RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488550.5

MEIS1-209, Transcript of Meis homeobox 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MEIS1, Length 5,111 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS1-209ENST00000488550 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
MEIS1-209ENST00000488550 PMS2P54278 862 aa8.13□□□□□ -1.11
MEIS1-209ENST00000488550 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
MEIS1-209ENST00000488550 IQCB1Q15051 598 aa8.13□□□□□ -1.11
MEIS1-209ENST00000488550 GNPTABQ3T906 1256 aa8.13□□□□□ -1.11
MEIS1-209ENST00000488550 FAM26FQ5R3K3 315 aa8.13□□□□□ -1.11
MEIS1-209ENST00000488550 AKNAD1Q5T1N1 836 aa8.13□□□□□ -1.11
MEIS1-209ENST00000488550 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
MEIS1-209ENST00000488550 CNPY3Q9BT09 278 aa8.13□□□□□ -1.11
MEIS1-209ENST00000488550 WWP1Q9H0M0 922 aa8.13□□□□□ -1.11
MEIS1-209ENST00000488550 TMEM206Q9H813 350 aa8.13□□□□□ -1.11
MEIS1-209ENST00000488550 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
MEIS1-209ENST00000488550 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP8.12□□□□□ -1.11
MEIS1-209ENST00000488550 HSPA4LO95757 839 aa8.12□□□□□ -1.11
MEIS1-209ENST00000488550 CD19P15391 556 aa8.12□□□□□ -1.11
MEIS1-209ENST00000488550 RFX1P22670 979 aa8.12□□□□□ -1.11
MEIS1-209ENST00000488550 GPTP24298 496 aa8.12□□□□□ -1.11
MEIS1-209ENST00000488550 CHRNA3P32297 505 aa8.12□□□□□ -1.11
MEIS1-209ENST00000488550 S100A5P33763 92 aa8.12□□□□□ -1.11
MEIS1-209ENST00000488550 MYO1EQ12965 1108 aa8.12□□□□□ -1.11
MEIS1-209ENST00000488550 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
MEIS1-209ENST00000488550 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
MEIS1-209ENST00000488550 DYMQ7RTS9 669 aa8.12□□□□□ -1.11
MEIS1-209ENST00000488550 MAML1Q92585 1016 aa8.12□□□□□ -1.11
MEIS1-209ENST00000488550 ANTXR1Q9H6X2 564 aa8.12□□□□□ -1.11
MEIS1-209ENST00000488550 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
MEIS1-209ENST00000488550 ZNF229Q9UJW7 825 aa8.12□□□□□ -1.11
MEIS1-209ENST00000488550 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa8.12□□□□□ -1.11
MEIS1-209ENST00000488550 ZNF711Q9Y462 761 aa8.12□□□□□ -1.11
MEIS1-209ENST00000488550 STRNO43815 780 aa8.12□□□□□ -1.11
MEIS1-209ENST00000488550 IL10P22301 178 aa8.12□□□□□ -1.11
MEIS1-209ENST00000488550 ARFIP2P53365 341 aa8.12□□□□□ -1.11
MEIS1-209ENST00000488550 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
MEIS1-209ENST00000488550 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
MEIS1-209ENST00000488550 SYCP2LQ5T4T6 812 aa8.12□□□□□ -1.11
MEIS1-209ENST00000488550 GCC2Q8IWJ2 1684 aa8.12□□□□□ -1.11
MEIS1-209ENST00000488550 NELFCDQ8IXH7 590 aa8.12□□□□□ -1.11
MEIS1-209ENST00000488550 TUBGCP3Q96CW5 907 aa8.12□□□□□ -1.11
MEIS1-209ENST00000488550 THAP11Q96EK4 314 aa8.12□□□□□ -1.11
MEIS1-209ENST00000488550 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa8.12□□□□□ -1.11
MEIS1-209ENST00000488550 DONSONQ9NYP3 566 aa8.12□□□□□ -1.11
MEIS1-209ENST00000488550 MAN1B1Q9UKM7 699 aa8.12□□□□□ -1.11
MEIS1-209ENST00000488550 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
MEIS1-209ENST00000488550 TMEM247A6NEH6 219 aa8.12□□□□□ -1.11
MEIS1-209ENST00000488550 FOSP01100 380 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
MEIS1-209ENST00000488550 KRT1P04264 644 aa8.12□□□□□ -1.11
MEIS1-209ENST00000488550 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
MEIS1-209ENST00000488550 SERPINB1P30740 379 aa8.12□□□□□ -1.11
