RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498648.5

STRADB-210, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta, humanhuman

TSL 3

Gene STRADB, Length 535 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADB-210ENST00000498648 FBXW5Q969U6 566 aa5.88□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 ISL2Q96A47 359 aa5.88□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 GCC1Q96CN9 775 aa5.88□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 ERP27Q96DN0 273 aa5.88□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 RIPOR3Q96MK2 946 aa5.88□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 DSCC1Q9BVC3 393 aa5.88□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa5.88□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 MS4A5Q9H3V2 200 aa5.88□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 ARFGAP3Q9NP61 516 aa5.88□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 GPRC5CQ9NQ84 441 aa5.88□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 POLG2Q9UHN1 485 aa5.88□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 ASAP1Q9ULH1 1129 aa5.88□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 LRCH1Q9Y2L9 728 aa5.88□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa5.88□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 A0A0G2JS52 829 aa5.87□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 STXBP3O00186 592 aa5.87□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 GSTA4O15217 222 aa5.87□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 LCP1P13796 627 aa5.87□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 AGXTP21549 392 aa5.87□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 LTBRP36941 435 aa5.87□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 MAPK9P45984 424 aa5.87□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP5.87□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 EIF5P55010 431 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 ST5P78524 1137 aa5.87□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 POU4F1Q01851 419 aa5.87□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 TNFAIP2Q03169 654 aa5.87□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 KCNAB2Q13303 367 aa5.87□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 ELOA3BQ3SY89 546 aa5.87□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 PRR16Q569H4 304 aa5.87□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 DGKKQ5KSL6 1271 aa5.87□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 GPAT2Q6NUI2 795 aa5.87□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 ARMCX6Q7L4S7 300 aa5.87□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 OTOP3Q7RTS5 596 aa5.87□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 DENND1CQ8IV53 801 aa5.87□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 GALNT11Q8NCW6 608 aa5.87□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 ELOA3Q8NG57 546 aa5.87□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 PANK1Q8TE04 598 aa5.87□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa5.87□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 MVB12AQ96EY5 273 aa5.87□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa5.87□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 BOCQ9BWV1 1114 aa5.87□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 APOL5Q9BWW9 433 aa5.87□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 IPPKQ9H8X2 491 aa5.87□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 LGR6Q9HBX8 967 aa5.87□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 RTEL1Q9NZ71 1219 aa5.87□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 CBLCQ9ULV8 474 aa5.87□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa5.87□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 BACE2Q9Y5Z0 518 aa5.87□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 A0A1B0GVC2 190 aa5.86□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 J3KRW8 73 aa5.86□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 GOLIM4O00461 696 aa5.86□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 AURKAO14965 403 aa5.86□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 B3GALT2O43825 422 aa5.86□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 KDM1AO60341 852 aa5.86□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 SNX2O60749 519 aa5.86□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 MTNR1BP49286 362 aa5.86□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa5.86□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 C20orf204Q6ZNR8 217 aa5.86□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 DPP9Q86TI2 863 aa5.86□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 CAMKK1Q8N5S9 505 aa5.86□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 MYCT1Q8N699 235 aa5.86□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 NAXEQ8NCW5 288 aa5.86□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa5.86□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 PPM1MQ96MI6 270 aa5.86□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 ACAP3Q96P50 834 aa5.86□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 B3GNT5Q9BYG0 378 aa5.86□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 MYLK2Q9H1R3 596 aa5.86□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 DNAJC28Q9NX36 388 aa5.86□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 GPRC5BQ9NZH0 403 aa5.86□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 GJD2Q9UKL4 321 aa5.86□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 L1RE1Q9UN81 338 aa5.86□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 AP4E1Q9UPM8 1137 aa5.86□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 STARD13Q9Y3M8 1113 aa5.86□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 GPR45Q9Y5Y3 372 aa5.86□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 ABCC9O60706 1549 aa5.85□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 C2orf71A6NGG8 1288 aa5.85□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 LRRC10BA6NIK2 292 aa5.85□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa5.85□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 hCG_1984214I3L0E3 225 aa5.85□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 M0R3H8 397 aa5.85□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 SIGLEC6O43699 453 aa5.85□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 KRT37O76014 449 aa5.85□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 UBXN7O94888 489 aa5.85□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 TBC1D8O95759 1140 aa5.85□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 SLC9A1P19634 815 aa5.85□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 PEX2P28328 305 aa5.85□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 PPM1AP35813 382 aa5.85□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.5 ms