RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284116.8

GDPD1-201, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GDPD1, Length 1,821 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD1-201ENST00000284116 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa21.03■□□□□ 0.96
GDPD1-201ENST00000284116 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa21.02■□□□□ 0.96
GDPD1-201ENST00000284116 MEIS1O00470 390 aa21.02■□□□□ 0.96
GDPD1-201ENST00000284116 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.96
GDPD1-201ENST00000284116 VCAM1P19320 739 aa21.02■□□□□ 0.96
GDPD1-201ENST00000284116 FECHP22830 423 aa21.02■□□□□ 0.96
GDPD1-201ENST00000284116 SPP2Q13103 211 aa21.02■□□□□ 0.96
GDPD1-201ENST00000284116 GLIS3Q8NEA6 775 aa21.02■□□□□ 0.96
GDPD1-201ENST00000284116 TRPM4Q8TD43 1214 aa21.02■□□□□ 0.96
GDPD1-201ENST00000284116 ZNF592Q92610 1267 aa21.02■□□□□ 0.96
GDPD1-201ENST00000284116 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.96
GDPD1-201ENST00000284116 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa21.02■□□□□ 0.96
GDPD1-201ENST00000284116 FRMD3A2A2Y4 597 aa21.01■□□□□ 0.95
GDPD1-201ENST00000284116 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
GDPD1-201ENST00000284116 PPP2R5CQ13362 524 aa21.01■□□□□ 0.95
GDPD1-201ENST00000284116 LRCH2Q5VUJ6 765 aa21.01■□□□□ 0.95
GDPD1-201ENST00000284116 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa21.01■□□□□ 0.95
GDPD1-201ENST00000284116 GPC2Q8N158 579 aa21.01■□□□□ 0.95
GDPD1-201ENST00000284116 EEF2KMTQ96G04 330 aa21.01■□□□□ 0.95
GDPD1-201ENST00000284116 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
GDPD1-201ENST00000284116 AS3MTQ9HBK9 375 aa21.01■□□□□ 0.95
GDPD1-201ENST00000284116 RPTORQ8N122 1335 aa21.01■□□□□ 0.95
GDPD1-201ENST00000284116 NFIBO00712 420 aa21.01■□□□□ 0.95
GDPD1-201ENST00000284116 FLOT1O75955 427 aa21.01■□□□□ 0.95
GDPD1-201ENST00000284116 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
GDPD1-201ENST00000284116 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa21.01■□□□□ 0.95
GDPD1-201ENST00000284116 CPXCR1Q8N123 301 aa21.01■□□□□ 0.95
GDPD1-201ENST00000284116 SAMD3Q8N6K7 520 aa21.01■□□□□ 0.95
GDPD1-201ENST00000284116 KIF18AQ8NI77 898 aa21.01■□□□□ 0.95
GDPD1-201ENST00000284116 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
GDPD1-201ENST00000284116 TSG101Q99816 390 aa21.01■□□□□ 0.95
GDPD1-201ENST00000284116 HSD17B14Q9BPX1 270 aa21.01■□□□□ 0.95
GDPD1-201ENST00000284116 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
GDPD1-201ENST00000284116 TUFT1Q9NNX1 390 aa21.01■□□□□ 0.95
GDPD1-201ENST00000284116 PARP14Q460N5 1801 aa21.01■□□□□ 0.95
GDPD1-201ENST00000284116 B4DLN1 442 aa21■□□□□ 0.95
GDPD1-201ENST00000284116 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP21■□□□□ 0.95
GDPD1-201ENST00000284116 KRT18P05783 430 aaKnown RBP21■□□□□ 0.95
GDPD1-201ENST00000284116 FDX1P10109 184 aa21■□□□□ 0.95
GDPD1-201ENST00000284116 ALAS1P13196 640 aa21■□□□□ 0.95
GDPD1-201ENST00000284116 PTPRAP18433 802 aa21■□□□□ 0.95
GDPD1-201ENST00000284116 LMNB1P20700 586 aa21■□□□□ 0.95
GDPD1-201ENST00000284116 BACE1P56817 501 aa21■□□□□ 0.95
GDPD1-201ENST00000284116 SETQ01105 290 aaPredicted RBP21■□□□□ 0.95
GDPD1-201ENST00000284116 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP21■□□□□ 0.95
GDPD1-201ENST00000284116 GIT2Q14161 759 aa21■□□□□ 0.95
GDPD1-201ENST00000284116 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP21■□□□□ 0.95
GDPD1-201ENST00000284116 WRNIP1Q96S55 665 aa21■□□□□ 0.95
GDPD1-201ENST00000284116 MXRA8Q9BRK3 442 aa21■□□□□ 0.95
