPIL6Q8IXY8 311 aa7.36□□□□□ -1.23
ATXN3-218ENST00000553309 RCBTB1Q8NDN9 531 aa7.36□□□□□ -1.23
ATXN3-218ENST00000553309 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
ATXN3-218ENST00000553309 SGSM3Q96HU1 749 aa7.36□□□□□ -1.23
ATXN3-218ENST00000553309 BCAS3Q9H6U6 928 aa7.36□□□□□ -1.23
ATXN3-218ENST00000553309 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
ATXN3-218ENST00000553309 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa7.36□□□□□ -1.23
ATXN3-218ENST00000553309 MYO1BO43795 1136 aa7.35□□□□□ -1.23
ATXN3-218ENST00000553309 LTBRP36941 435 aa7.35□□□□□ -1.23
ATXN3-218ENST00000553309 BCL6P41182 706 aa7.35□□□□□ -1.23
ATXN3-218ENST00000553309 KCNAB2Q13303 367 aa7.35□□□□□ -1.23
ATXN3-218ENST00000553309 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
ATXN3-218ENST00000553309 WWC2Q6AWC2 1192 aa7.35□□□□□ -1.23
ATXN3-218ENST00000553309 CNKSR3Q6P9H4 555 aa7.35□□□□□ -1.23
ATXN3-218ENST00000553309 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa7.35□□□□□ -1.23
ATXN3-218ENST00000553309 KCTD13Q8WZ19 329 aa7.35□□□□□ -1.23
ATXN3-218ENST00000553309 ALG3Q92685 438 aa7.35□□□□□ -1.23
ATXN3-218ENST00000553309 IER2Q9BTL4 223 aa7.35□□□□□ -1.23
ATXN3-218ENST00000553309 SIT1Q9Y3P8 196 aa7.35□□□□□ -1.23
ATXN3-218ENST00000553309 MAP3K1Q13233 1512 aa7.35□□□□□ -1.23
ATXN3-218ENST00000553309 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa7.35□□□□□ -1.23
ATXN3-218ENST00000553309 LRP5O75197 1615 aa7.34□□□□□ -1.23
ATXN3-218ENST00000553309 ATP7AQ04656 1500 aa7.34□□□□□ -1.23
ATXN3-218ENST00000553309 KDM5DQ9BY66 1539 aa7.34□□□□□ -1.23
ATXN3-218ENST00000553309 ZBTB7AO95365 584 aa7.34□□□□□ -1.23
ATXN3-218ENST00000553309 NCAM1P13591 858 aa7.34□□□□□ -1.23
ATXN3-218ENST00000553309 LCP1P13796 627 aa7.34□□□□□ -1.23
ATXN3-218ENST00000553309 GTF2A2P52657 109 aa7.34□□□□□ -1.23
ATXN3-218ENST00000553309 SLC9A5Q14940 896 aa7.34□□□□□ -1.23
ATXN3-218ENST00000553309 TESK1Q15569 626 aa7.34□□□□□ -1.23
ATXN3-218ENST00000553309 FBLN7Q53RD9 439 aa7.34□□□□□ -1.23
ATXN3-218ENST00000553309 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa7.34□□□□□ -1.23
ATXN3-218ENST00000553309 TCERG1LQ5VWI1 586 aa7.34□□□□□ -1.23
ATXN3-218ENST00000553309 FAM129CQ86XR2 697 aa7.34□□□□□ -1.23
ATXN3-218ENST00000553309 TMEM151BQ8IW70 566 aa7.34□□□□□ -1.23
ATXN3-218ENST00000553309 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
ATXN3-218ENST00000553309 TSPAN17Q96FV3 270 aa7.34□□□□□ -1.23
ATXN3-218ENST00000553309 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
ATXN3-218ENST00000553309 C1orf159Q96HA4 380 aa7.34□□□□□ -1.23
ATXN3-218ENST00000553309 CHAMP1Q96JM3 812 aa7.34□□□□□ -1.23
ATXN3-218ENST00000553309 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa7.34□□□□□ -1.23
ATXN3-218ENST00000553309 PZPP20742 1482 aa7.34□□□□□ -1.23
ATXN3-218ENST00000553309 PREX2Q70Z35 1606 aa7.34□□□□□ -1.24
ATXN3-218ENST00000553309 SYCP2Q9BX26 1530 aa7.33□□□□□ -1.24
ATXN3-218ENST00000553309 NLRP1Q9C000 1473 aa7.33□□□□□ -1.24
ATXN3-218ENST00000553309 PRODHO43272 600 aa7.33□□□□□ -1.24
ATXN3-218ENST00000553309 DLX3O60479 287 aa7.33□□□□□ -1.24
ATXN3-218ENST00000553309 ASGR2P07307 311 aa7.33□□□□□ -1.24
ATXN3-218ENST00000553309 ATF2P15336 505 aa7.33□□□□□ -1.24
ATXN3-218ENST00000553309 FBLN1P23142 703 aa7.33□□□□□ -1.24
