RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463369.5

SHQ1-203, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SHQ1, Length 2,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-203ENST00000463369 CCDC40Q4G0X9 1142 aa9.61□□□□□ -0.87
SHQ1-203ENST00000463369 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa9.61□□□□□ -0.87
SHQ1-203ENST00000463369 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
SHQ1-203ENST00000463369 CYP26C1Q6V0L0 522 aa9.61□□□□□ -0.87
SHQ1-203ENST00000463369 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
SHQ1-203ENST00000463369 TAOK3Q9H2K8 898 aa9.61□□□□□ -0.87
SHQ1-203ENST00000463369 VCPKMTQ9H867 229 aa9.61□□□□□ -0.87
SHQ1-203ENST00000463369 DBNDD1Q9H9R9 158 aa9.61□□□□□ -0.87
SHQ1-203ENST00000463369 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
SHQ1-203ENST00000463369 HPS5Q9UPZ3 1129 aa9.61□□□□□ -0.87
SHQ1-203ENST00000463369 MYH1P12882 1939 aa9.61□□□□□ -0.87
SHQ1-203ENST00000463369 ZMYM6O95789 1325 aa9.61□□□□□ -0.87
SHQ1-203ENST00000463369 MYH8P13535 1937 aa9.6□□□□□ -0.87
SHQ1-203ENST00000463369 USP17L3A6NCW0 530 aa9.6□□□□□ -0.87
SHQ1-203ENST00000463369 USP17L4A6NCW7 530 aa9.6□□□□□ -0.87
SHQ1-203ENST00000463369 NFKBIEO00221 500 aa9.6□□□□□ -0.87
SHQ1-203ENST00000463369 RTN2O75298 545 aa9.6□□□□□ -0.87
SHQ1-203ENST00000463369 COL6A1P12109 1028 aa9.6□□□□□ -0.87
SHQ1-203ENST00000463369 IARSP41252 1262 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
SHQ1-203ENST00000463369 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
SHQ1-203ENST00000463369 RACK1P63244 317 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
SHQ1-203ENST00000463369 GTF2IP78347 998 aa9.6□□□□□ -0.87
SHQ1-203ENST00000463369 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
SHQ1-203ENST00000463369 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
SHQ1-203ENST00000463369 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
SHQ1-203ENST00000463369 MTMR3Q13615 1198 aa9.6□□□□□ -0.87
SHQ1-203ENST00000463369 LRRC41Q15345 812 aa9.6□□□□□ -0.87
SHQ1-203ENST00000463369 PPP4R4Q6NUP7 873 aa9.6□□□□□ -0.87
SHQ1-203ENST00000463369 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
SHQ1-203ENST00000463369 USP17L2Q6R6M4 530 aa9.6□□□□□ -0.87
SHQ1-203ENST00000463369 USP17L1Q7RTZ2 530 aa9.6□□□□□ -0.87
SHQ1-203ENST00000463369 DEPDC4Q8N2C3 294 aa9.6□□□□□ -0.87
SHQ1-203ENST00000463369 SAMD3Q8N6K7 520 aa9.6□□□□□ -0.87
SHQ1-203ENST00000463369 MAGEB6Q8N7X4 407 aa9.6□□□□□ -0.87
SHQ1-203ENST00000463369 APPBP2Q92624 585 aa9.6□□□□□ -0.87
SHQ1-203ENST00000463369 CTAGE1Q96RT6 745 aa9.6□□□□□ -0.87
SHQ1-203ENST00000463369 HDAC6Q9UBN7 1215 aa9.6□□□□□ -0.87
SHQ1-203ENST00000463369 GGA2Q9UJY4 613 aa9.6□□□□□ -0.87
SHQ1-203ENST00000463369 JAG2Q9Y219 1238 aa9.6□□□□□ -0.87
SHQ1-203ENST00000463369 ITIH6Q6UXX5 1313 aa9.6□□□□□ -0.87
SHQ1-203ENST00000463369 ZNF532Q9HCE3 1301 aa9.6□□□□□ -0.87
SHQ1-203ENST00000463369 FAM196BA6NMK8 535 aa9.6□□□□□ -0.87
SHQ1-203ENST00000463369 CPLX1O14810 134 aa9.6□□□□□ -0.87
SHQ1-203ENST00000463369 SPTLC1O15269 473 aa9.6□□□□□ -0.87
SHQ1-203ENST00000463369 PRMT3O60678 531 aa9.6□□□□□ -0.87
SHQ1-203ENST00000463369 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
SHQ1-203ENST00000463369 RRM1P23921 792 aa9.6□□□□□ -0.87
SHQ1-203ENST00000463369 SERINC3Q13530 473 aa9.6□□□□□ -0.87
SHQ1-203ENST00000463369 FILIP1LQ4L180 1135 aa9.6□□□□□ -0.87