GDPD1-201ENST00000284116 PICK1Q9NRD5 415 aa21■□□□□ 0.95
GDPD1-201ENST00000284116 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP21■□□□□ 0.95
GDPD1-201ENST00000284116 COL20A1Q9P218 1284 aa21■□□□□ 0.95
GDPD1-201ENST00000284116 PNMA2Q9UL42 364 aa21■□□□□ 0.95
GDPD1-201ENST00000284116 ZBED4O75132 1171 aa20.99■□□□□ 0.95
GDPD1-201ENST00000284116 EYA4O95677 639 aa20.99■□□□□ 0.95
GDPD1-201ENST00000284116 ARP10275 920 aa20.99■□□□□ 0.95
GDPD1-201ENST00000284116 CYP4A11Q02928 519 aa20.99■□□□□ 0.95
GDPD1-201ENST00000284116 MIIPQ5JXC2 388 aa20.99■□□□□ 0.95
GDPD1-201ENST00000284116 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa20.99■□□□□ 0.95
GDPD1-201ENST00000284116 ZNF280CQ8ND82 737 aa20.99■□□□□ 0.95
GDPD1-201ENST00000284116 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
GDPD1-201ENST00000284116 RGL1Q9NZL6 768 aa20.99■□□□□ 0.95
GDPD1-201ENST00000284116 SBF1O95248 1867 aa20.99■□□□□ 0.95
GDPD1-201ENST00000284116 PHIPQ8WWQ0 1821 aa20.99■□□□□ 0.95
GDPD1-201ENST00000284116 PES1O00541 588 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
GDPD1-201ENST00000284116 GAS7O60861 476 aa20.99■□□□□ 0.95
GDPD1-201ENST00000284116 SLITRK3O94933 977 aa20.99■□□□□ 0.95
GDPD1-201ENST00000284116 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
GDPD1-201ENST00000284116 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa20.99■□□□□ 0.95
GDPD1-201ENST00000284116 ZCWPW2Q504Y3 356 aa20.99■□□□□ 0.95
GDPD1-201ENST00000284116 SLC30A10Q6XR72 485 aa20.99■□□□□ 0.95
GDPD1-201ENST00000284116 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
GDPD1-201ENST00000284116 ZNF577Q9BSK1 485 aa20.99■□□□□ 0.95
GDPD1-201ENST00000284116 WDR11Q9BZH6 1224 aa20.99■□□□□ 0.95
GDPD1-201ENST00000284116 ABHD10Q9NUJ1 306 aa20.99■□□□□ 0.95
GDPD1-201ENST00000284116 TBC1D7Q9P0N9 293 aa20.99■□□□□ 0.95
GDPD1-201ENST00000284116 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa20.99■□□□□ 0.95
GDPD1-201ENST00000284116 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
GDPD1-201ENST00000284116 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
GDPD1-201ENST00000284116 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa20.98■□□□□ 0.95
GDPD1-201ENST00000284116 SOWAHDA6NJG2 315 aa20.98■□□□□ 0.95
GDPD1-201ENST00000284116 KRT9P35527 623 aa20.98■□□□□ 0.95
GDPD1-201ENST00000284116 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP20.98■□□□□ 0.95
GDPD1-201ENST00000284116 MUM1L1Q5H9M0 696 aa20.98■□□□□ 0.95
GDPD1-201ENST00000284116 RAD9BQ6WBX8 426 aa20.98■□□□□ 0.95
GDPD1-201ENST00000284116 LRRC55Q6ZSA7 311 aa20.98■□□□□ 0.95
GDPD1-201ENST00000284116 KRT26Q7Z3Y9 468 aa20.98■□□□□ 0.95
GDPD1-201ENST00000284116 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa20.98■□□□□ 0.95
GDPD1-201ENST00000284116 GGA3Q9NZ52 723 aa20.98■□□□□ 0.95
GDPD1-201ENST00000284116 KIF20AO95235 890 aa20.97■□□□□ 0.95
GDPD1-201ENST00000284116 BCRP11274 1271 aa20.97■□□□□ 0.95
GDPD1-201ENST00000284116 MUTP22033 750 aa20.97■□□□□ 0.95
GDPD1-201ENST00000284116 EPS15P42566 896 aa20.97■□□□□ 0.95
GDPD1-201ENST00000284116 ETF1P62495 437 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
GDPD1-201ENST00000284116 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa20.97■□□□□ 0.95
GDPD1-201ENST00000284116 MTF1Q14872 753 aa20.97■□□□□ 0.95
GDPD1-201ENST00000284116 TRIM65Q6PJ69 517 aa20.97■□□□□ 0.95
GDPD1-201ENST00000284116 B3GNT9Q6UX72 402 aa20.97■□□□□ 0.95
GDPD1-201ENST00000284116 NIPA1Q7RTP0 329 aa20.97■□□□□ 0.95
GDPD1-201ENST00000284116 TMTC1Q8IUR5 882 aa20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.5 ms