RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313173.5

HOXD8-201, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-201ENST00000313173 PANK4Q9NVE7 773 aa29.88■■■□□ 2.37
HOXD8-201ENST00000313173 DNM3Q9UQ16 869 aa29.88■■■□□ 2.37
HOXD8-201ENST00000313173 FRMPD4Q14CM0 1322 aa29.87■■■□□ 2.37
HOXD8-201ENST00000313173 ITIH6Q6UXX5 1313 aa29.87■■■□□ 2.37
HOXD8-201ENST00000313173 EML1O00423 815 aa29.87■■■□□ 2.37
HOXD8-201ENST00000313173 KRT26Q7Z3Y9 468 aa29.87■■■□□ 2.37
HOXD8-201ENST00000313173 CCDC65Q8IXS2 484 aa29.87■■■□□ 2.37
HOXD8-201ENST00000313173 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP29.87■■■□□ 2.37
HOXD8-201ENST00000313173 HOMER2Q9NSB8 354 aa29.87■■■□□ 2.37
HOXD8-201ENST00000313173 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP29.87■■■□□ 2.37
HOXD8-201ENST00000313173 GAS7O60861 476 aa29.86■■■□□ 2.37
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF577Q9BSK1 485 aa29.86■■■□□ 2.37
HOXD8-201ENST00000313173 VPS16Q9H269 839 aa29.86■■■□□ 2.37
HOXD8-201ENST00000313173 SEMA6BQ9H3T3 888 aa29.86■■■□□ 2.37
HOXD8-201ENST00000313173 USP2O75604 605 aaPredicted RBP29.86■■■□□ 2.37
HOXD8-201ENST00000313173 GOLGA8FQ08AF8 430 aa29.86■■■□□ 2.37
HOXD8-201ENST00000313173 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa29.86■■■□□ 2.37
HOXD8-201ENST00000313173 NIPA1Q7RTP0 329 aa29.86■■■□□ 2.37
HOXD8-201ENST00000313173 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP29.86■■■□□ 2.37
HOXD8-201ENST00000313173 WDR11Q9BZH6 1224 aa29.86■■■□□ 2.37
HOXD8-201ENST00000313173 TUFT1Q9NNX1 390 aa29.86■■■□□ 2.37
HOXD8-201ENST00000313173 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP29.86■■■□□ 2.37
HOXD8-201ENST00000313173 ARP10275 920 aa29.85■■■□□ 2.37
HOXD8-201ENST00000313173 BCRP11274 1271 aa29.85■■■□□ 2.37
HOXD8-201ENST00000313173 FAM26FQ5R3K3 315 aa29.85■■■□□ 2.37
HOXD8-201ENST00000313173 FAM114A1Q8IWE2 563 aa29.85■■■□□ 2.37
HOXD8-201ENST00000313173 TC2NQ8N9U0 490 aa29.85■■■□□ 2.37
HOXD8-201ENST00000313173 REPS2Q8NFH8 660 aa29.85■■■□□ 2.37
HOXD8-201ENST00000313173 TRERF1Q96PN7 1200 aa29.85■■■□□ 2.37
HOXD8-201ENST00000313173 TMOD4Q9NZQ9 345 aa29.85■■■□□ 2.37
HOXD8-201ENST00000313173 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa29.85■■■□□ 2.37
HOXD8-201ENST00000313173 WDR90Q96KV7 1748 aa29.85■■■□□ 2.37
HOXD8-201ENST00000313173 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP29.85■■■□□ 2.37
HOXD8-201ENST00000313173 DSG3P32926 999 aa29.84■■■□□ 2.37
HOXD8-201ENST00000313173 PSMC6P62333 389 aa29.84■■■□□ 2.37
HOXD8-201ENST00000313173 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP29.84■■■□□ 2.37
HOXD8-201ENST00000313173 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP29.84■■■□□ 2.37
HOXD8-201ENST00000313173 WNK4Q96J92 1243 aa29.84■■■□□ 2.37
HOXD8-201ENST00000313173 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa29.84■■■□□ 2.37
HOXD8-201ENST00000313173 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa29.84■■■□□ 2.37
HOXD8-201ENST00000313173 FRMD3A2A2Y4 597 aa29.84■■■□□ 2.37
HOXD8-201ENST00000313173 EPHX2P34913 555 aa29.84■■■□□ 2.37
HOXD8-201ENST00000313173 OAZ1P54368 228 aa29.84■■■□□ 2.37
HOXD8-201ENST00000313173 CYP4A11Q02928 519 aa29.84■■■□□ 2.37
HOXD8-201ENST00000313173 PCNX4Q63HM2 1172 aa29.84■■■□□ 2.37
HOXD8-201ENST00000313173 FOXR2Q6PJQ5 311 aa29.84■■■□□ 2.37
HOXD8-201ENST00000313173 CREBRFQ8IUR6 639 aa29.84■■■□□ 2.37
HOXD8-201ENST00000313173 HSD17B14Q9BPX1 270 aa29.84■■■□□ 2.37
HOXD8-201ENST00000313173 ITGB5P18084 799 aa29.83■■■□□ 2.37
HOXD8-201ENST00000313173 RPS6P62753 249 aaKnown RBP29.83■■■□□ 2.37
