RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000290921.10

CTBP1-201, Transcript of C-terminal binding protein 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTBP1, Length 2,297 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP1-201ENST00000290921 PLIN4Q96Q06 1357 aa27.83■■■□□ 2.05
CTBP1-201ENST00000290921 NOL4O94818 638 aa27.83■■■□□ 2.05
CTBP1-201ENST00000290921 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.05
CTBP1-201ENST00000290921 FAM153BP0C7A2 387 aa27.83■■■□□ 2.05
CTBP1-201ENST00000290921 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP27.83■■■□□ 2.05
CTBP1-201ENST00000290921 DNA2P51530 1060 aa27.83■■■□□ 2.05
CTBP1-201ENST00000290921 FAM153CQ494X1 144 aa27.83■■■□□ 2.05
CTBP1-201ENST00000290921 TMEM119Q4V9L6 283 aa27.83■■■□□ 2.05
CTBP1-201ENST00000290921 ASPRV1Q53RT3 343 aa27.83■■■□□ 2.05
CTBP1-201ENST00000290921 FAM83BQ5T0W9 1011 aa27.83■■■□□ 2.05
CTBP1-201ENST00000290921 IFT81Q8WYA0 676 aa27.83■■■□□ 2.05
CTBP1-201ENST00000290921 FAM153AQ9UHL3 310 aa27.83■■■□□ 2.05
CTBP1-201ENST00000290921 GAKO14976 1311 aa27.83■■■□□ 2.05
CTBP1-201ENST00000290921 KRT14P02533 472 aa27.83■■■□□ 2.04
CTBP1-201ENST00000290921 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.04
CTBP1-201ENST00000290921 GUCY2DQ02846 1103 aa27.83■■■□□ 2.04
CTBP1-201ENST00000290921 MFSD14BQ5SR56 506 aa27.83■■■□□ 2.04
CTBP1-201ENST00000290921 CFAP58Q5T655 872 aa27.83■■■□□ 2.04
CTBP1-201ENST00000290921 FOXR2Q6PJQ5 311 aa27.83■■■□□ 2.04
CTBP1-201ENST00000290921 SH2D3CQ8N5H7 860 aa27.83■■■□□ 2.04
CTBP1-201ENST00000290921 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.04
CTBP1-201ENST00000290921 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP27.83■■■□□ 2.04
CTBP1-201ENST00000290921 MTMR4Q9NYA4 1195 aa27.83■■■□□ 2.04
CTBP1-201ENST00000290921 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP27.82■■■□□ 2.04
CTBP1-201ENST00000290921 A6NNZ2 444 aa27.82■■■□□ 2.04
CTBP1-201ENST00000290921 TRAF5O00463 557 aa27.82■■■□□ 2.04
CTBP1-201ENST00000290921 FTCDO95954 541 aa27.82■■■□□ 2.04
CTBP1-201ENST00000290921 PAK2Q13177 524 aa27.82■■■□□ 2.04
CTBP1-201ENST00000290921 NAB2Q15742 525 aa27.82■■■□□ 2.04
CTBP1-201ENST00000290921 TUBB8Q3ZCM7 444 aa27.82■■■□□ 2.04
CTBP1-201ENST00000290921 KCTD16Q68DU8 428 aa27.82■■■□□ 2.04
CTBP1-201ENST00000290921 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
CTBP1-201ENST00000290921 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
CTBP1-201ENST00000290921 NHSQ6T4R5 1651 aa27.82■■■□□ 2.04
CTBP1-201ENST00000290921 ESYT3A0FGR9 886 aa27.81■■■□□ 2.04
CTBP1-201ENST00000290921 LIG3P49916 1009 aa27.81■■■□□ 2.04
CTBP1-201ENST00000290921 PDCLQ13371 301 aa27.81■■■□□ 2.04
CTBP1-201ENST00000290921 ZCWPW2Q504Y3 356 aa27.81■■■□□ 2.04
CTBP1-201ENST00000290921 SLF2Q8IX21 1173 aa27.81■■■□□ 2.04
CTBP1-201ENST00000290921 IQCKQ8N0W5 287 aa27.81■■■□□ 2.04
CTBP1-201ENST00000290921 ERLIN2O94905 339 aa27.81■■■□□ 2.04
CTBP1-201ENST00000290921 ATP2B4P23634 1241 aa27.81■■■□□ 2.04
CTBP1-201ENST00000290921 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
CTBP1-201ENST00000290921 COASYQ13057 564 aa27.81■■■□□ 2.04
CTBP1-201ENST00000290921 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
CTBP1-201ENST00000290921 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
CTBP1-201ENST00000290921 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa27.81■■■□□ 2.04
CTBP1-201ENST00000290921 SAMM50Q9Y512 469 aa27.81■■■□□ 2.04
CTBP1-201ENST00000290921 SNHG28P0DPA3 235 aa27.8■■■□□ 2.04
