RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490914.1

SSB-211, Transcript of Sjogren syndrome antigen B, humanhuman

TSL 5

Gene SSB, Length 754 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSB-211ENST00000490914 LOXL4Q96JB6 756 aa7.04□□□□□ -1.28
SSB-211ENST00000490914 CLIC6Q96NY7 704 aa7.04□□□□□ -1.28
SSB-211ENST00000490914 GMLQ99445 158 aa7.04□□□□□ -1.28
SSB-211ENST00000490914 SLC6A20Q9NP91 592 aa7.04□□□□□ -1.28
SSB-211ENST00000490914 BLACEA4D250 179 aa7.03□□□□□ -1.28
SSB-211ENST00000490914 C9orf118A6NHY6 69 aa7.03□□□□□ -1.28
SSB-211ENST00000490914 PRODHO43272 600 aa7.03□□□□□ -1.28
SSB-211ENST00000490914 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
SSB-211ENST00000490914 PHF19Q5T6S3 580 aa7.03□□□□□ -1.28
SSB-211ENST00000490914 LIMS2Q7Z4I7 341 aa7.03□□□□□ -1.28
SSB-211ENST00000490914 CLEC4DQ8WXI8 215 aa7.03□□□□□ -1.28
SSB-211ENST00000490914 OSBP2Q969R2 916 aa7.03□□□□□ -1.28
SSB-211ENST00000490914 SGSM3Q96HU1 749 aa7.03□□□□□ -1.28
SSB-211ENST00000490914 C8orf49Q96NF6 230 aa7.03□□□□□ -1.28
SSB-211ENST00000490914 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
SSB-211ENST00000490914 L2HGDHQ9H9P8 463 aa7.03□□□□□ -1.28
SSB-211ENST00000490914 ZNF536O15090 1300 aa7.02□□□□□ -1.28
SSB-211ENST00000490914 KRIT1O00522 736 aa7.02□□□□□ -1.29
SSB-211ENST00000490914 LTFP02788 710 aa7.02□□□□□ -1.29
SSB-211ENST00000490914 COL6A2P12110 1019 aa7.02□□□□□ -1.29
SSB-211ENST00000490914 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
SSB-211ENST00000490914 CYP4F22Q6NT55 531 aa7.02□□□□□ -1.29
SSB-211ENST00000490914 SAMD11Q96NU1 681 aa7.02□□□□□ -1.29
SSB-211ENST00000490914 TMEM209Q96SK2 561 aa7.02□□□□□ -1.29
SSB-211ENST00000490914 FGFR1P11362 822 aa7.01□□□□□ -1.29
SSB-211ENST00000490914 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
SSB-211ENST00000490914 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
SSB-211ENST00000490914 LBX2Q6XYB7 198 aa7.01□□□□□ -1.29
SSB-211ENST00000490914 OTOP3Q7RTS5 596 aa7.01□□□□□ -1.29
SSB-211ENST00000490914 TTLL11Q8NHH1 800 aa7.01□□□□□ -1.29
SSB-211ENST00000490914 TMEM168Q9H0V1 697 aa7.01□□□□□ -1.29
SSB-211ENST00000490914 HSPBP1Q9NZL4 362 aa7.01□□□□□ -1.29
SSB-211ENST00000490914 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa7.01□□□□□ -1.29
SSB-211ENST00000490914 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP7□□□□□ -1.29
SSB-211ENST00000490914 LAMTOR5O43504 91 aa7□□□□□ -1.29
SSB-211ENST00000490914 MAFKO60675 156 aa7□□□□□ -1.29
SSB-211ENST00000490914 COL6A1P12109 1028 aa7□□□□□ -1.29
SSB-211ENST00000490914 ZNF20P17024 532 aa7□□□□□ -1.29
SSB-211ENST00000490914 GRK2P25098 689 aa7□□□□□ -1.29
SSB-211ENST00000490914 GRK3P35626 688 aa7□□□□□ -1.29
SSB-211ENST00000490914 RBM25P49756 843 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
SSB-211ENST00000490914 TUSC3Q13454 348 aa7□□□□□ -1.29
SSB-211ENST00000490914 RAB33AQ14088 237 aa7□□□□□ -1.29
SSB-211ENST00000490914 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
SSB-211ENST00000490914 TTC9BQ8N6N2 239 aa7□□□□□ -1.29
SSB-211ENST00000490914 DCAF4Q8WV16 495 aa7□□□□□ -1.29
SSB-211ENST00000490914 KCNJ15Q99712 375 aa7□□□□□ -1.29
SSB-211ENST00000490914 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa7□□□□□ -1.29
SSB-211ENST00000490914 TELO2Q9Y4R8 837 aa7□□□□□ -1.29
