RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326277.5

SNX18-201, Transcript of sorting nexin 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SNX18, Length 2,063 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18-201ENST00000326277 ZCWPW2Q504Y3 356 aa25.4■■□□□ 1.66
SNX18-201ENST00000326277 FKBP15Q5T1M5 1219 aa25.4■■□□□ 1.66
SNX18-201ENST00000326277 WDR59Q6PJI9 974 aa25.4■■□□□ 1.66
SNX18-201ENST00000326277 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa25.4■■□□□ 1.66
SNX18-201ENST00000326277 EGFRP00533 1210 aa25.4■■□□□ 1.66
SNX18-201ENST00000326277 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa25.4■■□□□ 1.66
SNX18-201ENST00000326277 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
SNX18-201ENST00000326277 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
SNX18-201ENST00000326277 SLF1Q9BQI6 1058 aa25.4■■□□□ 1.66
SNX18-201ENST00000326277 WDR18Q9BV38 432 aa25.4■■□□□ 1.66
SNX18-201ENST00000326277 DNM3Q9UQ16 869 aa25.4■■□□□ 1.66
SNX18-201ENST00000326277 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
SNX18-201ENST00000326277 ABCB11O95342 1321 aa25.4■■□□□ 1.66
SNX18-201ENST00000326277 FRMD3A2A2Y4 597 aa25.39■■□□□ 1.65
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SNX18-201ENST00000326277 KRT18P05783 430 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.65
SNX18-201ENST00000326277 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP25.39■■□□□ 1.65
SNX18-201ENST00000326277 NDST4Q9H3R1 872 aa25.39■■□□□ 1.65
SNX18-201ENST00000326277 STK24Q9Y6E0 443 aa25.39■■□□□ 1.65
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SNX18-201ENST00000326277 EML1O00423 815 aa25.38■■□□□ 1.65
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SNX18-201ENST00000326277 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
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SNX18-201ENST00000326277 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa25.37■■□□□ 1.65
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SNX18-201ENST00000326277 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa25.36■■□□□ 1.65
SNX18-201ENST00000326277 FIGNQ5HY92 759 aa25.36■■□□□ 1.65
SNX18-201ENST00000326277 NELFCDQ8IXH7 590 aa25.36■■□□□ 1.65
SNX18-201ENST00000326277 SCFD1Q8WVM8 642 aa25.36■■□□□ 1.65
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SNX18-201ENST00000326277 KCTD10Q9H3F6 313 aa25.35■■□□□ 1.65
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SNX18-201ENST00000326277 EHMT1Q9H9B1 1298 aa25.34■■□□□ 1.65
SNX18-201ENST00000326277 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa25.34■■□□□ 1.65
SNX18-201ENST00000326277 PSMD10O75832 226 aa25.33■■□□□ 1.65
SNX18-201ENST00000326277 TNFAIP1Q13829 316 aa25.33■■□□□ 1.65
SNX18-201ENST00000326277 LRCH2Q5VUJ6 765 aa25.33■■□□□ 1.65
SNX18-201ENST00000326277 SLC5A5Q92911 643 aa25.33■■□□□ 1.65
SNX18-201ENST00000326277 BHMT2Q9H2M3 363 aa25.33■■□□□ 1.65
SNX18-201ENST00000326277 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
SNX18-201ENST00000326277 CEP55Q53EZ4 464 aa25.33■■□□□ 1.65
SNX18-201ENST00000326277 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
SNX18-201ENST00000326277 IQCDQ96DY2 449 aa25.33■■□□□ 1.65
SNX18-201ENST00000326277 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
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SNX18-201ENST00000326277 ZNF536O15090 1300 aa25.32■■□□□ 1.64
SNX18-201ENST00000326277 EPHB6O15197 1021 aa25.32■■□□□ 1.64
SNX18-201ENST00000326277 KIF20AO95235 890 aa25.32■■□□□ 1.64
SNX18-201ENST00000326277 ICAM1P05362 532 aa25.32■■□□□ 1.64
SNX18-201ENST00000326277 RPS12P25398 132 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
SNX18-201ENST00000326277 CASP5P51878 434 aa25.32■■□□□ 1.64
SNX18-201ENST00000326277 CEP63Q96MT8 703 aa25.32■■□□□ 1.64
SNX18-201ENST00000326277 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
SNX18-201ENST00000326277 CCPG1Q9ULG6 757 aa25.32■■□□□ 1.64
SNX18-201ENST00000326277 CHMP2AO43633 222 aa25.32■■□□□ 1.64
SNX18-201ENST00000326277 TADA3O75528 432 aa25.32■■□□□ 1.64
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