MEIS1-209ENST00000488550 ATICP31939 592 aa8.12□□□□□ -1.11
MEIS1-209ENST00000488550 CORO7P57737 925 aa8.12□□□□□ -1.11
MEIS1-209ENST00000488550 IL1RL1Q01638 556 aa8.12□□□□□ -1.11
MEIS1-209ENST00000488550 KMT5BQ4FZB7 885 aa8.12□□□□□ -1.11
MEIS1-209ENST00000488550 LUZP2Q86TE4 346 aa8.12□□□□□ -1.11
MEIS1-209ENST00000488550 ADCK1Q86TW2 530 aa8.12□□□□□ -1.11
MEIS1-209ENST00000488550 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa8.12□□□□□ -1.11
MEIS1-209ENST00000488550 PDIK1LQ8N165 341 aa8.12□□□□□ -1.11
MEIS1-209ENST00000488550 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP8.12□□□□□ -1.11
MEIS1-209ENST00000488550 C19orf60Q96EN9 201 aa8.12□□□□□ -1.11
MEIS1-209ENST00000488550 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
MEIS1-209ENST00000488550 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
MEIS1-209ENST00000488550 HESX1Q9UBX0 185 aa8.12□□□□□ -1.11
MEIS1-209ENST00000488550 KDM5BQ9UGL1 1544 aa8.12□□□□□ -1.11
MEIS1-209ENST00000488550 IQCA1LA6NCM1 817 aa8.12□□□□□ -1.11
MEIS1-209ENST00000488550 NVLO15381 856 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
MEIS1-209ENST00000488550 PYGMP11217 842 aa8.12□□□□□ -1.11
MEIS1-209ENST00000488550 CA4P22748 312 aa8.12□□□□□ -1.11
MEIS1-209ENST00000488550 CCDC15Q0P6D6 951 aa8.12□□□□□ -1.11
MEIS1-209ENST00000488550 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
MEIS1-209ENST00000488550 SURF1Q15526 300 aa8.12□□□□□ -1.11
MEIS1-209ENST00000488550 INAQ16352 499 aa8.12□□□□□ -1.11
MEIS1-209ENST00000488550 C16orf89Q6UX73 402 aa8.12□□□□□ -1.11
MEIS1-209ENST00000488550 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
MEIS1-209ENST00000488550 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
MEIS1-209ENST00000488550 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
MEIS1-209ENST00000488550 FOXP3Q9BZS1 431 aa8.12□□□□□ -1.11
MEIS1-209ENST00000488550 CEP72Q9P209 647 aa8.12□□□□□ -1.11
MEIS1-209ENST00000488550 MOCS3O95396 460 aa8.11□□□□□ -1.11
MEIS1-209ENST00000488550 OATP04181 439 aa8.11□□□□□ -1.11
MEIS1-209ENST00000488550 MYBL1P10243 752 aa8.11□□□□□ -1.11
MEIS1-209ENST00000488550 YY1P25490 414 aa8.11□□□□□ -1.11
MEIS1-209ENST00000488550 HIC1Q14526 733 aa8.11□□□□□ -1.11
MEIS1-209ENST00000488550 MB21D1Q8N884 522 aa8.11□□□□□ -1.11
MEIS1-209ENST00000488550 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
MEIS1-209ENST00000488550 ZNF555Q8NEP9 628 aa8.11□□□□□ -1.11
MEIS1-209ENST00000488550 DTX3LQ8TDB6 740 aa8.11□□□□□ -1.11
MEIS1-209ENST00000488550 LPIN2Q92539 896 aa8.11□□□□□ -1.11
MEIS1-209ENST00000488550 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
MEIS1-209ENST00000488550 MXD3Q9BW11 206 aa8.11□□□□□ -1.11
MEIS1-209ENST00000488550 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
MEIS1-209ENST00000488550 AZI2Q9H6S1 392 aa8.11□□□□□ -1.11
MEIS1-209ENST00000488550 GPR108Q9NPR9 543 aa8.11□□□□□ -1.11
MEIS1-209ENST00000488550 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
MEIS1-209ENST00000488550 STRIP2Q9ULQ0 834 aa8.11□□□□□ -1.11
MEIS1-209ENST00000488550 KDRP35968 1356 aa8.11□□□□□ -1.11
MEIS1-209ENST00000488550 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa8.11□□□□□ -1.11
MEIS1-209ENST00000488550 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
MEIS1-209ENST00000488550 TJP3O95049 919 aa8.11□□□□□ -1.11
MEIS1-209ENST00000488550 PDHA1P08559 390 aa8.11□□□□□ -1.11
MEIS1-209ENST00000488550 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
MEIS1-209ENST00000488550 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.6 ms