SSB-211ENST00000490914 CPZQ66K79 652 aa6.99□□□□□ -1.29
SSB-211ENST00000490914 PKN3Q6P5Z2 889 aa6.99□□□□□ -1.29
SSB-211ENST00000490914 GLB1LQ6UWU2 654 aa6.99□□□□□ -1.29
SSB-211ENST00000490914 NSMFQ6X4W1 530 aa6.99□□□□□ -1.29
SSB-211ENST00000490914 TRIM48Q8IWZ4 208 aa6.99□□□□□ -1.29
SSB-211ENST00000490914 DTX3Q8N9I9 347 aa6.99□□□□□ -1.29
SSB-211ENST00000490914 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SSB-211ENST00000490914 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SSB-211ENST00000490914 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa6.99□□□□□ -1.29
SSB-211ENST00000490914 WRNIP1Q96S55 665 aa6.99□□□□□ -1.29
SSB-211ENST00000490914 IGSF5Q9NSI5 407 aa6.99□□□□□ -1.29
SSB-211ENST00000490914 ASXL2Q76L83 1435 aa6.99□□□□□ -1.29
SSB-211ENST00000490914 IQCA1LA6NCM1 817 aa6.98□□□□□ -1.29
SSB-211ENST00000490914 GNAT1P11488 350 aa6.98□□□□□ -1.29
SSB-211ENST00000490914 KIZQ2M2Z5 673 aa6.98□□□□□ -1.29
SSB-211ENST00000490914 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
SSB-211ENST00000490914 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
SSB-211ENST00000490914 VASNQ6EMK4 673 aa6.98□□□□□ -1.29
SSB-211ENST00000490914 STYK1Q6J9G0 422 aa6.98□□□□□ -1.29
SSB-211ENST00000490914 KBTBD2Q8IY47 623 aa6.98□□□□□ -1.29
SSB-211ENST00000490914 NUDT10Q8NFP7 164 aa6.98□□□□□ -1.29
SSB-211ENST00000490914 NUDT11Q96G61 164 aa6.98□□□□□ -1.29
SSB-211ENST00000490914 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa6.98□□□□□ -1.29
SSB-211ENST00000490914 FTSJ1Q9UET6 329 aa6.98□□□□□ -1.29
SSB-211ENST00000490914 TRAV20A0A0B4J274 112 aa6.97□□□□□ -1.29
SSB-211ENST00000490914 CYP7B1O75881 506 aa6.97□□□□□ -1.29
SSB-211ENST00000490914 SOD2P04179 222 aa6.97□□□□□ -1.29
SSB-211ENST00000490914 FAHP16930 419 aa6.97□□□□□ -1.29
SSB-211ENST00000490914 TNFRSF1AP19438 455 aa6.97□□□□□ -1.29
SSB-211ENST00000490914 GPR85P60893 370 aa6.97□□□□□ -1.29
SSB-211ENST00000490914 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
SSB-211ENST00000490914 NFATC3Q12968 1075 aa6.97□□□□□ -1.29
SSB-211ENST00000490914 CHST13Q8NET6 341 aa6.97□□□□□ -1.29
SSB-211ENST00000490914 PTPN18Q99952 460 aa6.97□□□□□ -1.29
SSB-211ENST00000490914 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa6.97□□□□□ -1.29
SSB-211ENST00000490914 DLL4Q9NR61 685 aa6.97□□□□□ -1.29
SSB-211ENST00000490914 MATN3O15232 486 aa6.96□□□□□ -1.3
SSB-211ENST00000490914 GPR42O15529 346 aa6.96□□□□□ -1.3
SSB-211ENST00000490914 CKMP06732 381 aa6.96□□□□□ -1.3
SSB-211ENST00000490914 ICAM4Q14773 271 aa6.96□□□□□ -1.3
SSB-211ENST00000490914 SURF1Q15526 300 aa6.96□□□□□ -1.3
SSB-211ENST00000490914 SPATC1Q76KD6 591 aa6.96□□□□□ -1.3
SSB-211ENST00000490914 PLEKHH3Q7Z736 793 aa6.96□□□□□ -1.3
SSB-211ENST00000490914 IFNL3Q8IZI9 196 aa6.96□□□□□ -1.3
SSB-211ENST00000490914 KLHL36Q8N4N3 616 aa6.96□□□□□ -1.3
SSB-211ENST00000490914 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP6.96□□□□□ -1.3
SSB-211ENST00000490914 IPPKQ9H8X2 491 aa6.96□□□□□ -1.3
SSB-211ENST00000490914 ZDHHC9Q9Y397 364 aa6.96□□□□□ -1.3
SSB-211ENST00000490914 TRAF6Q9Y4K3 522 aa6.96□□□□□ -1.3
SSB-211ENST00000490914 B4GALT4O60513 344 aa6.95□□□□□ -1.3
SSB-211ENST00000490914 KLHL18O94889 574 aa6.95□□□□□ -1.3
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