RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498054.1

POLR1B-215, Transcript of RNA polymerase I subunit B, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1B, Length 636 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1B-215ENST00000498054 ID4P47928 161 aa5.91□□□□□ -1.46
POLR1B-215ENST00000498054 GUCY2FP51841 1108 aa5.91□□□□□ -1.46
POLR1B-215ENST00000498054 TMPRSS15P98073 1019 aa5.91□□□□□ -1.46
POLR1B-215ENST00000498054 STAT4Q14765 748 aa5.91□□□□□ -1.46
POLR1B-215ENST00000498054 GPR19Q15760 415 aa5.91□□□□□ -1.46
POLR1B-215ENST00000498054 ARHGAP44Q17R89 818 aa5.91□□□□□ -1.46
POLR1B-215ENST00000498054 STEAP3Q658P3 488 aa5.91□□□□□ -1.46
POLR1B-215ENST00000498054 OGFOD2Q6N063 350 aa5.91□□□□□ -1.46
POLR1B-215ENST00000498054 OTOP3Q7RTS5 596 aa5.91□□□□□ -1.46
POLR1B-215ENST00000498054 C11orf74Q86VG3 221 aa5.91□□□□□ -1.46
POLR1B-215ENST00000498054 LILRA2Q8N149 483 aa5.91□□□□□ -1.46
POLR1B-215ENST00000498054 ABHD4Q8TB40 342 aa5.91□□□□□ -1.46
POLR1B-215ENST00000498054 CEP89Q96ST8 783 aa5.91□□□□□ -1.46
POLR1B-215ENST00000498054 C19orf73Q9NVV2 129 aa5.91□□□□□ -1.46
POLR1B-215ENST00000498054 B4GALT6Q9UBX8 382 aa5.91□□□□□ -1.46
POLR1B-215ENST00000498054 DSEQ9UL01 958 aa5.91□□□□□ -1.46
POLR1B-215ENST00000498054 CTNND2Q9UQB3 1225 aa5.91□□□□□ -1.46
POLR1B-215ENST00000498054 PEG3Q9GZU2 1588 aa5.91□□□□□ -1.46
POLR1B-215ENST00000498054 WDR62O43379 1518 aa5.9□□□□□ -1.46
POLR1B-215ENST00000498054 SLC12A8A0AV02 714 aa5.9□□□□□ -1.46
POLR1B-215ENST00000498054 ALG1L2C9J202 215 aa5.9□□□□□ -1.46
POLR1B-215ENST00000498054 EFEMP2O95967 443 aa5.9□□□□□ -1.46
POLR1B-215ENST00000498054 ITGB5P18084 799 aa5.9□□□□□ -1.46
POLR1B-215ENST00000498054 SDHBP21912 280 aa5.9□□□□□ -1.46
POLR1B-215ENST00000498054 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
POLR1B-215ENST00000498054 SNX17Q15036 470 aa5.9□□□□□ -1.46
POLR1B-215ENST00000498054 NR0B2Q15466 257 aa5.9□□□□□ -1.46
POLR1B-215ENST00000498054 CHRNA2Q15822 529 aa5.9□□□□□ -1.46
POLR1B-215ENST00000498054 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa5.9□□□□□ -1.46
POLR1B-215ENST00000498054 NLRX1Q86UT6 975 aa5.9□□□□□ -1.46
POLR1B-215ENST00000498054 RIOX2Q8IUF8 465 aa5.9□□□□□ -1.46
POLR1B-215ENST00000498054 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
POLR1B-215ENST00000498054 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP5.9□□□□□ -1.46
POLR1B-215ENST00000498054 CHTF18Q8WVB6 975 aa5.9□□□□□ -1.46
POLR1B-215ENST00000498054 AP5M1Q9H0R1 490 aa5.9□□□□□ -1.46
POLR1B-215ENST00000498054 SLC6A20Q9NP91 592 aa5.9□□□□□ -1.46
POLR1B-215ENST00000498054 SLC5A4Q9NY91 659 aa5.9□□□□□ -1.46
POLR1B-215ENST00000498054 SIT1Q9Y3P8 196 aa5.9□□□□□ -1.46
POLR1B-215ENST00000498054 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 F8W031 263 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 H7C1D1 291 aa5.89□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa5.89□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 SCDO00767 359 aa5.89□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 HGSO14964 777 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 SLC27A2O14975 620 aa5.89□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 ZEB2O60315 1214 aa5.89□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 MAFKO60675 156 aa5.89□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 HIP1RO75146 1068 aa5.89□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 FKBP9O95302 570 aa5.89□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 EYA4O95677 639 aa5.89□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 PNLIPP16233 465 aa5.89□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 AFMP43652 599 aa5.89□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 ZNF174Q15697 407 aa5.89□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa5.89□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 FKBP9P1Q75LS8 142 aa5.89□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 Q8N1Y9 231 aa5.89□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 SMC1BQ8NDV3 1235 aa5.89□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 BOCQ9BWV1 1114 aa5.89□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 CD244Q9BZW8 370 aa5.89□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 RNF32Q9H0A6 362 aa5.89□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 SMURF1Q9HCE7 757 aa5.89□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 NUB1Q9Y5A7 615 aa5.89□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 NUDT19A8MXV4 375 aa5.88□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 KATNA1O75449 491 aa5.88□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 S100BP04271 92 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 AMY2AP04746 511 aa5.88□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 PDGFRBP09619 1106 aa5.88□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 BPIP17213 487 aa5.88□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 AMY2BP19961 511 aa5.88□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 PDE6BP35913 854 aa5.88□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 ADCYAP1R1P41586 468 aa5.88□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 MECP2P51608 486 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 IRF9Q00978 393 aa5.88□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 OCRLQ01968 901 aa5.88□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 DSG1Q02413 1049 aa5.88□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 ITKQ08881 620 aa5.88□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 ADGRF1Q5T601 910 aa5.88□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 IQSEC1Q6DN90 963 aa5.88□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 MILR1Q7Z6M3 343 aa5.88□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 STAG1Q8WVM7 1258 aa5.88□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 KIRREL1Q96J84 757 aa5.88□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 ORAI3Q9BRQ5 295 aa5.88□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 PCIF1Q9H4Z3 704 aa5.88□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 SP110Q9HB58 689 aa5.88□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 CRTAC1Q9NQ79 661 aa5.88□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 SPTLC3Q9NUV7 552 aa5.88□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 OXSMQ9NWU1 459 aa5.88□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 NUDT5Q9UKK9 219 aa5.88□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 ATP23Q9Y6H3 246 aa5.88□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa5.87□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 MAN2B1O00754 1011 aa5.87□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 GPR39O43194 453 aa5.87□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 MPOP05164 745 aa5.87□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.1 ms