RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547701.5

CTDSP2-203, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 988 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-203ENST00000547701 ATP9AO75110 1047 aa26.57■■□□□ 1.84
CTDSP2-203ENST00000547701 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP26.57■■□□□ 1.84
CTDSP2-203ENST00000547701 STK3Q13188 491 aa26.57■■□□□ 1.84
CTDSP2-203ENST00000547701 CYFIP1Q7L576 1253 aa26.57■■□□□ 1.84
CTDSP2-203ENST00000547701 GTF3C6Q969F1 213 aa26.57■■□□□ 1.84
CTDSP2-203ENST00000547701 C22orf23Q9BZE7 217 aa26.57■■□□□ 1.84
CTDSP2-203ENST00000547701 BCAS3Q9H6U6 928 aa26.57■■□□□ 1.84
CTDSP2-203ENST00000547701 TMEM260Q9NX78 707 aa26.57■■□□□ 1.84
CTDSP2-203ENST00000547701 CTDNEP1O95476 244 aa26.56■■□□□ 1.84
CTDSP2-203ENST00000547701 HOXC8P31273 242 aa26.56■■□□□ 1.84
CTDSP2-203ENST00000547701 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
CTDSP2-203ENST00000547701 TRPV6Q9H1D0 765 aa26.56■■□□□ 1.84
CTDSP2-203ENST00000547701 VPS54Q9P1Q0 977 aa26.56■■□□□ 1.84
CTDSP2-203ENST00000547701 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa26.56■■□□□ 1.84
CTDSP2-203ENST00000547701 PCDHA4Q9UN74 947 aa26.56■■□□□ 1.84
CTDSP2-203ENST00000547701 PSEN2P49810 448 aa26.55■■□□□ 1.84
CTDSP2-203ENST00000547701 USP11P51784 963 aa26.55■■□□□ 1.84
CTDSP2-203ENST00000547701 NPY5RQ15761 445 aa26.55■■□□□ 1.84
CTDSP2-203ENST00000547701 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa26.55■■□□□ 1.84
CTDSP2-203ENST00000547701 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa26.54■■□□□ 1.84
CTDSP2-203ENST00000547701 PITPNM1O00562 1244 aa26.54■■□□□ 1.84
CTDSP2-203ENST00000547701 NOP56O00567 594 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
CTDSP2-203ENST00000547701 ADAMTS3O15072 1205 aa26.54■■□□□ 1.84
CTDSP2-203ENST00000547701 LGALS2P05162 132 aa26.54■■□□□ 1.84
CTDSP2-203ENST00000547701 RBL2Q08999 1139 aa26.54■■□□□ 1.84
CTDSP2-203ENST00000547701 MFSD10Q14728 455 aa26.54■■□□□ 1.84
CTDSP2-203ENST00000547701 GPR153Q6NV75 609 aa26.54■■□□□ 1.84
CTDSP2-203ENST00000547701 CYP2W1Q8TAV3 490 aa26.54■■□□□ 1.84
CTDSP2-203ENST00000547701 H3BRB1 525 aa26.53■■□□□ 1.84
CTDSP2-203ENST00000547701 NLRP5P59047 1200 aa26.53■■□□□ 1.84
CTDSP2-203ENST00000547701 FPGSQ05932 587 aa26.53■■□□□ 1.84
CTDSP2-203ENST00000547701 KIAA0753Q2KHM9 967 aa26.53■■□□□ 1.84
CTDSP2-203ENST00000547701 TMEM199Q8N511 208 aa26.53■■□□□ 1.84
CTDSP2-203ENST00000547701 WASF1Q92558 559 aa26.53■■□□□ 1.84
CTDSP2-203ENST00000547701 PGBD1Q96JS3 809 aa26.53■■□□□ 1.84
CTDSP2-203ENST00000547701 CTAGE1Q96RT6 745 aa26.53■■□□□ 1.84
CTDSP2-203ENST00000547701 HIPK3Q9H422 1215 aa26.53■■□□□ 1.84
CTDSP2-203ENST00000547701 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
CTDSP2-203ENST00000547701 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
CTDSP2-203ENST00000547701 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa26.53■■□□□ 1.84
CTDSP2-203ENST00000547701 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
CTDSP2-203ENST00000547701 KAT6AQ92794 2004 aa26.53■■□□□ 1.84
CTDSP2-203ENST00000547701 SETQ01105 290 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
CTDSP2-203ENST00000547701 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP26.52■■□□□ 1.843e-7■■■□□ 15.8
CTDSP2-203ENST00000547701 SEPT1Q8WYJ6 367 aa26.52■■□□□ 1.84
CTDSP2-203ENST00000547701 PHF20Q9BVI0 1012 aa26.52■■□□□ 1.84
CTDSP2-203ENST00000547701 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
CTDSP2-203ENST00000547701 FAM86B1E9PN63 330 aa26.51■■□□□ 1.83
CTDSP2-203ENST00000547701 EDIL3O43854 480 aa26.51■■□□□ 1.83
