RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476423.5

SZRD1-208, Transcript of SUZ RNA binding domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene SZRD1, Length 567 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SZRD1-208ENST00000476423 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa9.3□□□□□ -0.92
SZRD1-208ENST00000476423 FBXL21Q9UKT6 434 aa9.3□□□□□ -0.92
SZRD1-208ENST00000476423 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa9.29□□□□□ -0.92
SZRD1-208ENST00000476423 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
SZRD1-208ENST00000476423 RSPH10B2B2RC85 870 aa9.29□□□□□ -0.92
SZRD1-208ENST00000476423 PRDM1O75626 825 aa9.29□□□□□ -0.92
SZRD1-208ENST00000476423 RSPH10BP0C881 870 aa9.29□□□□□ -0.92
SZRD1-208ENST00000476423 ATP5JP18859 108 aa9.29□□□□□ -0.92
SZRD1-208ENST00000476423 CASTP20810 708 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
SZRD1-208ENST00000476423 PMLP29590 882 aa9.29□□□□□ -0.92
SZRD1-208ENST00000476423 CAMK1Q14012 370 aa9.29□□□□□ -0.92
SZRD1-208ENST00000476423 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
SZRD1-208ENST00000476423 TPRNQ4KMQ1 711 aa9.29□□□□□ -0.92
SZRD1-208ENST00000476423 TMEM63BQ5T3F8 832 aa9.29□□□□□ -0.92
SZRD1-208ENST00000476423 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa9.29□□□□□ -0.92
SZRD1-208ENST00000476423 C1orf210Q8IVY1 113 aa9.29□□□□□ -0.92
SZRD1-208ENST00000476423 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
SZRD1-208ENST00000476423 SPPL3Q8TCT6 385 aa9.29□□□□□ -0.92
SZRD1-208ENST00000476423 MORC4Q8TE76 937 aa9.29□□□□□ -0.92
SZRD1-208ENST00000476423 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
SZRD1-208ENST00000476423 KIF12Q96FN5 646 aa9.29□□□□□ -0.92
SZRD1-208ENST00000476423 S1PR5Q9H228 398 aa9.29□□□□□ -0.92
SZRD1-208ENST00000476423 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa9.29□□□□□ -0.92
SZRD1-208ENST00000476423 HOMER2Q9NSB8 354 aa9.29□□□□□ -0.92
SZRD1-208ENST00000476423 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa9.29□□□□□ -0.92
SZRD1-208ENST00000476423 LHX6Q9UPM6 363 aa9.29□□□□□ -0.92
SZRD1-208ENST00000476423 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa9.29□□□□□ -0.92
SZRD1-208ENST00000476423 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
SZRD1-208ENST00000476423 GSG1L2A8MUP6 293 aa9.28□□□□□ -0.92
SZRD1-208ENST00000476423 M0R2C6 588 aa9.28□□□□□ -0.92
SZRD1-208ENST00000476423 TBC1D4O60343 1298 aa9.28□□□□□ -0.92
SZRD1-208ENST00000476423 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
SZRD1-208ENST00000476423 UBE3AQ05086 875 aa9.28□□□□□ -0.92
SZRD1-208ENST00000476423 ITIH3Q06033 890 aa9.28□□□□□ -0.92
SZRD1-208ENST00000476423 PPP2R5BQ15173 497 aa9.28□□□□□ -0.92
SZRD1-208ENST00000476423 UBE3CQ15386 1083 aa9.28□□□□□ -0.92
SZRD1-208ENST00000476423 ZNF528Q3MIS6 628 aa9.28□□□□□ -0.92
SZRD1-208ENST00000476423 C20orf194Q5TEA3 1177 aa9.28□□□□□ -0.92
SZRD1-208ENST00000476423 ANKRD54Q6NXT1 300 aa9.28□□□□□ -0.92
SZRD1-208ENST00000476423 POF1BQ8WVV4 589 aa9.28□□□□□ -0.92
SZRD1-208ENST00000476423 ATRIPQ8WXE1 791 aa9.28□□□□□ -0.92
SZRD1-208ENST00000476423 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
SZRD1-208ENST00000476423 OSBP2Q969R2 916 aa9.28□□□□□ -0.92
SZRD1-208ENST00000476423 KIFC2Q96AC6 838 aa9.28□□□□□ -0.92
SZRD1-208ENST00000476423 KATNAL1Q9BW62 490 aa9.28□□□□□ -0.92
SZRD1-208ENST00000476423 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
SZRD1-208ENST00000476423 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa9.28□□□□□ -0.92
SZRD1-208ENST00000476423 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
SZRD1-208ENST00000476423 LIMD1Q9UGP4 676 aa9.28□□□□□ -0.92
SZRD1-208ENST00000476423 FEM1BQ9UK73 627 aa9.28□□□□□ -0.92
SZRD1-208ENST00000476423 GMEB2Q9UKD1 530 aa9.28□□□□□ -0.92
SZRD1-208ENST00000476423 USTQ9Y2C2 406 aa9.28□□□□□ -0.92
SZRD1-208ENST00000476423 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa9.28□□□□□ -0.92
SZRD1-208ENST00000476423 MYO10Q9HD67 2058 aa9.28□□□□□ -0.92
SZRD1-208ENST00000476423 FANCMQ8IYD8 2048 aa9.27□□□□□ -0.92
SZRD1-208ENST00000476423 PLIN4Q96Q06 1357 aa9.27□□□□□ -0.93
SZRD1-208ENST00000476423 B4DLN1 442 aa9.27□□□□□ -0.93
SZRD1-208ENST00000476423 C2CD4DB7Z1M9 353 aa9.27□□□□□ -0.93
SZRD1-208ENST00000476423 F5H6K3 240 aa9.27□□□□□ -0.93
SZRD1-208ENST00000476423 CSPG5O95196 566 aa9.27□□□□□ -0.93
SZRD1-208ENST00000476423 SP100P23497 879 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
SZRD1-208ENST00000476423 TECP42680 631 aa9.27□□□□□ -0.93
SZRD1-208ENST00000476423 MTHFRP42898 656 aa9.27□□□□□ -0.93
SZRD1-208ENST00000476423 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
SZRD1-208ENST00000476423 SNAP25P60880 206 aa9.27□□□□□ -0.93
SZRD1-208ENST00000476423 PDE4BQ07343 736 aa9.27□□□□□ -0.93
SZRD1-208ENST00000476423 KLRC3Q07444 240 aa9.27□□□□□ -0.93
SZRD1-208ENST00000476423 TDGQ13569 410 aa9.27□□□□□ -0.93
SZRD1-208ENST00000476423 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa9.27□□□□□ -0.93
SZRD1-208ENST00000476423 SIX5Q8N196 739 aa9.27□□□□□ -0.93
SZRD1-208ENST00000476423 CRIPAKQ8N1N5 446 aa9.27□□□□□ -0.93
SZRD1-208ENST00000476423 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
SZRD1-208ENST00000476423 SCFD2Q8WU76 684 aa9.27□□□□□ -0.93
SZRD1-208ENST00000476423 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa9.27□□□□□ -0.93
SZRD1-208ENST00000476423 CEP95Q96GE4 821 aa9.27□□□□□ -0.93
SZRD1-208ENST00000476423 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
SZRD1-208ENST00000476423 CTAGE1Q96RT6 745 aa9.27□□□□□ -0.93
SZRD1-208ENST00000476423 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
SZRD1-208ENST00000476423 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP9.27□□□□□ -0.93
SZRD1-208ENST00000476423 WNT16Q9UBV4 365 aa9.27□□□□□ -0.93
SZRD1-208ENST00000476423 MYO7AQ13402 2215 aa9.27□□□□□ -0.93
SZRD1-208ENST00000476423 MINDY4BA8MYZ0 360 aa9.26□□□□□ -0.93
SZRD1-208ENST00000476423 TAF4O00268 1085 aa9.26□□□□□ -0.93
SZRD1-208ENST00000476423 FOXP2O15409 715 aa9.26□□□□□ -0.93
SZRD1-208ENST00000476423 ITGB1P05556 798 aa9.26□□□□□ -0.93
SZRD1-208ENST00000476423 MMP3P08254 477 aa9.26□□□□□ -0.93
SZRD1-208ENST00000476423 LINC00271P0C7V0 271 aa9.26□□□□□ -0.93
SZRD1-208ENST00000476423 RING1Q06587 406 aa9.26□□□□□ -0.93
SZRD1-208ENST00000476423 DUSP6Q16828 381 aa9.26□□□□□ -0.93
SZRD1-208ENST00000476423 TRAF7Q6Q0C0 670 aa9.26□□□□□ -0.93
SZRD1-208ENST00000476423 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa9.26□□□□□ -0.93
SZRD1-208ENST00000476423 AMOTL1Q8IY63 956 aa9.26□□□□□ -0.93
SZRD1-208ENST00000476423 RASGRP4Q8TDF6 673 aa9.26□□□□□ -0.93
SZRD1-208ENST00000476423 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
SZRD1-208ENST00000476423 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
SZRD1-208ENST00000476423 ERVK-5Q9HDB9 667 aa9.26□□□□□ -0.93
SZRD1-208ENST00000476423 CYP26B1Q9NR63 512 aa9.26□□□□□ -0.93
SZRD1-208ENST00000476423 RNF146Q9NTX7 359 aa9.26□□□□□ -0.93
SZRD1-208ENST00000476423 DACH1Q9UI36 760 aa9.26□□□□□ -0.93
SZRD1-208ENST00000476423 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa9.26□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms