RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000371935.6

REXO4-201, Transcript of REX4 homolog, 3'-5' exonuclease, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene REXO4, Length 1,899 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO4-201ENST00000371935 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
REXO4-201ENST00000371935 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
REXO4-201ENST00000371935 MXRA8Q9BRK3 442 aa28.09■■■□□ 2.09
REXO4-201ENST00000371935 VPS16Q9H269 839 aa28.09■■■□□ 2.09
REXO4-201ENST00000371935 PANK4Q9NVE7 773 aa28.09■■■□□ 2.09
REXO4-201ENST00000371935 ARP10275 920 aa28.08■■■□□ 2.09
REXO4-201ENST00000371935 PSMC6P62333 389 aa28.08■■■□□ 2.09
REXO4-201ENST00000371935 TC2NQ8N9U0 490 aa28.08■■■□□ 2.09
REXO4-201ENST00000371935 REPS2Q8NFH8 660 aa28.08■■■□□ 2.09
REXO4-201ENST00000371935 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
REXO4-201ENST00000371935 DNM3Q9UQ16 869 aa28.08■■■□□ 2.09
REXO4-201ENST00000371935 ITIH6Q6UXX5 1313 aa28.08■■■□□ 2.09
REXO4-201ENST00000371935 SLC30A10Q6XR72 485 aa28.08■■■□□ 2.09
REXO4-201ENST00000371935 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa28.08■■■□□ 2.09
REXO4-201ENST00000371935 GAS7O60861 476 aa28.07■■■□□ 2.08
REXO4-201ENST00000371935 PRKG1Q13976 671 aa28.07■■■□□ 2.08
REXO4-201ENST00000371935 ARSHQ5FYA8 562 aa28.07■■■□□ 2.08
REXO4-201ENST00000371935 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
REXO4-201ENST00000371935 IL31RAQ8NI17 732 aa28.07■■■□□ 2.08
REXO4-201ENST00000371935 TRERF1Q96PN7 1200 aa28.07■■■□□ 2.08
REXO4-201ENST00000371935 ZNF577Q9BSK1 485 aa28.07■■■□□ 2.08
REXO4-201ENST00000371935 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa28.07■■■□□ 2.08
REXO4-201ENST00000371935 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
REXO4-201ENST00000371935 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa28.06■■■□□ 2.08
REXO4-201ENST00000371935 USP27XA6NNY8 438 aa28.06■■■□□ 2.08
REXO4-201ENST00000371935 DSG3P32926 999 aa28.06■■■□□ 2.08
REXO4-201ENST00000371935 CYP4A11Q02928 519 aa28.06■■■□□ 2.08
REXO4-201ENST00000371935 C9orf131Q5VYM1 1079 aa28.06■■■□□ 2.08
REXO4-201ENST00000371935 KRT26Q7Z3Y9 468 aa28.06■■■□□ 2.08
REXO4-201ENST00000371935 TMEM139Q8IV31 216 aa28.06■■■□□ 2.08
REXO4-201ENST00000371935 CCDC65Q8IXS2 484 aa28.06■■■□□ 2.08
REXO4-201ENST00000371935 KCTD17Q8N5Z5 321 aa28.06■■■□□ 2.08
REXO4-201ENST00000371935 HSD17B14Q9BPX1 270 aa28.06■■■□□ 2.08
REXO4-201ENST00000371935 PTPRFP10586 1907 aa28.06■■■□□ 2.08
REXO4-201ENST00000371935 FRMD3A2A2Y4 597 aa28.06■■■□□ 2.08
REXO4-201ENST00000371935 BCRP11274 1271 aa28.06■■■□□ 2.08
REXO4-201ENST00000371935 ITGB5P18084 799 aa28.06■■■□□ 2.08
REXO4-201ENST00000371935 FAM26FQ5R3K3 315 aa28.06■■■□□ 2.08
REXO4-201ENST00000371935 DLK2Q6UY11 383 aa28.06■■■□□ 2.08
REXO4-201ENST00000371935 NIPA1Q7RTP0 329 aa28.06■■■□□ 2.08
REXO4-201ENST00000371935 CREBRFQ8IUR6 639 aa28.06■■■□□ 2.08
REXO4-201ENST00000371935 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
REXO4-201ENST00000371935 WDR11Q9BZH6 1224 aa28.06■■■□□ 2.08
REXO4-201ENST00000371935 TUFT1Q9NNX1 390 aa28.06■■■□□ 2.08
REXO4-201ENST00000371935 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
REXO4-201ENST00000371935 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa28.06■■■□□ 2.08
REXO4-201ENST00000371935 RPS6P62753 249 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
REXO4-201ENST00000371935 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP28.05■■■□□ 2.087e-7■■□□□ 11.4
REXO4-201ENST00000371935 PCNX4Q63HM2 1172 aa28.05■■■□□ 2.08
