RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475195.5

ATG4B-216, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 762 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-216ENST00000475195 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa18.81■□□□□ 0.6
ATG4B-216ENST00000475195 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa18.8■□□□□ 0.6
ATG4B-216ENST00000475195 EDIL3O43854 480 aa18.8■□□□□ 0.6
ATG4B-216ENST00000475195 B4GALT4O60513 344 aa18.8■□□□□ 0.6
ATG4B-216ENST00000475195 FDPSP14324 419 aaKnown RBP18.8■□□□□ 0.6
ATG4B-216ENST00000475195 NLRP5P59047 1200 aa18.8■□□□□ 0.6
ATG4B-216ENST00000475195 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP18.8■□□□□ 0.6
ATG4B-216ENST00000475195 DAGLBQ8NCG7 672 aa18.8■□□□□ 0.6
ATG4B-216ENST00000475195 BADQ92934 168 aa18.8■□□□□ 0.6
ATG4B-216ENST00000475195 TRPV6Q9H1D0 765 aa18.8■□□□□ 0.6
ATG4B-216ENST00000475195 PCDHA4Q9UN74 947 aa18.8■□□□□ 0.6
ATG4B-216ENST00000475195 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa18.79■□□□□ 0.6
ATG4B-216ENST00000475195 ARP10275 920 aa18.79■□□□□ 0.6
ATG4B-216ENST00000475195 RAG1P15918 1043 aa18.79■□□□□ 0.6
ATG4B-216ENST00000475195 CIITAP33076 1130 aa18.79■□□□□ 0.6
ATG4B-216ENST00000475195 NECAB1Q8N987 351 aa18.79■□□□□ 0.6
ATG4B-216ENST00000475195 AIFM3Q96NN9 605 aa18.79■□□□□ 0.6
ATG4B-216ENST00000475195 PHF20Q9BVI0 1012 aa18.79■□□□□ 0.6
ATG4B-216ENST00000475195 KATNAL1Q9BW62 490 aa18.79■□□□□ 0.6
ATG4B-216ENST00000475195 PCDH10Q9P2E7 1040 aa18.79■□□□□ 0.6
ATG4B-216ENST00000475195 NFASCO94856 1347 aa18.78■□□□□ 0.6
ATG4B-216ENST00000475195 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa18.78■□□□□ 0.6
ATG4B-216ENST00000475195 FAM86B1E9PN63 330 aa18.78■□□□□ 0.6
ATG4B-216ENST00000475195 SORBS3O60504 671 aa18.78■□□□□ 0.6
ATG4B-216ENST00000475195 FAM86B2P0C5J1 330 aa18.78■□□□□ 0.6
ATG4B-216ENST00000475195 PSEN2P49810 448 aa18.78■□□□□ 0.6
ATG4B-216ENST00000475195 USP11P51784 963 aa18.78■□□□□ 0.6
ATG4B-216ENST00000475195 MFSD5Q6N075 450 aa18.78■□□□□ 0.6
ATG4B-216ENST00000475195 BLIDQ8IZY5 108 aa18.78■□□□□ 0.6
ATG4B-216ENST00000475195 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
ATG4B-216ENST00000475195 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP18.78■□□□□ 0.6
ATG4B-216ENST00000475195 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
ATG4B-216ENST00000475195 TELO2Q9Y4R8 837 aa18.78■□□□□ 0.6
ATG4B-216ENST00000475195 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa18.78■□□□□ 0.6
ATG4B-216ENST00000475195 DOCK5Q9H7D0 1870 aa18.77■□□□□ 0.6
ATG4B-216ENST00000475195 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa18.77■□□□□ 0.6
ATG4B-216ENST00000475195 ST3GAL1Q11201 340 aa18.77■□□□□ 0.6
ATG4B-216ENST00000475195 RASGRP4Q8TDF6 673 aa18.77■□□□□ 0.6
ATG4B-216ENST00000475195 SEPT1Q8WYJ6 367 aa18.77■□□□□ 0.6
ATG4B-216ENST00000475195 WASF1Q92558 559 aa18.77■□□□□ 0.6
ATG4B-216ENST00000475195 CTAGE1Q96RT6 745 aa18.77■□□□□ 0.6
ATG4B-216ENST00000475195 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
ATG4B-216ENST00000475195 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
ATG4B-216ENST00000475195 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.6
ATG4B-216ENST00000475195 H3BRB1 525 aa18.76■□□□□ 0.59
ATG4B-216ENST00000475195 NOP56O00567 594 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
ATG4B-216ENST00000475195 LGALS2P05162 132 aa18.76■□□□□ 0.59
ATG4B-216ENST00000475195 XBP1P17861 261 aa18.76■□□□□ 0.59
ATG4B-216ENST00000475195 MFSD10Q14728 455 aa18.76■□□□□ 0.59
