RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496055.5

RABGGTB-213, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 3,863 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-213ENST00000496055 SAAL1Q96ER3 474 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 PARD6BQ9BYG5 372 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 HOMER3Q9NSC5 361 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 SEPT10Q9P0V9 454 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 CPA4Q9UI42 421 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 ZHX2Q9Y6X8 837 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 TMEM221A6NGB7 291 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 BTBD19C9JJ37 291 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 ADCY3O60266 1144 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 INMTO95050 263 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 CASP7P55210 303 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 DAAM2Q86T65 1068 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 VCX3BQ9H321 246 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 CABP5Q9NP86 173 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 MKL2Q9ULH7 1088 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 SMTNL1A8MU46 457 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 RECKO95980 971 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 EN2P19622 333 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 CORO7P57737 925 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 NLRP12P59046 1061 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 Q3C1V9 767 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 TSHZ3Q63HK5 1081 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 MIGA2Q7L4E1 593 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 NEK1Q96PY6 1258 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 HELLSQ9NRZ9 838 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF510Q9Y2H8 683 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 A0A1W2PPC1 479 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 C2orf81A6NN90 581 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 DDX11L8A8MPP1 907 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 CAVIN2O95810 425 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 CCL5P13501 91 aa5.07□□□□□ -1.6
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RABGGTB-213ENST00000496055 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 INHBCP55103 352 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 ARPC4P59998 168 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 BNIP1Q12981 228 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 ZBTB17Q13105 803 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 PICALMQ13492 652 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 LRP8Q14114 963 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 TTC39AQ5SRH9 613 aa5.07□□□□□ -1.6
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RABGGTB-213ENST00000496055 ARHGAP45Q92619 1136 aa5.07□□□□□ -1.6
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RABGGTB-213ENST00000496055 SIL1Q9H173 461 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 FANCFQ9NPI8 374 aa5.07□□□□□ -1.6
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RABGGTB-213ENST00000496055 SH2D4BQ5SQS7 431 aa5.07□□□□□ -1.6
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RABGGTB-213ENST00000496055 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 DNAJC25Q9H1X3 360 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 RTEL1Q9NZ71 1219 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 PSMA3P25788 255 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 POLD2P49005 469 aa5.06□□□□□ -1.6
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RABGGTB-213ENST00000496055 CCDC122Q5T0U0 273 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 MFSD14CQ5VZR4 134 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 GALNT17Q6IS24 598 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 C16orf54Q6UWD8 224 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 KIAA1328Q86T90 577 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 IQCA1Q86XH1 822 aa5.06□□□□□ -1.6
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RABGGTB-213ENST00000496055 ESX1Q8N693 406 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 ANKLE1Q8NAG6 615 aa5.06□□□□□ -1.6
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RABGGTB-213ENST00000496055 TSPY26PQ9H489 355 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 DISC1Q9NRI5 854 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 POTEFA5A3E0 1075 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 USP17L5A8MUK1 530 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 BIN1O00499 593 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 MUSKO15146 869 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 PAHP00439 452 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 TRAPPC10P48553 1259 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 CACNB3P54284 484 aa5.06□□□□□ -1.6
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