HOXD8-201ENST00000313173 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP29.83■■■□□ 2.37
HOXD8-201ENST00000313173 PRKG1Q13976 671 aa29.83■■■□□ 2.37
HOXD8-201ENST00000313173 ARSHQ5FYA8 562 aa29.83■■■□□ 2.37
HOXD8-201ENST00000313173 IL31RAQ8NI17 732 aa29.83■■■□□ 2.37
HOXD8-201ENST00000313173 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP29.83■■■□□ 2.37
HOXD8-201ENST00000313173 RIT2Q99578 217 aa29.83■■■□□ 2.37
HOXD8-201ENST00000313173 TEKT3Q9BXF9 490 aa29.83■■■□□ 2.37
HOXD8-201ENST00000313173 USP27XA6NNY8 438 aa29.83■■■□□ 2.37
HOXD8-201ENST00000313173 KRT18P05783 430 aaKnown RBP29.83■■■□□ 2.37
HOXD8-201ENST00000313173 LRRC63Q05C16 580 aa29.83■■■□□ 2.37
HOXD8-201ENST00000313173 PPFIBP1Q86W92 1011 aa29.83■■■□□ 2.37
HOXD8-201ENST00000313173 TMEM139Q8IV31 216 aa29.83■■■□□ 2.37
HOXD8-201ENST00000313173 SULF1Q8IWU6 871 aa29.83■■■□□ 2.37
HOXD8-201ENST00000313173 RGL1Q9NZL6 768 aa29.83■■■□□ 2.37
HOXD8-201ENST00000313173 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa29.83■■■□□ 2.37
HOXD8-201ENST00000313173 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa29.82■■■□□ 2.36
HOXD8-201ENST00000313173 LGALS16A8MUM7 142 aa29.82■■■□□ 2.36
HOXD8-201ENST00000313173 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP29.82■■■□□ 2.36
HOXD8-201ENST00000313173 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP29.82■■■□□ 2.36
HOXD8-201ENST00000313173 EYA4O95677 639 aa29.82■■■□□ 2.36
HOXD8-201ENST00000313173 COG2Q14746 738 aa29.82■■■□□ 2.36
HOXD8-201ENST00000313173 B3GNT9Q6UX72 402 aa29.82■■■□□ 2.36
HOXD8-201ENST00000313173 DLK2Q6UY11 383 aa29.82■■■□□ 2.36
HOXD8-201ENST00000313173 SLC30A10Q6XR72 485 aa29.82■■■□□ 2.36
HOXD8-201ENST00000313173 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa29.82■■■□□ 2.36
HOXD8-201ENST00000313173 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP29.82■■■□□ 2.36
HOXD8-201ENST00000313173 MYOCDQ8IZQ8 938 aa29.82■■■□□ 2.36
HOXD8-201ENST00000313173 RNF146Q9NTX7 359 aa29.82■■■□□ 2.36
HOXD8-201ENST00000313173 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa29.82■■■□□ 2.36
HOXD8-201ENST00000313173 CHMP2AO43633 222 aa29.81■■■□□ 2.36
HOXD8-201ENST00000313173 MUTP22033 750 aa29.81■■■□□ 2.36
HOXD8-201ENST00000313173 TERF1P54274 439 aa29.81■■■□□ 2.36
HOXD8-201ENST00000313173 ADKP55263 362 aaKnown RBP29.81■■■□□ 2.36
HOXD8-201ENST00000313173 MAP3K9P80192 1104 aa29.81■■■□□ 2.36
HOXD8-201ENST00000313173 SH3D19Q5HYK7 790 aa29.81■■■□□ 2.36
HOXD8-201ENST00000313173 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP29.81■■■□□ 2.36
HOXD8-201ENST00000313173 RNF207Q6ZRF8 634 aa29.81■■■□□ 2.36
HOXD8-201ENST00000313173 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP29.81■■■□□ 2.36
HOXD8-201ENST00000313173 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP29.81■■■□□ 2.36
HOXD8-201ENST00000313173 UNC45AQ9H3U1 944 aa29.81■■■□□ 2.36
HOXD8-201ENST00000313173 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa29.81■■■□□ 2.36
HOXD8-201ENST00000313173 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP29.81■■■□□ 2.36
HOXD8-201ENST00000313173 OTOFQ9HC10 1997 aa29.81■■■□□ 2.36
HOXD8-201ENST00000313173 VGLL4Q14135 290 aa29.81■■■□□ 2.36
HOXD8-201ENST00000313173 TAAR1Q96RJ0 339 aa29.81■■■□□ 2.36
HOXD8-201ENST00000313173 ADM5C9JUS6 153 aa29.8■■■□□ 2.36
HOXD8-201ENST00000313173 RBL2Q08999 1139 aa29.8■■■□□ 2.36
HOXD8-201ENST00000313173 LRRC41Q15345 812 aa29.8■■■□□ 2.36
HOXD8-201ENST00000313173 GLIS3Q8NEA6 775 aa29.8■■■□□ 2.36
HOXD8-201ENST00000313173 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP29.8■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25 ms