RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410938.1

RNU6-1328P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1328, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1328P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1328P-201ENST00000410938 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 HTRA3P83110 453 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 LAPTM5Q13571 262 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 ODF1Q14990 250 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 KRT72Q14CN4 511 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 TMEM132BQ14DG7 1078 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 UGT8Q16880 541 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 SFRP5Q5T4F7 317 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 ANKRD34AQ69YU3 496 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 ABHD17CQ6PCB6 329 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 FAM180AQ6UWF9 173 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 DPP9Q86TI2 863 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 DENND1CQ8IV53 801 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 DRC7Q8IY82 874 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 NLGN4XQ8N0W4 816 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 DTWD1Q8N5C7 304 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 PPM1NQ8N819 430 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 KIAA1958Q8N8K9 716 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 ZNF610Q8N9Z0 462 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 ZBTB34Q8NCN2 500 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 FAM156AQ8NDB6 213 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 UBASH3BQ8TF42 649 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 FERMT2Q96AC1 680 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 SKA1Q96BD8 255 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 SLC39A13Q96H72 371 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 TMEM169Q96HH4 297 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 TBCBQ99426 244 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 CDADC1Q9BWV3 514 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 MYLK2Q9H1R3 596 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 VPS11Q9H270 941 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 VTA1Q9NP79 307 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 KMT5AQ9NQR1 393 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 PRDM10Q9NQV6 1147 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 LRRC4BQ9NT99 713 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 SPO11Q9Y5K1 396 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 DGKBQ9Y6T7 804 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 A0A1W2PQJ5 194 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 CAPN8A6NHC0 703 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 LRRC10BA6NIK2 292 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 GNAT3A8MTJ3 354 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 PIK3R2O00459 728 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 KRIT1O00522 736 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 SCDO00767 359 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 MAFKO60675 156 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 DGKIO75912 1065 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 APOL3O95236 402 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 LDHCP07864 332 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 COL6A1P12109 1028 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 PDE6AP16499 860 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 KCNA6P17658 529 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 SERPINB3P29508 390 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 CHKAP35790 457 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 TECP42680 631 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 KIR3DL1P43629 444 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 BAG6P46379 1132 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 BCAR1P56945 870 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 TNFAIP2Q03169 654 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 TERF2Q15554 542 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 GPR19Q15760 415 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 INAVAQ3KP66 663 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 TOR2AQ5JU69 321 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 RNF220Q5VTB9 566 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 PPP4R3AQ6IN85 833 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 XRRA1Q6P2D8 792 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 PGBD2Q6P3X8 592 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 TRIM67Q6ZTA4 783 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 OVCH1Q7RTY7 1134 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 WAPLQ7Z5K2 1190 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 OSTM1Q86WC4 334 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 NME9Q86XW9 330 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 FAM43AQ8N2R8 423 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.4 ms