RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487939.1

PTEN-204, Transcript of phosphatase and tensin homolog, humanhuman

TSL 3

Gene PTEN, Length 477 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTEN-204ENST00000487939 CRY1Q16526 586 aa6.51□□□□□ -1.37
PTEN-204ENST00000487939 TAF7LQ5H9L4 462 aa6.51□□□□□ -1.37
PTEN-204ENST00000487939 EP400NLQ6ZTU2 488 aa6.51□□□□□ -1.37
PTEN-204ENST00000487939 SCLYQ96I15 445 aa6.51□□□□□ -1.37
PTEN-204ENST00000487939 ASH2LQ9UBL3 628 aa6.51□□□□□ -1.37
PTEN-204ENST00000487939 CCDC66A2RUB6 948 aa6.5□□□□□ -1.37
PTEN-204ENST00000487939 ASLP04424 464 aa6.5□□□□□ -1.37
PTEN-204ENST00000487939 CYP2C8P10632 490 aa6.5□□□□□ -1.37
PTEN-204ENST00000487939 ATF2P15336 505 aa6.5□□□□□ -1.37
PTEN-204ENST00000487939 PI3P19957 117 aa6.5□□□□□ -1.37
PTEN-204ENST00000487939 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP6.5□□□□□ -1.37
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PTEN-204ENST00000487939 FBLN7Q53RD9 439 aa6.5□□□□□ -1.37
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PTEN-204ENST00000487939 TMEM151BQ8IW70 566 aa6.5□□□□□ -1.37
PTEN-204ENST00000487939 NLGN4XQ8N0W4 816 aa6.5□□□□□ -1.37
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PTEN-204ENST00000487939 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
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PTEN-204ENST00000487939 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa6.5□□□□□ -1.37
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PTEN-204ENST00000487939 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP6.49□□□□□ -1.37
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PTEN-204ENST00000487939 DNM2P50570 870 aa6.49□□□□□ -1.37
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PTEN-204ENST00000487939 CNKSR3Q6P9H4 555 aa6.49□□□□□ -1.37
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PTEN-204ENST00000487939 CD300LDQ6UXZ3 194 aa6.49□□□□□ -1.37
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PTEN-204ENST00000487939 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PTEN-204ENST00000487939 TMEFF1Q8IYR6 380 aa6.49□□□□□ -1.37
PTEN-204ENST00000487939 ARRDC4Q8NCT1 418 aa6.49□□□□□ -1.37
PTEN-204ENST00000487939 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PTEN-204ENST00000487939 CLUHP3Q96NS8 147 aa6.49□□□□□ -1.37
PTEN-204ENST00000487939 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PTEN-204ENST00000487939 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
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PTEN-204ENST00000487939 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
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PTEN-204ENST00000487939 PDE6AP16499 860 aa6.48□□□□□ -1.37
PTEN-204ENST00000487939 LIMS1P48059 325 aa6.48□□□□□ -1.37
PTEN-204ENST00000487939 KCTD1Q719H9 257 aa6.48□□□□□ -1.37
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PTEN-204ENST00000487939 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa6.48□□□□□ -1.37
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PTEN-204ENST00000487939 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa6.47□□□□□ -1.37
PTEN-204ENST00000487939 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
PTEN-204ENST00000487939 NINJ1Q92982 152 aa6.47□□□□□ -1.37
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PTEN-204ENST00000487939 COQ6Q9Y2Z9 468 aa6.47□□□□□ -1.37
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PTEN-204ENST00000487939 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
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PTEN-204ENST00000487939 HSD3B2P26439 372 aa6.46□□□□□ -1.38
PTEN-204ENST00000487939 GJA4P35212 333 aa6.46□□□□□ -1.38
PTEN-204ENST00000487939 CAP1Q01518 475 aa6.46□□□□□ -1.38
PTEN-204ENST00000487939 TKFCQ3LXA3 575 aa6.46□□□□□ -1.38
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PTEN-204ENST00000487939 OSTM1Q86WC4 334 aa6.46□□□□□ -1.38
PTEN-204ENST00000487939 IGSF22Q8N9C0 903 aa6.46□□□□□ -1.38
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PTEN-204ENST00000487939 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
PTEN-204ENST00000487939 HSPBP1Q9NZL4 362 aa6.46□□□□□ -1.38
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PTEN-204ENST00000487939 AMY2BP19961 511 aa6.45□□□□□ -1.38
PTEN-204ENST00000487939 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PTEN-204ENST00000487939 GRIN1Q05586 938 aa6.45□□□□□ -1.38
PTEN-204ENST00000487939 CR1LQ2VPA4 569 aa6.45□□□□□ -1.38
PTEN-204ENST00000487939 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PTEN-204ENST00000487939 TMEM177Q53S58 311 aa6.45□□□□□ -1.38
PTEN-204ENST00000487939 TCERG1LQ5VWI1 586 aa6.45□□□□□ -1.38
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