RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345425.6

GIPC1-201, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GIPC1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-201ENST00000345425 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP31.37■■■□□ 2.61
GIPC1-201ENST00000345425 TMEM266Q2M3C6 531 aa31.37■■■□□ 2.61
GIPC1-201ENST00000345425 DTHD1Q6ZMT9 781 aa31.37■■■□□ 2.61
GIPC1-201ENST00000345425 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP31.37■■■□□ 2.61
GIPC1-201ENST00000345425 FERMT2Q96AC1 680 aa31.37■■■□□ 2.61
GIPC1-201ENST00000345425 UIMC1Q96RL1 719 aa31.37■■■□□ 2.61
GIPC1-201ENST00000345425 TEKT3Q9BXF9 490 aa31.37■■■□□ 2.61
GIPC1-201ENST00000345425 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP31.37■■■□□ 2.61
GIPC1-201ENST00000345425 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa31.37■■■□□ 2.61
GIPC1-201ENST00000345425 PSMD10O75832 226 aa31.36■■■□□ 2.61
GIPC1-201ENST00000345425 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP31.36■■■□□ 2.61
GIPC1-201ENST00000345425 SP2Q02086 613 aa31.36■■■□□ 2.61
GIPC1-201ENST00000345425 TNFAIP2Q03169 654 aa31.36■■■□□ 2.61
GIPC1-201ENST00000345425 DUSP28Q4G0W2 176 aa31.36■■■□□ 2.61
GIPC1-201ENST00000345425 TRPV1Q8NER1 839 aa31.36■■■□□ 2.61
GIPC1-201ENST00000345425 GBP4Q96PP9 640 aa31.36■■■□□ 2.61
GIPC1-201ENST00000345425 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa31.35■■■□□ 2.61
GIPC1-201ENST00000345425 GJA10Q969M2 543 aa31.35■■■□□ 2.61
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GIPC1-201ENST00000345425 CNGA1P29973 690 aa31.35■■■□□ 2.61
GIPC1-201ENST00000345425 RAB34Q9BZG1 259 aa31.35■■■□□ 2.61
GIPC1-201ENST00000345425 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP31.34■■■□□ 2.61
GIPC1-201ENST00000345425 SEPT4O43236 478 aa31.34■■■□□ 2.61
GIPC1-201ENST00000345425 GGPS1O95749 300 aa31.34■■■□□ 2.61
GIPC1-201ENST00000345425 SMPD1P17405 629 aa31.34■■■□□ 2.61
GIPC1-201ENST00000345425 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP31.34■■■□□ 2.61
GIPC1-201ENST00000345425 SH3TC2Q8TF17 1288 aa31.34■■■□□ 2.61
GIPC1-201ENST00000345425 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP31.34■■■□□ 2.61
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GIPC1-201ENST00000345425 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP31.33■■■□□ 2.61
GIPC1-201ENST00000345425 METTL7BQ6UX53 244 aa31.33■■■□□ 2.61
GIPC1-201ENST00000345425 CYFIP1Q7L576 1253 aa31.33■■■□□ 2.61
GIPC1-201ENST00000345425 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP31.33■■■□□ 2.61
GIPC1-201ENST00000345425 MLXIPQ9HAP2 919 aa31.33■■■□□ 2.61
GIPC1-201ENST00000345425 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP31.33■■■□□ 2.61
GIPC1-201ENST00000345425 VWA3AA6NCI4 1184 aa31.33■■■□□ 2.61
GIPC1-201ENST00000345425 GH1P01241 217 aa31.33■■■□□ 2.61
GIPC1-201ENST00000345425 TECP42680 631 aa31.33■■■□□ 2.61
GIPC1-201ENST00000345425 ME1P48163 572 aa31.33■■■□□ 2.61
GIPC1-201ENST00000345425 KRT76Q01546 638 aa31.33■■■□□ 2.61
GIPC1-201ENST00000345425 GDPD2Q9HCC8 539 aa31.33■■■□□ 2.61
GIPC1-201ENST00000345425 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP31.33■■■□□ 2.61
GIPC1-201ENST00000345425 SLC9A2Q9UBY0 812 aa31.33■■■□□ 2.61
GIPC1-201ENST00000345425 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP31.33■■■□□ 2.61
GIPC1-201ENST00000345425 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP31.32■■■□□ 2.6
GIPC1-201ENST00000345425 VAV3Q9UKW4 847 aa31.32■■■□□ 2.6
GIPC1-201ENST00000345425 HTTP42858 3142 aa31.31■■■□□ 2.6
GIPC1-201ENST00000345425 ELP1O95163 1332 aa31.31■■■□□ 2.6
GIPC1-201ENST00000345425 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP31.31■■■□□ 2.6
GIPC1-201ENST00000345425 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP31.31■■■□□ 2.6
GIPC1-201ENST00000345425 PPP2R5CQ13362 524 aa31.31■■■□□ 2.6
GIPC1-201ENST00000345425 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP31.31■■■□□ 2.6
GIPC1-201ENST00000345425 Q9Y3F1 56 aa31.31■■■□□ 2.6
GIPC1-201ENST00000345425 DOCK5Q9H7D0 1870 aa31.3■■■□□ 2.6
GIPC1-201ENST00000345425 LAMC2Q13753 1193 aa31.3■■■□□ 2.6
GIPC1-201ENST00000345425 PDIA5Q14554 519 aa31.3■■■□□ 2.6
GIPC1-201ENST00000345425 COPS5Q92905 334 aa31.3■■■□□ 2.6
GIPC1-201ENST00000345425 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP31.3■■■□□ 2.6
GIPC1-201ENST00000345425 ADCY6O43306 1168 aa31.3■■■□□ 2.6
GIPC1-201ENST00000345425 IL17AQ16552 155 aa31.3■■■□□ 2.6
GIPC1-201ENST00000345425 TMEM63BQ5T3F8 832 aa31.3■■■□□ 2.6
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP31.3■■■□□ 2.6
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GIPC1-201ENST00000345425 LONP1P36776 959 aaKnown RBP31.29■■■□□ 2.6
GIPC1-201ENST00000345425 SPIRE1Q08AE8 756 aa31.29■■■□□ 2.6
GIPC1-201ENST00000345425 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP31.29■■■□□ 2.6
GIPC1-201ENST00000345425 IGSF22Q8N9C0 903 aa31.29■■■□□ 2.6
GIPC1-201ENST00000345425 UNC45AQ9H3U1 944 aa31.29■■■□□ 2.6
GIPC1-201ENST00000345425 BCAS3Q9H6U6 928 aa31.29■■■□□ 2.6
GIPC1-201ENST00000345425 SORBS3O60504 671 aa31.28■■■□□ 2.6
GIPC1-201ENST00000345425 MSCO60682 206 aa31.28■■■□□ 2.6
GIPC1-201ENST00000345425 CUTAO60888 179 aa31.28■■■□□ 2.6
GIPC1-201ENST00000345425 RARBP10826 455 aa31.28■■■□□ 2.6
GIPC1-201ENST00000345425 ARHGAP1Q07960 439 aa31.28■■■□□ 2.6
GIPC1-201ENST00000345425 B3GNT9Q6UX72 402 aa31.28■■■□□ 2.6
GIPC1-201ENST00000345425 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP31.28■■■□□ 2.6
GIPC1-201ENST00000345425 OR6J1Q8NGC5 347 aa31.28■■■□□ 2.6
GIPC1-201ENST00000345425 AK8Q96MA6 479 aa31.28■■■□□ 2.6
GIPC1-201ENST00000345425 PCDHA7Q9UN72 937 aa31.28■■■□□ 2.6
GIPC1-201ENST00000345425 CHMP2AO43633 222 aa31.28■■■□□ 2.6
GIPC1-201ENST00000345425 SFNP31947 248 aa31.28■■■□□ 2.6
GIPC1-201ENST00000345425 NCAPH2Q6IBW4 605 aa31.28■■■□□ 2.6
GIPC1-201ENST00000345425 TLK2Q86UE8 772 aa31.28■■■□□ 2.6
GIPC1-201ENST00000345425 SPATA33Q96N06 139 aa31.28■■■□□ 2.6
GIPC1-201ENST00000345425 LRWD1Q9UFC0 647 aa31.28■■■□□ 2.6
GIPC1-201ENST00000345425 POTEMA6NI47 508 aa31.27■■■□□ 2.6
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GIPC1-201ENST00000345425 NOP56O00567 594 aaKnown RBP31.27■■■□□ 2.6
GIPC1-201ENST00000345425 JAK3P52333 1124 aa31.27■■■□□ 2.6
GIPC1-201ENST00000345425 TMEM87AQ8NBN3 555 aa31.27■■■□□ 2.6
GIPC1-201ENST00000345425 RDM1Q8NG50 284 aa31.27■■■□□ 2.6
GIPC1-201ENST00000345425 AP5M1Q9H0R1 490 aa31.27■■■□□ 2.6
GIPC1-201ENST00000345425 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP31.27■■■□□ 2.6
GIPC1-201ENST00000345425 SP4Q02446 784 aa31.26■■■□□ 2.59
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP31.26■■■□□ 2.59
GIPC1-201ENST00000345425 CLIC6Q96NY7 704 aa31.26■■■□□ 2.59
GIPC1-201ENST00000345425 CSRNP2Q9H175 543 aa31.26■■■□□ 2.59
GIPC1-201ENST00000345425 SAMM50Q9Y512 469 aa31.26■■■□□ 2.59
GIPC1-201ENST00000345425 STK24Q9Y6E0 443 aa31.26■■■□□ 2.59
GIPC1-201ENST00000345425 GOLGA6L22H0YM25 854 aa31.25■■■□□ 2.59
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