RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498524.5

ANKRD28-213, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 4,289 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-213ENST00000498524 FAM160B1Q5W0V3 765 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-213ENST00000498524 HDXQ7Z353 690 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-213ENST00000498524 CTAGE6Q86UF2 777 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-213ENST00000498524 CTAGE4Q8IX94 777 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-213ENST00000498524 PARP9Q8IXQ6 854 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-213ENST00000498524 SAMD3Q8N6K7 520 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-213ENST00000498524 OR6J1Q8NGC5 347 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-213ENST00000498524 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-213ENST00000498524 IL17RAQ96F46 866 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-213ENST00000498524 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-213ENST00000498524 CEP63Q96MT8 703 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-213ENST00000498524 CTAGE1Q96RT6 745 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-213ENST00000498524 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-213ENST00000498524 VTA1Q9NP79 307 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-213ENST00000498524 PAG1Q9NWQ8 432 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-213ENST00000498524 MORF4L1Q9UBU8 362 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-213ENST00000498524 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-213ENST00000498524 STX8Q9UNK0 236 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-213ENST00000498524 SCINQ9Y6U3 715 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-213ENST00000498524 ABCA3Q99758 1704 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-213ENST00000498524 SHTN1A0MZ66 631 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-213ENST00000498524 CTAGE9A4FU28 777 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-213ENST00000498524 BAIAP3O94812 1187 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-213ENST00000498524 ZNF202O95125 648 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-213ENST00000498524 GH1P01241 217 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-213ENST00000498524 NEFHP12036 1026 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-213ENST00000498524 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-213ENST00000498524 SYN1P17600 705 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-213ENST00000498524 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-213ENST00000498524 ADCYAP1R1P41586 468 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-213ENST00000498524 CLCN6P51797 869 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-213ENST00000498524 MTX1Q13505 466 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-213ENST00000498524 PTPAQ15257 358 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-213ENST00000498524 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-213ENST00000498524 ANO1Q5XXA6 986 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-213ENST00000498524 KIAA1841Q6NSI8 718 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-213ENST00000498524 C17orf99Q6UX52 265 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-213ENST00000498524 NUDT18Q6ZVK8 323 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-213ENST00000498524 MOB2Q70IA6 237 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-213ENST00000498524 GPR142Q7Z601 462 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-213ENST00000498524 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-213ENST00000498524 ESR2Q92731 530 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-213ENST00000498524 OSBP2Q969R2 916 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-213ENST00000498524 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-213ENST00000498524 CLMNQ96JQ2 1002 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-213ENST00000498524 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-213ENST00000498524 SEMA4AQ9H3S1 761 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-213ENST00000498524 HIPK3Q9H422 1215 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-213ENST00000498524 CNNM2Q9H8M5 875 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-213ENST00000498524 CAPN10Q9HC96 672 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-213ENST00000498524 CCPG1Q9ULG6 757 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-213ENST00000498524 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-213ENST00000498524 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-213ENST00000498524 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-213ENST00000498524 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-213ENST00000498524 YDJCA8MPS7 323 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-213ENST00000498524 POTECB2RU33 542 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-213ENST00000498524 IKBKBO14920 756 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-213ENST00000498524 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-213ENST00000498524 LDHAP00338 332 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-213ENST00000498524 GH2P01242 217 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-213ENST00000498524 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-213ENST00000498524 FLT3P36888 993 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-213ENST00000498524 PSEN1P49768 467 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-213ENST00000498524 NDUFV1P49821 464 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-213ENST00000498524 CDR1P51861 262 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-213ENST00000498524 NUBP1P53384 320 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-213ENST00000498524 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-213ENST00000498524 OAZ1P54368 228 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-213ENST00000498524 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-213ENST00000498524 SATB1Q01826 763 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-213ENST00000498524 STIM1Q13586 685 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-213ENST00000498524 TNNI3KQ59H18 835 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-213ENST00000498524 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-213ENST00000498524 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-213ENST00000498524 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-213ENST00000498524 FBXO33Q7Z6M2 555 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-213ENST00000498524 C10orf67Q8IYJ2 551 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-213ENST00000498524 FIBCD1Q8N539 461 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-213ENST00000498524 CCDC89Q8N998 374 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-213ENST00000498524 KBTBD3Q8NAB2 608 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-213ENST00000498524 TMC2Q8TDI7 906 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-213ENST00000498524 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-213ENST00000498524 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-213ENST00000498524 TOX2Q96NM4 488 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-213ENST00000498524 ALG1Q9BT22 464 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-213ENST00000498524 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-213ENST00000498524 TMX1Q9H3N1 280 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-213ENST00000498524 VPS18Q9P253 973 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-213ENST00000498524 NCDNQ9UBB6 729 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-213ENST00000498524 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-213ENST00000498524 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-213ENST00000498524 WDR90Q96KV7 1748 aa4.34□□□□□ -1.71
ANKRD28-213ENST00000498524 GOLGA8AA7E2F4 631 aa4.34□□□□□ -1.71
ANKRD28-213ENST00000498524 VGLL3A8MV65 326 aa4.34□□□□□ -1.71
ANKRD28-213ENST00000498524 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP4.34□□□□□ -1.71
ANKRD28-213ENST00000498524 INPP5BP32019 993 aa4.34□□□□□ -1.71
ANKRD28-213ENST00000498524 PPM1AP35813 382 aa4.34□□□□□ -1.71
ANKRD28-213ENST00000498524 TLE2Q04725 743 aa4.34□□□□□ -1.71
ANKRD28-213ENST00000498524 PPP2R5AQ15172 486 aa4.34□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.1 ms