SHQ1-203ENST00000463369 CEP85LQ5SZL2 805 aa9.6□□□□□ -0.87
SHQ1-203ENST00000463369 SPATA1Q5VX52 437 aa9.6□□□□□ -0.87
SHQ1-203ENST00000463369 MAGEC3Q8TD91 643 aa9.6□□□□□ -0.87
SHQ1-203ENST00000463369 EPS8L1Q8TE68 723 aa9.6□□□□□ -0.87
SHQ1-203ENST00000463369 OSBP2Q969R2 916 aa9.6□□□□□ -0.87
SHQ1-203ENST00000463369 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
SHQ1-203ENST00000463369 SLF1Q9BQI6 1058 aa9.6□□□□□ -0.87
SHQ1-203ENST00000463369 PPCSQ9HAB8 311 aa9.6□□□□□ -0.87
SHQ1-203ENST00000463369 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa9.6□□□□□ -0.87
SHQ1-203ENST00000463369 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa9.59□□□□□ -0.87
SHQ1-203ENST00000463369 YDJCA8MPS7 323 aa9.59□□□□□ -0.87
SHQ1-203ENST00000463369 ENC1O14682 589 aa9.59□□□□□ -0.87
SHQ1-203ENST00000463369 SRGAP2O75044 1071 aa9.59□□□□□ -0.87
SHQ1-203ENST00000463369 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
SHQ1-203ENST00000463369 LDHBP07195 334 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
SHQ1-203ENST00000463369 PRDX5P30044 214 aa9.59□□□□□ -0.87
SHQ1-203ENST00000463369 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
SHQ1-203ENST00000463369 ATP2B2Q01814 1243 aa9.59□□□□□ -0.87
SHQ1-203ENST00000463369 MECOMQ03112 1051 aa9.59□□□□□ -0.87
SHQ1-203ENST00000463369 PDCLQ13371 301 aa9.59□□□□□ -0.87
SHQ1-203ENST00000463369 DRP2Q13474 957 aa9.59□□□□□ -0.87
SHQ1-203ENST00000463369 MFSD14BQ5SR56 506 aa9.59□□□□□ -0.87
SHQ1-203ENST00000463369 STRIP1Q5VSL9 837 aa9.59□□□□□ -0.87
SHQ1-203ENST00000463369 CDKAL1Q5VV42 579 aa9.59□□□□□ -0.87
SHQ1-203ENST00000463369 ALS2CLQ60I27 953 aa9.59□□□□□ -0.87
SHQ1-203ENST00000463369 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
SHQ1-203ENST00000463369 CCDC13Q8IYE1 715 aa9.59□□□□□ -0.87
SHQ1-203ENST00000463369 ZNF384Q8TF68 577 aa9.59□□□□□ -0.87
SHQ1-203ENST00000463369 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
SHQ1-203ENST00000463369 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
SHQ1-203ENST00000463369 EPN3Q9H201 632 aa9.59□□□□□ -0.87
SHQ1-203ENST00000463369 SLC40A1Q9NP59 571 aa9.59□□□□□ -0.87
SHQ1-203ENST00000463369 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
SHQ1-203ENST00000463369 KCNQ5Q9NR82 932 aa9.59□□□□□ -0.87
SHQ1-203ENST00000463369 ENAMQ9NRM1 1142 aa9.59□□□□□ -0.87
SHQ1-203ENST00000463369 ABHD10Q9NUJ1 306 aa9.59□□□□□ -0.87
SHQ1-203ENST00000463369 EGFL7Q9UHF1 273 aa9.59□□□□□ -0.87
SHQ1-203ENST00000463369 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
SHQ1-203ENST00000463369 GUCA1BQ9UMX6 200 aa9.59□□□□□ -0.87
SHQ1-203ENST00000463369 MAST3O60307 1309 aa9.59□□□□□ -0.87
SHQ1-203ENST00000463369 TIAM2Q8IVF5 1701 aa9.59□□□□□ -0.87
SHQ1-203ENST00000463369 A0A1B0GUA9 196 aa9.59□□□□□ -0.87
SHQ1-203ENST00000463369 GOLGA8BA8MQT2 603 aa9.59□□□□□ -0.87
SHQ1-203ENST00000463369 M0R2C6 588 aa9.59□□□□□ -0.87
SHQ1-203ENST00000463369 TBX3O15119 743 aa9.59□□□□□ -0.87
SHQ1-203ENST00000463369 CDR1P51861 262 aa9.59□□□□□ -0.87
SHQ1-203ENST00000463369 DIXDC1Q155Q3 683 aa9.59□□□□□ -0.87
SHQ1-203ENST00000463369 GRIK5Q16478 980 aa9.59□□□□□ -0.87
SHQ1-203ENST00000463369 TTMPQ5BVD1 217 aa9.59□□□□□ -0.87
SHQ1-203ENST00000463369 NAA35Q5VZE5 725 aa9.59□□□□□ -0.87
SHQ1-203ENST00000463369 CCDC50Q8IVM0 306 aa9.59□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms