RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515746.5

ATXN3-212, Transcript of ataxin 3, human

TSL 5

Gene ATXN3, Length 619 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-212	ENST00000515746	ANKRD40	Q6AI12	368 aa		5.52	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	GALNT17	Q6IS24	598 aa		5.52	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	CNNM4	Q6P4Q7	775 aa		5.52	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	EMB	Q6PCB8	327 aa		5.52	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	FOXR2	Q6PJQ5	311 aa		5.52	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	DTHD1	Q6ZMT9	781 aa		5.52	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		5.52	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	TADA2B	Q86TJ2	420 aa		5.52	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	IQCA1	Q86XH1	822 aa		5.52	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	CSGALNACT2	Q8N6G5	542 aa		5.52	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	GOLGA6L1	Q8N7Z2	621 aa		5.52	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	PLPP7	Q8NBV4	271 aa		5.52	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	TSEN2	Q8NCE0	465 aa	Known RBP	5.52	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	C1orf131	Q8NDD1	294 aa	Known RBP	5.52	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	SPATA4	Q8NEY3	305 aa		5.52	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	TRIM58	Q8NG06	486 aa		5.52	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	HDAC7	Q8WUI4	952 aa		5.52	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	SECISBP2L	Q93073	1101 aa	Known RBP	5.52	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	ZBTB9	Q96C00	473 aa		5.52	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	CAPZA3	Q96KX2	299 aa		5.52	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	TRIM47	Q96LD4	638 aa		5.52	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	CNOT6L	Q96LI5	555 aa	Known RBP	5.52	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	AK8	Q96MA6	479 aa		5.52	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		5.52	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	EDEM3	Q9BZQ6	932 aa		5.52	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	SH2D4A	Q9H788	454 aa		5.52	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		5.52	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNHIT6	Q9NWK9	470 aa	Known RBP	5.52	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	TOR4A	Q9NXH8	423 aa		5.52	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	GOLGA6A	Q9NYA3	693 aa		5.52	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	MAGEC2	Q9UBF1	373 aa	Predicted RBP	5.52	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	LRWD1	Q9UFC0	647 aa		5.52	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	DMGDH	Q9UI17	866 aa	Known RBP	5.52	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	PCDHA6	Q9UN73	950 aa		5.52	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	PLAGL2	Q9UPG8	496 aa		5.52	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	PCDHA8	Q9Y5H6	950 aa		5.52	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	PCDHA13	Q9Y5I0	950 aa		5.52	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	WASF2	Q9Y6W5	498 aa		5.52	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	SCN7A	Q01118	1682 aa		5.51	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	BICDL2	A1A5D9	508 aa		5.51	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	5.51	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	SRRM3	A6NNA2	597 aa	Predicted RBP	5.51	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	RBAK-RBAKDN	I3L0D1	243 aa		5.51	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746		J3QL48	77 aa		5.51	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	ERVH48-1	M5A8F1	160 aa		5.51	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	STXBP3	O00186	592 aa		5.51	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	EPHB6	O15197	1021 aa		5.51	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	ZEB2	O60315	1214 aa		5.51	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	TACC1	O75410	805 aa		5.51	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	ADAMTS2	O95450	1211 aa		5.51	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	PLEK	P08567	350 aa	Predicted RBP	5.51	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	MYB	P10242	640 aa		5.51	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	IDE	P14735	1019 aa		5.51	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	TCP1	P17987	556 aa	Known RBP	5.51	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	PLCG1	P19174	1290 aa		5.51	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	KIF5B	P33176	963 aa		5.51	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	EIF4A3	P38919	411 aa	Known RBP	5.51	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	5.51	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	PPP1R2	P41236	205 aa		5.51	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	GYG1	P46976	350 aa		5.51	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	FNTA	P49354	379 aa		5.51	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	DHX9	Q08211	1270 aa	Known RBP	5.51	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	TBC1D8B	Q0IIM8	1120 aa		5.51	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	KIF5A	Q12840	1032 aa		5.51	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	STK4	Q13043	487 aa		5.51	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	UBE4A	Q14139	1066 aa		5.51	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	GLE1	Q53GS7	698 aa	Known RBP	5.51	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	FAM47A	Q5JRC9	791 aa		5.51	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	CENPP	Q6IPU0	288 aa		5.51	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	MMS22L	Q6ZRQ5	1243 aa		5.51	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	LRRC55	Q6ZSA7	311 aa		5.51	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		5.51	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	SND1	Q7KZF4	910 aa	Known RBP eCLIP	5.51	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		5.51	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	FAM114A1	Q8IWE2	563 aa		5.51	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	CD302	Q8IX05	232 aa		5.51	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	CCDC116	Q8IYX3	515 aa		5.51	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	IQCK	Q8N0W5	287 aa		5.51	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	MREG	Q8N565	214 aa		5.51	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	CCDC155	Q8N6L0	562 aa		5.51	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	CAGE1	Q8TC20	777 aa		5.51	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	RASGRP4	Q8TDF6	673 aa		5.51	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	PIK3R5	Q8WYR1	880 aa		5.51	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	KAT2B	Q92831	832 aa		5.51	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	ARL8A	Q96BM9	186 aa		5.51	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	NSUN4	Q96CB9	384 aa	Known RBP	5.51	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	RRP36	Q96EU6	259 aa	Known RBP	5.51	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	5.51	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	GDAP1L1	Q96MZ0	367 aa		5.51	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	OSBPL9	Q96SU4	736 aa		5.51	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	LRRC1	Q9BTT6	524 aa		5.51	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	MMTAG2	Q9BU76	263 aa	Known RBP	5.51	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	TLR10	Q9BXR5	811 aa		5.51	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	TRIM9	Q9C026	710 aa		5.51	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	EHD4	Q9H223	541 aa		5.51	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	SEMA6B	Q9H3T3	888 aa		5.51	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	PLEKHA4	Q9H4M7	779 aa		5.51	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	5.51	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	GDF3	Q9NR23	364 aa		5.51	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	IL17RB	Q9NRM6	502 aa		5.51	□□□□□ -1.53

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