ATXN3-218ENST00000553309 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
ATXN3-218ENST00000553309 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
ATXN3-218ENST00000553309 RBL2Q08999 1139 aa7.33□□□□□ -1.24
ATXN3-218ENST00000553309 MAP4K2Q12851 820 aa7.33□□□□□ -1.24
ATXN3-218ENST00000553309 PWWP2AQ96N64 755 aa7.33□□□□□ -1.24
ATXN3-218ENST00000553309 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
ATXN3-218ENST00000553309 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
ATXN3-218ENST00000553309 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
ATXN3-218ENST00000553309 MIA2Q96PC5 1412 aa7.33□□□□□ -1.24
ATXN3-218ENST00000553309 CCDC85CA6NKD9 419 aa7.32□□□□□ -1.24
ATXN3-218ENST00000553309 PDPK1O15530 556 aa7.32□□□□□ -1.24
ATXN3-218ENST00000553309 FPR2P25090 351 aa7.32□□□□□ -1.24
ATXN3-218ENST00000553309 LIMS1P48059 325 aa7.32□□□□□ -1.24
ATXN3-218ENST00000553309 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
ATXN3-218ENST00000553309 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP7.32□□□□□ -1.24
ATXN3-218ENST00000553309 FOXO4P98177 505 aa7.32□□□□□ -1.24
ATXN3-218ENST00000553309 LSAMPQ13449 338 aa7.32□□□□□ -1.24
ATXN3-218ENST00000553309 NBPF6Q5VWK0 638 aa7.32□□□□□ -1.24
ATXN3-218ENST00000553309 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
ATXN3-218ENST00000553309 TMEM169Q96HH4 297 aa7.32□□□□□ -1.24
ATXN3-218ENST00000553309 NBPF4Q96M43 638 aa7.32□□□□□ -1.24
ATXN3-218ENST00000553309 RNF38Q9H0F5 515 aa7.32□□□□□ -1.24
ATXN3-218ENST00000553309 CCDC113Q9H0I3 377 aa7.32□□□□□ -1.24
ATXN3-218ENST00000553309 ARHGEF4Q9NR80 690 aa7.32□□□□□ -1.24
ATXN3-218ENST00000553309 SIRPGQ9P1W8 387 aa7.32□□□□□ -1.24
ATXN3-218ENST00000553309 MSRB2Q9Y3D2 182 aa7.32□□□□□ -1.24
ATXN3-218ENST00000553309 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
ATXN3-218ENST00000553309 SGSM2O43147 1006 aa7.31□□□□□ -1.24
ATXN3-218ENST00000553309 PMLP29590 882 aa7.31□□□□□ -1.24
ATXN3-218ENST00000553309 CLIP1P30622 1438 aa7.31□□□□□ -1.24
ATXN3-218ENST00000553309 MROH9Q5TGP6 573 aa7.31□□□□□ -1.24
ATXN3-218ENST00000553309 NSMFQ6X4W1 530 aa7.31□□□□□ -1.24
ATXN3-218ENST00000553309 FGD6Q6ZV73 1430 aa7.31□□□□□ -1.24
ATXN3-218ENST00000553309 USP53Q70EK8 1073 aa7.31□□□□□ -1.24
ATXN3-218ENST00000553309 SPATC1Q76KD6 591 aa7.31□□□□□ -1.24
ATXN3-218ENST00000553309 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
ATXN3-218ENST00000553309 NLGN1Q8N2Q7 840 aa7.31□□□□□ -1.24
ATXN3-218ENST00000553309 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
ATXN3-218ENST00000553309 ARMC5Q96C12 935 aa7.31□□□□□ -1.24
ATXN3-218ENST00000553309 AP5M1Q9H0R1 490 aa7.31□□□□□ -1.24
ATXN3-218ENST00000553309 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
ATXN3-218ENST00000553309 FAN1Q9Y2M0 1017 aa7.31□□□□□ -1.24
ATXN3-218ENST00000553309 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa7.31□□□□□ -1.24
ATXN3-218ENST00000553309 X6R8D5 127 aa7.31□□□□□ -1.24
ATXN3-218ENST00000553309 FGFR1P11362 822 aa7.3□□□□□ -1.24
ATXN3-218ENST00000553309 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
ATXN3-218ENST00000553309 MC3RP41968 323 aa7.3□□□□□ -1.24
ATXN3-218ENST00000553309 VMACQ2NL98 169 aa7.3□□□□□ -1.24
ATXN3-218ENST00000553309 RIOX2Q8IUF8 465 aa7.3□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.2 ms