CTDSP2-203ENST00000547701 PPFIA3O75145 1194 aa26.51■■□□□ 1.83
CTDSP2-203ENST00000547701 ATG7O95352 703 aa26.51■■□□□ 1.83
CTDSP2-203ENST00000547701 FAM86B2P0C5J1 330 aa26.51■■□□□ 1.83
CTDSP2-203ENST00000547701 FDPSP14324 419 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
CTDSP2-203ENST00000547701 XBP1P17861 261 aa26.51■■□□□ 1.83
CTDSP2-203ENST00000547701 BLIDQ8IZY5 108 aa26.51■■□□□ 1.83
CTDSP2-203ENST00000547701 HDAC6Q9UBN7 1215 aa26.51■■□□□ 1.83
CTDSP2-203ENST00000547701 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa26.5■■□□□ 1.83
CTDSP2-203ENST00000547701 LARGE1O95461 756 aa26.5■■□□□ 1.83
CTDSP2-203ENST00000547701 ZNF286BP0CG31 522 aa26.5■■□□□ 1.83
CTDSP2-203ENST00000547701 ARP10275 920 aa26.5■■□□□ 1.83
CTDSP2-203ENST00000547701 FAM47CQ5HY64 1035 aa26.5■■□□□ 1.83
CTDSP2-203ENST00000547701 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
CTDSP2-203ENST00000547701 MOXD1Q6UVY6 613 aa26.5■■□□□ 1.83
CTDSP2-203ENST00000547701 C7orf31Q8N865 590 aa26.5■■□□□ 1.83
CTDSP2-203ENST00000547701 CAGE1Q8TC20 777 aa26.5■■□□□ 1.83
CTDSP2-203ENST00000547701 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
CTDSP2-203ENST00000547701 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
CTDSP2-203ENST00000547701 SLC9A2Q9UBY0 812 aa26.5■■□□□ 1.83
CTDSP2-203ENST00000547701 SZT2Q5T011 3432 aa26.49■■□□□ 1.83
CTDSP2-203ENST00000547701 EMSYQ7Z589 1322 aa26.49■■□□□ 1.83
CTDSP2-203ENST00000547701 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa26.49■■□□□ 1.83
CTDSP2-203ENST00000547701 LGR5O75473 907 aa26.49■■□□□ 1.83
CTDSP2-203ENST00000547701 CYP3A7P24462 503 aa26.49■■□□□ 1.83
CTDSP2-203ENST00000547701 PTGISQ16647 500 aa26.49■■□□□ 1.83
CTDSP2-203ENST00000547701 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
CTDSP2-203ENST00000547701 AIFM3Q96NN9 605 aa26.49■■□□□ 1.83
CTDSP2-203ENST00000547701 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
CTDSP2-203ENST00000547701 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
CTDSP2-203ENST00000547701 DHX15O43143 795 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
CTDSP2-203ENST00000547701 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
CTDSP2-203ENST00000547701 ZNF76P36508 570 aa26.48■■□□□ 1.83
CTDSP2-203ENST00000547701 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
CTDSP2-203ENST00000547701 BFSP2Q13515 415 aa26.48■■□□□ 1.83
CTDSP2-203ENST00000547701 SDF4Q9BRK5 362 aa26.48■■□□□ 1.83
CTDSP2-203ENST00000547701 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
CTDSP2-203ENST00000547701 WNT8AQ9H1J5 351 aa26.48■■□□□ 1.83
CTDSP2-203ENST00000547701 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
CTDSP2-203ENST00000547701 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
CTDSP2-203ENST00000547701 PARNO95453 639 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
CTDSP2-203ENST00000547701 PFKMP08237 780 aa26.47■■□□□ 1.83
CTDSP2-203ENST00000547701 CYP2C18P33260 490 aa26.47■■□□□ 1.83
CTDSP2-203ENST00000547701 RFC2P35250 354 aa26.47■■□□□ 1.83
CTDSP2-203ENST00000547701 EPHB4P54760 987 aa26.47■■□□□ 1.83
CTDSP2-203ENST00000547701 ADAM17P78536 824 aa26.47■■□□□ 1.83
CTDSP2-203ENST00000547701 PTK7Q13308 1070 aa26.47■■□□□ 1.83
CTDSP2-203ENST00000547701 RABEP1Q15276 862 aa26.47■■□□□ 1.83
CTDSP2-203ENST00000547701 SHHQ15465 462 aa26.47■■□□□ 1.83
CTDSP2-203ENST00000547701 RASIP1Q5U651 963 aa26.47■■□□□ 1.83
CTDSP2-203ENST00000547701 C16orf59Q7L2K0 433 aa26.47■■□□□ 1.83
CTDSP2-203ENST00000547701 PLA2G4DQ86XP0 818 aa26.47■■□□□ 1.83
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