RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295314.8

TMOD4-201, Transcript of tropomodulin 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD4, Length 1,267 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD4-201ENST00000295314 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
TMOD4-201ENST00000295314 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
TMOD4-201ENST00000295314 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
TMOD4-201ENST00000295314 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa13.58□□□□□ -0.24
TMOD4-201ENST00000295314 SZT2Q5T011 3432 aa13.58□□□□□ -0.24
TMOD4-201ENST00000295314 FGBP02675 491 aa13.57□□□□□ -0.24
TMOD4-201ENST00000295314 ZNF286BP0CG31 522 aa13.57□□□□□ -0.24
TMOD4-201ENST00000295314 ZNF76P36508 570 aa13.57□□□□□ -0.24
TMOD4-201ENST00000295314 CLK2P49760 499 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
TMOD4-201ENST00000295314 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
TMOD4-201ENST00000295314 CEP55Q53EZ4 464 aa13.57□□□□□ -0.24
TMOD4-201ENST00000295314 TMEM240Q5SV17 173 aa13.57□□□□□ -0.24
TMOD4-201ENST00000295314 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
TMOD4-201ENST00000295314 C16orf59Q7L2K0 433 aa13.57□□□□□ -0.24
TMOD4-201ENST00000295314 CAGE1Q8TC20 777 aa13.57□□□□□ -0.24
TMOD4-201ENST00000295314 SEPT1Q8WYJ6 367 aa13.57□□□□□ -0.24
TMOD4-201ENST00000295314 GPR20Q99678 358 aa13.57□□□□□ -0.24
TMOD4-201ENST00000295314 C16orf70Q9BSU1 422 aa13.57□□□□□ -0.24
TMOD4-201ENST00000295314 BCAS3Q9H6U6 928 aa13.57□□□□□ -0.24
TMOD4-201ENST00000295314 SH3GLB2Q9NR46 395 aa13.57□□□□□ -0.24
TMOD4-201ENST00000295314 HDAC6Q9UBN7 1215 aa13.57□□□□□ -0.24
TMOD4-201ENST00000295314 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
TMOD4-201ENST00000295314 UMODL1Q5DID0 1318 aa13.57□□□□□ -0.24
TMOD4-201ENST00000295314 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
TMOD4-201ENST00000295314 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
TMOD4-201ENST00000295314 ATP9AO75110 1047 aa13.56□□□□□ -0.24
TMOD4-201ENST00000295314 CDKL5O76039 1030 aa13.56□□□□□ -0.24
TMOD4-201ENST00000295314 LGALS2P05162 132 aa13.56□□□□□ -0.24
TMOD4-201ENST00000295314 PFKMP08237 780 aa13.56□□□□□ -0.24
TMOD4-201ENST00000295314 ACRP10323 421 aa13.56□□□□□ -0.24
TMOD4-201ENST00000295314 KCNA2P16389 499 aa13.56□□□□□ -0.24
TMOD4-201ENST00000295314 RFC2P35250 354 aa13.56□□□□□ -0.24
TMOD4-201ENST00000295314 SREBF1P36956 1147 aa13.56□□□□□ -0.24
TMOD4-201ENST00000295314 STK3Q13188 491 aa13.56□□□□□ -0.24
TMOD4-201ENST00000295314 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa13.56□□□□□ -0.24
TMOD4-201ENST00000295314 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
TMOD4-201ENST00000295314 ZNF365Q70YC5 407 aa13.56□□□□□ -0.24
TMOD4-201ENST00000295314 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
TMOD4-201ENST00000295314 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa13.56□□□□□ -0.24
TMOD4-201ENST00000295314 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
TMOD4-201ENST00000295314 WNT8AQ9H1J5 351 aa13.56□□□□□ -0.24
TMOD4-201ENST00000295314 KCNH7Q9NS40 1196 aa13.56□□□□□ -0.24
TMOD4-201ENST00000295314 TMEM260Q9NX78 707 aa13.56□□□□□ -0.24
TMOD4-201ENST00000295314 LTBP2Q14767 1821 aa13.55□□□□□ -0.24
TMOD4-201ENST00000295314 PPFIA3O75145 1194 aa13.55□□□□□ -0.24
TMOD4-201ENST00000295314 DEXIO95424 95 aa13.55□□□□□ -0.24
TMOD4-201ENST00000295314 PARNO95453 639 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
TMOD4-201ENST00000295314 IQCF3P0C7M6 154 aa13.55□□□□□ -0.24
