RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000287820.10

PPARG-201, Transcript of peroxisome proliferator activated receptor gamma, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PPARG, Length 1,850 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARG-201ENST00000287820 A0A1W2PPC1 479 aa9.62□□□□□ -0.87
PPARG-201ENST00000287820 HAS3O00219 553 aa9.62□□□□□ -0.87
PPARG-201ENST00000287820 TLR3O15455 904 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
PPARG-201ENST00000287820 EDIL3O43854 480 aa9.62□□□□□ -0.87
PPARG-201ENST00000287820 CDKL5O76039 1030 aa9.62□□□□□ -0.87
PPARG-201ENST00000287820 LARGE1O95461 756 aa9.62□□□□□ -0.87
PPARG-201ENST00000287820 TIMP1P01033 207 aa9.62□□□□□ -0.87
PPARG-201ENST00000287820 RAG1P15918 1043 aa9.62□□□□□ -0.87
PPARG-201ENST00000287820 KCNA2P16389 499 aa9.62□□□□□ -0.87
PPARG-201ENST00000287820 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
PPARG-201ENST00000287820 CEP55Q53EZ4 464 aa9.62□□□□□ -0.87
PPARG-201ENST00000287820 NECAB1Q8N987 351 aa9.62□□□□□ -0.87
PPARG-201ENST00000287820 CCDC148Q8NFR7 591 aa9.62□□□□□ -0.87
PPARG-201ENST00000287820 BICD2Q8TD16 824 aa9.62□□□□□ -0.87
PPARG-201ENST00000287820 BADQ92934 168 aa9.62□□□□□ -0.87
PPARG-201ENST00000287820 AIFM3Q96NN9 605 aa9.62□□□□□ -0.87
PPARG-201ENST00000287820 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
PPARG-201ENST00000287820 C16orf70Q9BSU1 422 aa9.62□□□□□ -0.87
PPARG-201ENST00000287820 TRPV6Q9H1D0 765 aa9.62□□□□□ -0.87
PPARG-201ENST00000287820 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
PPARG-201ENST00000287820 KCNH7Q9NS40 1196 aa9.62□□□□□ -0.87
PPARG-201ENST00000287820 SORBS3O60504 671 aa9.62□□□□□ -0.87
PPARG-201ENST00000287820 B4GALT4O60513 344 aa9.62□□□□□ -0.87
PPARG-201ENST00000287820 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa9.62□□□□□ -0.87
PPARG-201ENST00000287820 FDPSP14324 419 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
PPARG-201ENST00000287820 NLRP5P59047 1200 aa9.62□□□□□ -0.87
PPARG-201ENST00000287820 ARHGAP4P98171 946 aa9.62□□□□□ -0.87
PPARG-201ENST00000287820 MTMR1Q13613 665 aa9.62□□□□□ -0.87
PPARG-201ENST00000287820 NPY5RQ15761 445 aa9.62□□□□□ -0.87
PPARG-201ENST00000287820 GALNT17Q6IS24 598 aa9.62□□□□□ -0.87
PPARG-201ENST00000287820 NIPA1Q7RTP0 329 aa9.62□□□□□ -0.87
PPARG-201ENST00000287820 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
PPARG-201ENST00000287820 GPR20Q99678 358 aa9.62□□□□□ -0.87
PPARG-201ENST00000287820 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa9.62□□□□□ -0.87
PPARG-201ENST00000287820 TELO2Q9Y4R8 837 aa9.62□□□□□ -0.87
PPARG-201ENST00000287820 M0R2N6 131 aa9.61□□□□□ -0.87
PPARG-201ENST00000287820 DTNBO60941 627 aa9.61□□□□□ -0.87
PPARG-201ENST00000287820 F2P00734 622 aa9.61□□□□□ -0.87
PPARG-201ENST00000287820 ARP10275 920 aa9.61□□□□□ -0.87
PPARG-201ENST00000287820 SESTD1Q86VW0 696 aa9.61□□□□□ -0.87
PPARG-201ENST00000287820 RASGRP4Q8TDF6 673 aa9.61□□□□□ -0.87
PPARG-201ENST00000287820 GTF3C6Q969F1 213 aa9.61□□□□□ -0.87
PPARG-201ENST00000287820 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
PPARG-201ENST00000287820 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
PPARG-201ENST00000287820 PCDHA4Q9UN74 947 aa9.61□□□□□ -0.87
PPARG-201ENST00000287820 STK36Q9NRP7 1315 aa9.61□□□□□ -0.87
PPARG-201ENST00000287820 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa9.6□□□□□ -0.87
PPARG-201ENST00000287820 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa9.6□□□□□ -0.87
