RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261266.9

PTPRB-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 6,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-201ENST00000261266 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
PTPRB-201ENST00000261266 MCPH1Q8NEM0 835 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRB-201ENST00000261266 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP9.8□□□□□ -0.84
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PTPRB-201ENST00000261266 PODXLO00592 558 aa9.8□□□□□ -0.84
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PTPRB-201ENST00000261266 SUN1O94901 812 aa9.8□□□□□ -0.84
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PTPRB-201ENST00000261266 TCP11X2Q5H9J9 407 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRB-201ENST00000261266 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRB-201ENST00000261266 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRB-201ENST00000261266 TTLL11Q8NHH1 800 aa9.79□□□□□ -0.84
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PTPRB-201ENST00000261266 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
PTPRB-201ENST00000261266 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa9.79□□□□□ -0.84
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PTPRB-201ENST00000261266 GNGT1P63211 74 aa9.79□□□□□ -0.84
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PTPRB-201ENST00000261266 ZNF341Q9BYN7 854 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-201ENST00000261266 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-201ENST00000261266 CCDC160A6NGH7 325 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-201ENST00000261266 AP3B1O00203 1094 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-201ENST00000261266 ZBTB5O15062 677 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-201ENST00000261266 ASNSP08243 561 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-201ENST00000261266 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-201ENST00000261266 ARL13BQ3SXY8 428 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-201ENST00000261266 CASC4Q6P4E1 433 aa9.78□□□□□ -0.84
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