RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 SRLQ86TD4 932 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM130Q8N3G9 435 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGGTB-209ENST00000473406 JADE3Q92613 823 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGGTB-209ENST00000473406 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
RABGGTB-209ENST00000473406 TCTN2Q96GX1 697 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGGTB-209ENST00000473406 CHAMP1Q96JM3 812 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
RABGGTB-209ENST00000473406 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
RABGGTB-209ENST00000473406 KCNJ15Q99712 375 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGGTB-209ENST00000473406 DUSP23Q9BVJ7 150 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGGTB-209ENST00000473406 PCIF1Q9H4Z3 704 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGGTB-209ENST00000473406 SMURF1Q9HCE7 757 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGGTB-209ENST00000473406 ANAPC4Q9UJX5 808 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGGTB-209ENST00000473406 DMTF1Q9Y222 760 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGGTB-209ENST00000473406 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
RABGGTB-209ENST00000473406 A6NNZ2 444 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGGTB-209ENST00000473406 TPP1O14773 563 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF205O95201 554 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGGTB-209ENST00000473406 KRT15P19012 456 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGGTB-209ENST00000473406 STK3Q13188 491 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGGTB-209ENST00000473406 LSAMPQ13449 338 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGGTB-209ENST00000473406 PDCD1Q15116 288 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGGTB-209ENST00000473406 XRRA1Q6P2D8 792 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGGTB-209ENST00000473406 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM186BQ8IYM0 893 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGGTB-209ENST00000473406 CPXCR1Q8N123 301 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGGTB-209ENST00000473406 MIER2Q8N344 545 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGGTB-209ENST00000473406 ZBTB34Q8NCN2 500 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGGTB-209ENST00000473406 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGGTB-209ENST00000473406 MYD88Q99836 296 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGGTB-209ENST00000473406 HERPUD2Q9BSE4 406 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGGTB-209ENST00000473406 CEP41Q9BYV8 373 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM204AQ9H8W3 233 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGGTB-209ENST00000473406 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP7.53□□□□□ -1.2
RABGGTB-209ENST00000473406 FBXL7Q9UJT9 491 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGGTB-209ENST00000473406 DVL2O14641 736 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 ZBED1O96006 694 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 MYBP10242 640 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 ELNP15502 786 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 HALP42357 657 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 JAM2P57087 298 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 KRT76Q01546 638 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 KRT72Q14CN4 511 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 GPR19Q15760 415 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 LONRF1Q17RB8 773 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 SGO2Q562F6 1265 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 RTP2Q5QGT7 225 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 HHIPL2Q6UWX4 724 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 FRMD7Q6ZUT3 714 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 OSTM1Q86WC4 334 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 SSH1Q8WYL5 1049 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 TRIM11Q96F44 468 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 ACAP3Q96P50 834 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 ORAI2Q96SN7 254 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 SENP7Q9BQF6 1050 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 CDIP1Q9H305 208 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 DNAJC28Q9NX36 388 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 CLDND1Q9NY35 253 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 LUZP4Q9P127 313 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 LZTS1Q9Y250 596 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 HIP1RO75146 1068 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 LEFTY1O75610 366 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 ALX3O95076 343 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 SETSIPP0DME0 302 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 GTF2A2P52657 109 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 KIF11P52732 1056 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 ADKP55263 362 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 RPL11P62913 178 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 TNK2Q07912 1038 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 LMOD3Q0VAK6 560 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 ATAT1Q5SQI0 421 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 LILRA6Q6PI73 481 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 C22orf34Q6ZV56 151 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 CPNE8Q86YQ8 564 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 NME8Q8N427 588 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 HPS3Q969F9 1004 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM169Q96HH4 297 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 PTCHD1Q96NR3 888 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 GPR62Q9BZJ7 368 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 ZMAT4Q9H898 229 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 RRAGCQ9HB90 399 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 C1GALT1Q9NS00 363 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 LCHNA4D1U4 455 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM229AH3BQW9 127 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 KCNK3O14649 394 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 NBNO60934 754 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 SYPP08247 313 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.1 ms