ATG4B-216ENST00000475195 RABEP1Q15276 862 aa18.76■□□□□ 0.59
ATG4B-216ENST00000475195 KIAA0753Q2KHM9 967 aa18.76■□□□□ 0.59
ATG4B-216ENST00000475195 TDHQ8IZJ6 230 aa18.76■□□□□ 0.59
ATG4B-216ENST00000475195 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
ATG4B-216ENST00000475195 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
ATG4B-216ENST00000475195 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
ATG4B-216ENST00000475195 HDAC6Q9UBN7 1215 aa18.76■□□□□ 0.59
ATG4B-216ENST00000475195 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa18.76■□□□□ 0.59
ATG4B-216ENST00000475195 DHX15O43143 795 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
ATG4B-216ENST00000475195 ATG7O95352 703 aa18.75■□□□□ 0.59
ATG4B-216ENST00000475195 ZNF286BP0CG31 522 aa18.75■□□□□ 0.59
ATG4B-216ENST00000475195 HOXC8P31273 242 aa18.75■□□□□ 0.59
ATG4B-216ENST00000475195 ZNF76P36508 570 aa18.75■□□□□ 0.59
ATG4B-216ENST00000475195 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
ATG4B-216ENST00000475195 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
ATG4B-216ENST00000475195 TBC1D32Q96NH3 1257 aa18.75■□□□□ 0.59
ATG4B-216ENST00000475195 HIPK3Q9H422 1215 aa18.75■□□□□ 0.59
ATG4B-216ENST00000475195 KCNJ14Q9UNX9 436 aa18.75■□□□□ 0.59
ATG4B-216ENST00000475195 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa18.74■□□□□ 0.59
ATG4B-216ENST00000475195 DTNBO60941 627 aa18.74■□□□□ 0.59
ATG4B-216ENST00000475195 CYP3A7P24462 503 aa18.74■□□□□ 0.59
ATG4B-216ENST00000475195 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
ATG4B-216ENST00000475195 FPGSQ05932 587 aa18.74■□□□□ 0.59
ATG4B-216ENST00000475195 LRIT3Q3SXY7 679 aa18.74■□□□□ 0.59
ATG4B-216ENST00000475195 FAM47CQ5HY64 1035 aa18.74■□□□□ 0.59
ATG4B-216ENST00000475195 PLA2G4DQ86XP0 818 aa18.74■□□□□ 0.59
ATG4B-216ENST00000475195 C7orf31Q8N865 590 aa18.74■□□□□ 0.59
ATG4B-216ENST00000475195 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa18.74■□□□□ 0.59
ATG4B-216ENST00000475195 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
ATG4B-216ENST00000475195 ALG1Q9BT22 464 aa18.74■□□□□ 0.59
ATG4B-216ENST00000475195 BACH2Q9BYV9 841 aa18.74■□□□□ 0.59
ATG4B-216ENST00000475195 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
ATG4B-216ENST00000475195 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
ATG4B-216ENST00000475195 GJB4Q9NTQ9 266 aa18.74■□□□□ 0.59
ATG4B-216ENST00000475195 SLC9A2Q9UBY0 812 aa18.74■□□□□ 0.59
ATG4B-216ENST00000475195 LAMA3Q16787 3333 aa18.74■□□□□ 0.59
ATG4B-216ENST00000475195 PITPNM1O00562 1244 aa18.73■□□□□ 0.59
ATG4B-216ENST00000475195 LGR5O75473 907 aa18.73■□□□□ 0.59
ATG4B-216ENST00000475195 CYP2C9P11712 490 aa18.73■□□□□ 0.59
ATG4B-216ENST00000475195 CYP2C18P33260 490 aa18.73■□□□□ 0.59
ATG4B-216ENST00000475195 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP18.73■□□□□ 0.59
ATG4B-216ENST00000475195 EPHB4P54760 987 aa18.73■□□□□ 0.59
ATG4B-216ENST00000475195 SETQ01105 290 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
ATG4B-216ENST00000475195 RBL2Q08999 1139 aa18.73■□□□□ 0.59
ATG4B-216ENST00000475195 PTGISQ16647 500 aa18.73■□□□□ 0.59
ATG4B-216ENST00000475195 C16orf59Q7L2K0 433 aa18.73■□□□□ 0.59
ATG4B-216ENST00000475195 TMEM199Q8N511 208 aa18.73■□□□□ 0.59
ATG4B-216ENST00000475195 TBCKQ8TEA7 893 aa18.73■□□□□ 0.59
ATG4B-216ENST00000475195 LENG9Q96B70 501 aa18.73■□□□□ 0.59
ATG4B-216ENST00000475195 MBOAT7Q96N66 472 aa18.73■□□□□ 0.59
ATG4B-216ENST00000475195 SDF4Q9BRK5 362 aa18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms