RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 TBX3O15119 743 aa11.38□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 DXOO77932 396 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 TDP2O95551 362 aa11.38□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 MYL1P05976 194 aa11.38□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 CYP3A4P08684 503 aa11.38□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 AFMP43652 599 aa11.38□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 SARSP49591 514 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 TPM4P67936 248 aa11.38□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 PLCB2Q00722 1185 aa11.38□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 AMPD3Q01432 767 aa11.38□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 NT5DC1Q5TFE4 455 aa11.38□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 KRT79Q5XKE5 535 aa11.38□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 ARMC9Q7Z3E5 817 aa11.38□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 CABP7Q86V35 215 aa11.38□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa11.38□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 CPXCR1Q8N123 301 aa11.38□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 IGSF22Q8N9C0 903 aa11.38□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa11.38□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 GSDMAQ96QA5 445 aa11.38□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 MAGEF1Q9HAY2 307 aa11.38□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 DISC1Q9NRI5 854 aa11.38□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 ADM5C9JUS6 153 aa11.38□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC26A4O43511 780 aa11.38□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 CDC25AP30304 524 aa11.38□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 CIITAP33076 1130 aa11.38□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 OAZ1P54368 228 aa11.38□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 PPATQ06203 517 aa11.38□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 SEMA3FQ13275 785 aa11.38□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 Q4G0T1 1027 aa11.38□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 SH3D19Q5HYK7 790 aa11.38□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa11.38□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa11.38□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 LUZP1Q86V48 1076 aa11.38□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 MLKLQ8NB16 471 aa11.38□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 AGBL1Q96MI9 1066 aa11.38□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM20AQ96MK3 541 aa11.38□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 PPP1R9BQ96SB3 815 aa11.38□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 BPIFA3Q9BQP9 254 aa11.38□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 LRRC27Q9C0I9 530 aa11.38□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 MAF1Q9H063 256 aa11.38□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 FZD1Q9UP38 647 aa11.38□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A087X0B3 334 aa11.37□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 VWA5AO00534 786 aa11.37□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 CXCL11O14625 94 aa11.37□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 OPLAHO14841 1288 aa11.37□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC37A4O43826 429 aa11.37□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 EDIL3O43854 480 aa11.37□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 ALDH1A1P00352 501 aa11.37□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 ALAS1P13196 640 aa11.37□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 VGLL4Q14135 290 aa11.37□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 KARSQ15046 597 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 PRR16Q569H4 304 aa11.37□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 ERO1BQ86YB8 467 aa11.37□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 SPATA20Q8TB22 786 aa11.37□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 CRYGNQ8WXF5 182 aa11.37□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 CDCA5Q96FF9 252 aa11.37□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 MBOAT7Q96N66 472 aa11.37□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 RMND1Q9NWS8 449 aa11.37□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF536O15090 1300 aa11.36□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 MYH4Q9Y623 1939 aa11.36□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 UNCXA6NJT0 531 aa11.36□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 FOXN1O15353 648 aa11.36□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 SKOR1P84550 965 aa11.36□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 IQCB1Q15051 598 aa11.36□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 ISM2Q6H9L7 571 aa11.36□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 PDXDC2PQ6P474 469 aa11.36□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 TRIM46Q7Z4K8 759 aa11.36□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 ERMNQ8TAM6 284 aa11.36□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 TBC1D5Q92609 795 aa11.36□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 HAS1Q92839 578 aa11.36□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 TRERF1Q96PN7 1200 aa11.36□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 KCNMB3Q9NPA1 279 aa11.36□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa11.36□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 MYPNQ86TC9 1320 aa11.35□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 PP2D1A8MPX8 630 aa11.35□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 IKBKBO14920 756 aa11.35□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 ATP2A1O14983 1001 aa11.35□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 ADCY5O95622 1261 aa11.35□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 HSD17B4P51659 736 aa11.35□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 DPYDQ12882 1025 aa11.35□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 MORC3Q14149 939 aa11.35□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 TKFCQ3LXA3 575 aa11.35□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 DPCR1Q3MIW9 517 aa11.35□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 SV2BQ7L1I2 683 aa11.35□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa11.35□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 ATG4CQ96DT6 458 aa11.35□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 PDLIM2Q96JY6 352 aa11.35□□□□□ -0.59
RABGGTB-201ENST00000319942 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.7 ms