RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348962.6

PTPRO-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRO, Length 5,061 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-202ENST00000348962 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP16.79■□□□□ 0.28
PTPRO-202ENST00000348962 TBC1D22BQ9NU19 505 aa16.79■□□□□ 0.28
PTPRO-202ENST00000348962 MTMR1Q13613 665 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRO-202ENST00000348962 RCSD1Q6JBY9 416 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRO-202ENST00000348962 STAG1Q8WVM7 1258 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRO-202ENST00000348962 RNF146Q9NTX7 359 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRO-202ENST00000348962 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
PTPRO-202ENST00000348962 CSPG5O95196 566 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRO-202ENST00000348962 GPSM2P81274 684 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRO-202ENST00000348962 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
PTPRO-202ENST00000348962 MICALL1Q8N3F8 863 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRO-202ENST00000348962 MCUR1Q96AQ8 359 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRO-202ENST00000348962 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
PTPRO-202ENST00000348962 VPS72Q15906 364 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRO-202ENST00000348962 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
PTPRO-202ENST00000348962 MFSD14CQ5VZR4 134 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRO-202ENST00000348962 KAZNQ674X7 775 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRO-202ENST00000348962 OTUD5Q96G74 571 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRO-202ENST00000348962 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa16.78■□□□□ 0.28
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PTPRO-202ENST00000348962 TTLL4Q14679 1199 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRO-202ENST00000348962 MESDQ14696 234 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRO-202ENST00000348962 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
PTPRO-202ENST00000348962 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRO-202ENST00000348962 PPP1R16BQ96T49 567 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRO-202ENST00000348962 MSTO1Q9BUK6 570 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRO-202ENST00000348962 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
PTPRO-202ENST00000348962 TSC1Q92574 1164 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRO-202ENST00000348962 ZNF653Q96CK0 615 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRO-202ENST00000348962 BHMT2Q9H2M3 363 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRO-202ENST00000348962 WDR64B1ANS9 1081 aa16.77■□□□□ 0.28
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PTPRO-202ENST00000348962 ATF2P15336 505 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRO-202ENST00000348962 EFCAB13Q8IY85 973 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRO-202ENST00000348962 TTC1Q99614 292 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRO-202ENST00000348962 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
PTPRO-202ENST00000348962 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRO-202ENST00000348962 ZNF131P52739 623 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRO-202ENST00000348962 KRT76Q01546 638 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRO-202ENST00000348962 RFX6Q8HWS3 928 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRO-202ENST00000348962 RUNDC3BQ96NL0 473 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRO-202ENST00000348962 TMEM47Q9BQJ4 181 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRO-202ENST00000348962 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRO-202ENST00000348962 KIF9Q9HAQ2 790 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRO-202ENST00000348962 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRO-202ENST00000348962 GBP1P32455 592 aa16.77■□□□□ 0.27
PTPRO-202ENST00000348962 LMCD1Q9NZU5 365 aa16.77■□□□□ 0.27
PTPRO-202ENST00000348962 PCDHA6Q9UN73 950 aa16.77■□□□□ 0.27
PTPRO-202ENST00000348962 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa16.77■□□□□ 0.27
PTPRO-202ENST00000348962 ABCB11O95342 1321 aa16.77■□□□□ 0.27
PTPRO-202ENST00000348962 GSTA1P08263 222 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRO-202ENST00000348962 GSTA2P09210 222 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRO-202ENST00000348962 MAPK4P31152 587 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRO-202ENST00000348962 GARSP41250 739 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
PTPRO-202ENST00000348962 CEP85LQ5SZL2 805 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRO-202ENST00000348962 RILPQ96NA2 401 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRO-202ENST00000348962 ISCA1Q9BUE6 129 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRO-202ENST00000348962 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
PTPRO-202ENST00000348962 DNAJC24Q6P3W2 148 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRO-202ENST00000348962 TMTC3Q6ZXV5 915 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRO-202ENST00000348962 LINC00301Q8NCQ3 95 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRO-202ENST00000348962 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
PTPRO-202ENST00000348962 DESI2Q9BSY9 194 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRO-202ENST00000348962 HOMER3Q9NSC5 361 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRO-202ENST00000348962 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
PTPRO-202ENST00000348962 PASKQ96RG2 1323 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRO-202ENST00000348962 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
PTPRO-202ENST00000348962 STX2P32856 288 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRO-202ENST00000348962 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
PTPRO-202ENST00000348962 ZNRF3Q9ULT6 936 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRO-202ENST00000348962 RNF40O75150 1001 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRO-202ENST00000348962 CCNE1P24864 410 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRO-202ENST00000348962 SNAP25P60880 206 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRO-202ENST00000348962 MAPK6Q16659 721 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRO-202ENST00000348962 CCNYQ8ND76 341 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRO-202ENST00000348962 FCER1AP12319 257 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRO-202ENST00000348962 PLCG1P19174 1290 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRO-202ENST00000348962 NFKBIAP25963 317 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRO-202ENST00000348962 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
PTPRO-202ENST00000348962 PHKA2P46019 1235 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRO-202ENST00000348962 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
PTPRO-202ENST00000348962 EPHA10Q5JZY3 1008 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRO-202ENST00000348962 OR6B2Q6IFH4 312 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRO-202ENST00000348962 TTBK2Q6IQ55 1244 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRO-202ENST00000348962 CEP57Q86XR8 500 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRO-202ENST00000348962 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
PTPRO-202ENST00000348962 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP16.75■□□□□ 0.27
PTPRO-202ENST00000348962 CDC25AP30304 524 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRO-202ENST00000348962 PSMD6Q15008 389 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRO-202ENST00000348962 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRO-202ENST00000348962 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP16.75■□□□□ 0.27
PTPRO-202ENST00000348962 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRO-202ENST00000348962 SNAP23O00161 211 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRO-202ENST00000348962 LRRN2O75325 713 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRO-202ENST00000348962 DDIT3P35638 169 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRO-202ENST00000348962 C10orf67Q8IYJ2 551 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRO-202ENST00000348962 MTA3Q9BTC8 594 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRO-202ENST00000348962 CYP2D6P10635 497 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRO-202ENST00000348962 PEX3P56589 373 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRO-202ENST00000348962 TNFAIP2Q03169 654 aa16.75■□□□□ 0.27
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