CTBP1-201ENST00000290921 KLRC1P26715 233 aa27.8■■■□□ 2.04
CTBP1-201ENST00000290921 GGA1Q9UJY5 639 aa27.8■■■□□ 2.04
CTBP1-201ENST00000290921 TNNI2P48788 182 aa27.8■■■□□ 2.04
CTBP1-201ENST00000290921 ATP1A2P50993 1020 aa27.8■■■□□ 2.04
CTBP1-201ENST00000290921 APBA1Q02410 837 aa27.8■■■□□ 2.04
CTBP1-201ENST00000290921 ECM1Q16610 540 aa27.8■■■□□ 2.04
CTBP1-201ENST00000290921 TBC1D5Q92609 795 aa27.8■■■□□ 2.04
CTBP1-201ENST00000290921 DNAJC19Q96DA6 116 aa27.8■■■□□ 2.04
CTBP1-201ENST00000290921 GRID2IPA4D2P6 1211 aa27.79■■■□□ 2.04
CTBP1-201ENST00000290921 TRAPPC3LQ5T215 181 aa27.79■■■□□ 2.04
CTBP1-201ENST00000290921 MEI1Q5TIA1 1274 aa27.79■■■□□ 2.04
CTBP1-201ENST00000290921 KRT12Q99456 494 aa27.79■■■□□ 2.04
CTBP1-201ENST00000290921 ZNF233A6NK53 670 aa27.79■■■□□ 2.04
CTBP1-201ENST00000290921 PPP4R3AQ6IN85 833 aa27.79■■■□□ 2.04
CTBP1-201ENST00000290921 PANK4Q9NVE7 773 aa27.79■■■□□ 2.04
CTBP1-201ENST00000290921 GUCY2FP51841 1108 aa27.78■■■□□ 2.04
CTBP1-201ENST00000290921 SLC18A3Q16572 532 aa27.78■■■□□ 2.04
CTBP1-201ENST00000290921 PRR5LQ6MZQ0 368 aa27.78■■■□□ 2.04
CTBP1-201ENST00000290921 PPP1R18Q6NYC8 613 aa27.78■■■□□ 2.04
CTBP1-201ENST00000290921 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa27.78■■■□□ 2.04
CTBP1-201ENST00000290921 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP27.78■■■□□ 2.042e-7■■□□□ 12.4
CTBP1-201ENST00000290921 GPCPD1Q9NPB8 672 aa27.78■■■□□ 2.04
CTBP1-201ENST00000290921 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP27.78■■■□□ 2.04
CTBP1-201ENST00000290921 NDUFAB1O14561 156 aa27.78■■■□□ 2.04
CTBP1-201ENST00000290921 VPS72Q15906 364 aa27.78■■■□□ 2.04
CTBP1-201ENST00000290921 FAM26FQ5R3K3 315 aa27.78■■■□□ 2.04
CTBP1-201ENST00000290921 MREGQ8N565 214 aa27.78■■■□□ 2.04
CTBP1-201ENST00000290921 PIK3R5Q8WYR1 880 aa27.78■■■□□ 2.04
CTBP1-201ENST00000290921 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa27.78■■■□□ 2.04
CTBP1-201ENST00000290921 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP27.77■■■□□ 2.04
CTBP1-201ENST00000290921 EIF6P56537 245 aaKnown RBP27.77■■■□□ 2.04
CTBP1-201ENST00000290921 ARID5AQ03989 594 aa27.77■■■□□ 2.04
CTBP1-201ENST00000290921 RAPGEF1Q13905 1077 aa27.77■■■□□ 2.04
CTBP1-201ENST00000290921 UBE2SQ16763 222 aa27.77■■■□□ 2.04
CTBP1-201ENST00000290921 KDM7AQ6ZMT4 941 aa27.77■■■□□ 2.04
CTBP1-201ENST00000290921 TBC1D7Q9P0N9 293 aa27.77■■■□□ 2.04
CTBP1-201ENST00000290921 A0A087X0T9 212 aa27.76■■■□□ 2.04
CTBP1-201ENST00000290921 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa27.76■■■□□ 2.04
CTBP1-201ENST00000290921 CLSTN1O94985 981 aa27.76■■■□□ 2.04
CTBP1-201ENST00000290921 FAM228BP0C875 321 aa27.76■■■□□ 2.04
CTBP1-201ENST00000290921 AKR1B1P15121 316 aa27.76■■■□□ 2.04
CTBP1-201ENST00000290921 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP27.76■■■□□ 2.04
CTBP1-201ENST00000290921 GABPAQ06546 454 aa27.76■■■□□ 2.04
CTBP1-201ENST00000290921 SEPT2Q15019 361 aa27.76■■■□□ 2.04
CTBP1-201ENST00000290921 KIAA0753Q2KHM9 967 aa27.76■■■□□ 2.04
CTBP1-201ENST00000290921 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa27.76■■■□□ 2.04
CTBP1-201ENST00000290921 CEP63Q96MT8 703 aa27.76■■■□□ 2.04
CTBP1-201ENST00000290921 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa27.76■■■□□ 2.03
CTBP1-201ENST00000290921 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP27.76■■■□□ 2.03
CTBP1-201ENST00000290921 CLEC10AQ8IUN9 316 aa27.76■■■□□ 2.03
CTBP1-201ENST00000290921 HAS1Q92839 578 aa27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.3 ms