REXO4-201ENST00000371935 B3GNT9Q6UX72 402 aa28.05■■■□□ 2.08
REXO4-201ENST00000371935 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
REXO4-201ENST00000371935 GLIS3Q8NEA6 775 aa28.05■■■□□ 2.08
REXO4-201ENST00000371935 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
REXO4-201ENST00000371935 RGL1Q9NZL6 768 aa28.05■■■□□ 2.08
REXO4-201ENST00000371935 TMOD4Q9NZQ9 345 aa28.05■■■□□ 2.08
REXO4-201ENST00000371935 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa28.05■■■□□ 2.08
REXO4-201ENST00000371935 ADM5C9JUS6 153 aa28.04■■■□□ 2.08
REXO4-201ENST00000371935 OAZ1P54368 228 aa28.04■■■□□ 2.08
REXO4-201ENST00000371935 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa28.04■■■□□ 2.08
REXO4-201ENST00000371935 RIPK3Q9Y572 518 aa28.04■■■□□ 2.08
REXO4-201ENST00000371935 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa28.04■■■□□ 2.08
REXO4-201ENST00000371935 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
REXO4-201ENST00000371935 CHMP2AO43633 222 aa28.04■■■□□ 2.08
REXO4-201ENST00000371935 ADKP55263 362 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
REXO4-201ENST00000371935 VGLL4Q14135 290 aa28.04■■■□□ 2.08
REXO4-201ENST00000371935 COG2Q14746 738 aa28.04■■■□□ 2.08
REXO4-201ENST00000371935 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
REXO4-201ENST00000371935 FAM114A1Q8IWE2 563 aa28.04■■■□□ 2.08
REXO4-201ENST00000371935 TAAR1Q96RJ0 339 aa28.04■■■□□ 2.08
REXO4-201ENST00000371935 TEKT3Q9BXF9 490 aa28.04■■■□□ 2.08
REXO4-201ENST00000371935 UNC45AQ9H3U1 944 aa28.04■■■□□ 2.08
REXO4-201ENST00000371935 RNF146Q9NTX7 359 aa28.04■■■□□ 2.08
REXO4-201ENST00000371935 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa28.04■■■□□ 2.08
REXO4-201ENST00000371935 LGALS16A8MUM7 142 aa28.03■■■□□ 2.08
REXO4-201ENST00000371935 EYA4O95677 639 aa28.03■■■□□ 2.08
REXO4-201ENST00000371935 KRT18P05783 430 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
REXO4-201ENST00000371935 MAP3K9P80192 1104 aa28.03■■■□□ 2.08
REXO4-201ENST00000371935 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP28.03■■■□□ 2.08
REXO4-201ENST00000371935 LRRC41Q15345 812 aa28.03■■■□□ 2.08
REXO4-201ENST00000371935 SH3D19Q5HYK7 790 aa28.03■■■□□ 2.08
REXO4-201ENST00000371935 FOXR2Q6PJQ5 311 aa28.03■■■□□ 2.08
REXO4-201ENST00000371935 RNF207Q6ZRF8 634 aa28.03■■■□□ 2.08
REXO4-201ENST00000371935 SULF1Q8IWU6 871 aa28.03■■■□□ 2.08
REXO4-201ENST00000371935 MYOCDQ8IZQ8 938 aa28.03■■■□□ 2.08
REXO4-201ENST00000371935 DYDC2Q96IM9 177 aa28.03■■■□□ 2.08
REXO4-201ENST00000371935 RIT2Q99578 217 aa28.03■■■□□ 2.08
REXO4-201ENST00000371935 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
REXO4-201ENST00000371935 SLITRK3O94933 977 aa28.02■■■□□ 2.08
REXO4-201ENST00000371935 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
REXO4-201ENST00000371935 LRRC63Q05C16 580 aa28.02■■■□□ 2.08
REXO4-201ENST00000371935 RBL2Q08999 1139 aa28.02■■■□□ 2.08
REXO4-201ENST00000371935 GIT2Q14161 759 aa28.02■■■□□ 2.08
REXO4-201ENST00000371935 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
REXO4-201ENST00000371935 PPFIBP1Q86W92 1011 aa28.02■■■□□ 2.08
REXO4-201ENST00000371935 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
REXO4-201ENST00000371935 LOC285556D6RIA3 1793 aa28.02■■■□□ 2.08
REXO4-201ENST00000371935 CEP135Q66GS9 1140 aa28.02■■■□□ 2.08
REXO4-201ENST00000371935 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
REXO4-201ENST00000371935 KCNH7Q9NS40 1196 aa28.02■■■□□ 2.08
REXO4-201ENST00000371935 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.9 ms