PPARG-201ENST00000287820 FAM86B1E9PN63 330 aa9.6□□□□□ -0.87
PPARG-201ENST00000287820 H3BRB1 525 aa9.6□□□□□ -0.87
PPARG-201ENST00000287820 FAM86B2P0C5J1 330 aa9.6□□□□□ -0.87
PPARG-201ENST00000287820 CIITAP33076 1130 aa9.6□□□□□ -0.87
PPARG-201ENST00000287820 ZNF76P36508 570 aa9.6□□□□□ -0.87
PPARG-201ENST00000287820 PSEN2P49810 448 aa9.6□□□□□ -0.87
PPARG-201ENST00000287820 USP11P51784 963 aa9.6□□□□□ -0.87
PPARG-201ENST00000287820 KIAA0753Q2KHM9 967 aa9.6□□□□□ -0.87
PPARG-201ENST00000287820 MFSD5Q6N075 450 aa9.6□□□□□ -0.87
PPARG-201ENST00000287820 BLIDQ8IZY5 108 aa9.6□□□□□ -0.87
PPARG-201ENST00000287820 DAGLBQ8NCG7 672 aa9.6□□□□□ -0.87
PPARG-201ENST00000287820 IL27Q8NEV9 243 aa9.6□□□□□ -0.87
PPARG-201ENST00000287820 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa9.6□□□□□ -0.87
PPARG-201ENST00000287820 SEPT1Q8WYJ6 367 aa9.6□□□□□ -0.87
PPARG-201ENST00000287820 PHF20Q9BVI0 1012 aa9.6□□□□□ -0.87
PPARG-201ENST00000287820 KATNAL1Q9BW62 490 aa9.6□□□□□ -0.87
PPARG-201ENST00000287820 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
PPARG-201ENST00000287820 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
PPARG-201ENST00000287820 NOP56O00567 594 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
PPARG-201ENST00000287820 ST3GAL1Q11201 340 aa9.59□□□□□ -0.87
PPARG-201ENST00000287820 MFSD10Q14728 455 aa9.59□□□□□ -0.87
PPARG-201ENST00000287820 FAM47CQ5HY64 1035 aa9.59□□□□□ -0.87
PPARG-201ENST00000287820 TDHQ8IZJ6 230 aa9.59□□□□□ -0.87
PPARG-201ENST00000287820 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
PPARG-201ENST00000287820 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
PPARG-201ENST00000287820 CTAGE1Q96RT6 745 aa9.59□□□□□ -0.87
PPARG-201ENST00000287820 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
PPARG-201ENST00000287820 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
PPARG-201ENST00000287820 HDAC6Q9UBN7 1215 aa9.59□□□□□ -0.87
PPARG-201ENST00000287820 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa9.59□□□□□ -0.87
PPARG-201ENST00000287820 KCNJ14Q9UNX9 436 aa9.59□□□□□ -0.87
PPARG-201ENST00000287820 NFASCO94856 1347 aa9.59□□□□□ -0.87
PPARG-201ENST00000287820 LTBP2Q14767 1821 aa9.59□□□□□ -0.87
PPARG-201ENST00000287820 DHX15O43143 795 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
PPARG-201ENST00000287820 ATG7O95352 703 aa9.59□□□□□ -0.87
PPARG-201ENST00000287820 LGALS2P05162 132 aa9.59□□□□□ -0.87
PPARG-201ENST00000287820 ZNF286BP0CG31 522 aa9.59□□□□□ -0.87
PPARG-201ENST00000287820 CYP2C9P11712 490 aa9.59□□□□□ -0.87
PPARG-201ENST00000287820 XBP1P17861 261 aa9.59□□□□□ -0.87
PPARG-201ENST00000287820 CYP2C18P33260 490 aa9.59□□□□□ -0.87
PPARG-201ENST00000287820 CHMP4BP1P59074 171 aa9.59□□□□□ -0.87
PPARG-201ENST00000287820 SHHQ15465 462 aa9.59□□□□□ -0.87
PPARG-201ENST00000287820 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
PPARG-201ENST00000287820 C16orf59Q7L2K0 433 aa9.59□□□□□ -0.87
PPARG-201ENST00000287820 PLA2G4DQ86XP0 818 aa9.59□□□□□ -0.87
PPARG-201ENST00000287820 C7orf31Q8N865 590 aa9.59□□□□□ -0.87
PPARG-201ENST00000287820 WASF1Q92558 559 aa9.59□□□□□ -0.87
PPARG-201ENST00000287820 ALG1Q9BT22 464 aa9.59□□□□□ -0.87
PPARG-201ENST00000287820 HIPK3Q9H422 1215 aa9.59□□□□□ -0.87
PPARG-201ENST00000287820 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
PPARG-201ENST00000287820 GJB4Q9NTQ9 266 aa9.59□□□□□ -0.87
PPARG-201ENST00000287820 SLC9A2Q9UBY0 812 aa9.59□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.6 ms