TMOD4-201ENST00000295314 GNAT1P11488 350 aa13.55□□□□□ -0.24
TMOD4-201ENST00000295314 NLRP5P59047 1200 aa13.55□□□□□ -0.24
TMOD4-201ENST00000295314 ARHGAP4P98171 946 aa13.55□□□□□ -0.24
TMOD4-201ENST00000295314 SP4Q02446 784 aa13.55□□□□□ -0.24
TMOD4-201ENST00000295314 PTK7Q13308 1070 aa13.55□□□□□ -0.24
TMOD4-201ENST00000295314 NIPA1Q7RTP0 329 aa13.55□□□□□ -0.24
TMOD4-201ENST00000295314 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
TMOD4-201ENST00000295314 DEFB123Q8N688 67 aa13.55□□□□□ -0.24
TMOD4-201ENST00000295314 AFAP1L1Q8TED9 768 aa13.55□□□□□ -0.24
TMOD4-201ENST00000295314 IL17RAQ96F46 866 aa13.55□□□□□ -0.24
TMOD4-201ENST00000295314 SCLYQ96I15 445 aa13.55□□□□□ -0.24
TMOD4-201ENST00000295314 PGBD1Q96JS3 809 aa13.55□□□□□ -0.24
TMOD4-201ENST00000295314 SDF4Q9BRK5 362 aa13.55□□□□□ -0.24
TMOD4-201ENST00000295314 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
TMOD4-201ENST00000295314 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa13.54□□□□□ -0.24
TMOD4-201ENST00000295314 C17orf102A2RUQ5 167 aa13.54□□□□□ -0.24
TMOD4-201ENST00000295314 MEIS1O00470 390 aa13.54□□□□□ -0.24
TMOD4-201ENST00000295314 CYP3A4P08684 503 aa13.54□□□□□ -0.24
TMOD4-201ENST00000295314 ACTN1P12814 892 aa13.54□□□□□ -0.24
TMOD4-201ENST00000295314 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
TMOD4-201ENST00000295314 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
TMOD4-201ENST00000295314 CYP2W1Q8TAV3 490 aa13.54□□□□□ -0.24
TMOD4-201ENST00000295314 HERVK_113Q902F9 699 aa13.54□□□□□ -0.24
TMOD4-201ENST00000295314 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
TMOD4-201ENST00000295314 C22orf23Q9BZE7 217 aa13.54□□□□□ -0.24
TMOD4-201ENST00000295314 PKD2L1Q9P0L9 805 aa13.54□□□□□ -0.24
TMOD4-201ENST00000295314 VPS54Q9P1Q0 977 aa13.54□□□□□ -0.24
TMOD4-201ENST00000295314 SLC9A2Q9UBY0 812 aa13.54□□□□□ -0.24
TMOD4-201ENST00000295314 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
TMOD4-201ENST00000295314 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa13.53□□□□□ -0.24
TMOD4-201ENST00000295314 PFKFB2O60825 505 aa13.53□□□□□ -0.24
TMOD4-201ENST00000295314 SELPP16109 830 aa13.53□□□□□ -0.24
TMOD4-201ENST00000295314 XBP1P17861 261 aa13.53□□□□□ -0.24
TMOD4-201ENST00000295314 AK2P54819 239 aa13.53□□□□□ -0.24
TMOD4-201ENST00000295314 RBL2Q08999 1139 aa13.53□□□□□ -0.24
TMOD4-201ENST00000295314 ZNF697Q5TEC3 545 aa13.53□□□□□ -0.24
TMOD4-201ENST00000295314 RASIP1Q5U651 963 aa13.53□□□□□ -0.24
TMOD4-201ENST00000295314 GALNT17Q6IS24 598 aa13.53□□□□□ -0.24
TMOD4-201ENST00000295314 OTOP2Q7RTS6 562 aa13.53□□□□□ -0.24
TMOD4-201ENST00000295314 DEFB128Q7Z7B8 93 aa13.53□□□□□ -0.24
TMOD4-201ENST00000295314 GLG1Q92896 1179 aa13.53□□□□□ -0.24
TMOD4-201ENST00000295314 ATP6V0A1Q93050 837 aa13.53□□□□□ -0.24
TMOD4-201ENST00000295314 RNPEPQ9H4A4 650 aa13.53□□□□□ -0.24
TMOD4-201ENST00000295314 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa13.53□□□□□ -0.24
TMOD4-201ENST00000295314 AZI2Q9H6S1 392 aa13.53□□□□□ -0.24
TMOD4-201ENST00000295314 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
TMOD4-201ENST00000295314 TPCN1Q9ULQ1 816 aa13.53□□□□□ -0.24
TMOD4-201ENST00000295314 NFASCO94856 1347 aa13.53□□□□□ -0.24
TMOD4-201ENST00000295314 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa13.52□□□□□ -0.25
TMOD4-201ENST00000295314 SEC24BO95487 1268 aa13.52□□□□□ -0.25
TMOD4-201ENST00000295314 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa13.52□□□□□ -0.25
TMOD4-201ENST00000295314 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.9 ms