RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482785.1

SHQ1-208, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, human

TSL 3

Gene SHQ1, Length 502 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SHQ1-208	ENST00000482785	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	POU3F2	P20265	443 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	TARS	P26639	723 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	MCM4	P33991	863 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	GRIA4	P48058	902 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	CASP7	P55210	303 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	TLE2	Q04725	743 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	HYAL2	Q12891	473 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	SLC39A6	Q13433	755 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	TCEA2	Q15560	299 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	MTERF2	Q49AM1	385 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	N4BP2L1	Q5TBK1	243 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	FBXW10	Q5XX13	1052 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	NEK9	Q8TD19	979 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	ARNTL2	Q8WYA1	636 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	TRIB2	Q92519	343 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	ZNF669	Q96BR6	464 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	ZFP42	Q96MM3	310 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	GSX2	Q9BZM3	304 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	ZCCHC2	Q9C0B9	1178 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	BHLHE41	Q9C0J9	482 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	4.85	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	PLAA	Q9Y263	795 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	SAMM50	Q9Y512	469 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785		R4GN57	208 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	TNKS	O95271	1327 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	RTL1	A6NKG5	1358 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	MYO7A	Q13402	2215 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	KIAA0355	O15063	1070 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	PSAP	P07602	524 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	RARA	P10276	462 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	CYP2C8	P10632	490 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	SLC5A1	P13866	664 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	VGLL4	Q14135	290 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	SNX17	Q15036	470 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	KRTAP21-3	Q3LHN1	58 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	BNC2	Q6ZN30	1099 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	ZNF365	Q70YC5	407 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	REC114	Q7Z4M0	266 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	DHX37	Q8IY37	1157 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	PGBD3	Q8N328	593 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	CEP120	Q8N960	986 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	C19orf47	Q8N9M1	422 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	ST13P5	Q8NFI4	369 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	FBXO27	Q8NI29	283 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	HAUS7	Q99871	368 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	SEMA4A	Q9H3S1	761 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	CLMP	Q9H6B4	373 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	TMEM39A	Q9NV64	488 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	DNMT3L	Q9UJW3	386 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	CYP8B1	Q9UNU6	501 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	TACC3	Q9Y6A5	838 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	ITPR2	Q14571	2701 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SHQ1-208	ENST00000482785	ABCC4	O15439	1325 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SHQ1-208	ENST00000482785	ZNF521	Q96K83	1311 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SHQ1-208	ENST00000482785		A0A096LPE4	126 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SHQ1-208	ENST00000482785	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SHQ1-208	ENST00000482785		A0A1W2PPZ6	126 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SHQ1-208	ENST00000482785	PRR5-ARHGAP8	B1AHC4	643 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SHQ1-208	ENST00000482785		J3QKU1	62 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SHQ1-208	ENST00000482785	KHNYN	O15037	678 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SHQ1-208	ENST00000482785	TPD52L2	O43399	206 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SHQ1-208	ENST00000482785	CILP	O75339	1184 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SHQ1-208	ENST00000482785	PAGE1	O75459	146 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SHQ1-208	ENST00000482785	ARHGEF15	O94989	841 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SHQ1-208	ENST00000482785	MAP3K6	O95382	1288 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SHQ1-208	ENST00000482785	F11	P03951	625 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SHQ1-208	ENST00000482785	FAM157B	P0CG42	384 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SHQ1-208	ENST00000482785	ACR	P10323	421 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SHQ1-208	ENST00000482785	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SHQ1-208	ENST00000482785	ARHGAP8	P85298	464 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SHQ1-208	ENST00000482785	PLAUR	Q03405	335 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SHQ1-208	ENST00000482785	PPP2R3A	Q06190	1150 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SHQ1-208	ENST00000482785	CACNB2	Q08289	660 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SHQ1-208	ENST00000482785	SNAPC2	Q13487	334 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SHQ1-208	ENST00000482785	CCDC6	Q16204	474 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SHQ1-208	ENST00000482785	TKFC	Q3LXA3	575 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SHQ1-208	ENST00000482785	KRT25	Q7Z3Z0	450 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SHQ1-208	ENST00000482785	SPRED2	Q7Z698	418 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SHQ1-208	ENST00000482785	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SHQ1-208	ENST00000482785	ZNF605	Q86T29	641 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SHQ1-208	ENST00000482785	FERMT3	Q86UX7	667 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SHQ1-208	ENST00000482785	TMEM102	Q8N9M5	508 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SHQ1-208	ENST00000482785	PRPF38A	Q8NAV1	312 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SHQ1-208	ENST00000482785	COA7	Q96BR5	231 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SHQ1-208	ENST00000482785	PLD4	Q96BZ4	506 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SHQ1-208	ENST00000482785	RIPOR3	Q96MK2	946 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SHQ1-208	ENST00000482785	PNMA5	Q96PV4	448 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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