RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249499.7

HOXD9-201, Transcript of homeobox D9, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD9, Length 1,870 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD9-201ENST00000249499 HSD17B4P51659 736 aa25.42■■□□□ 1.66
HOXD9-201ENST00000249499 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa25.42■■□□□ 1.66
HOXD9-201ENST00000249499 PPP2R5CQ13362 524 aa25.42■■□□□ 1.66
HOXD9-201ENST00000249499 ZCWPW2Q504Y3 356 aa25.42■■□□□ 1.66
HOXD9-201ENST00000249499 MIIPQ5JXC2 388 aa25.42■■□□□ 1.66
HOXD9-201ENST00000249499 RAD9BQ6WBX8 426 aa25.42■■□□□ 1.66
HOXD9-201ENST00000249499 OR8K1Q8NGG5 319 aa25.42■■□□□ 1.66
HOXD9-201ENST00000249499 SLC5A5Q92911 643 aa25.42■■□□□ 1.66
HOXD9-201ENST00000249499 TUFT1Q9NNX1 390 aa25.42■■□□□ 1.66
HOXD9-201ENST00000249499 POTEFA5A3E0 1075 aa25.41■■□□□ 1.66
HOXD9-201ENST00000249499 POTEIP0CG38 1075 aa25.41■■□□□ 1.66
HOXD9-201ENST00000249499 DCAF15Q66K64 600 aa25.41■■□□□ 1.66
HOXD9-201ENST00000249499 POTEGQ6S5H5 508 aa25.41■■□□□ 1.66
HOXD9-201ENST00000249499 POTEEQ6S8J3 1075 aa25.41■■□□□ 1.66
HOXD9-201ENST00000249499 A0A1W2PQJ5 194 aa25.4■■□□□ 1.66
HOXD9-201ENST00000249499 PSMD10O75832 226 aa25.4■■□□□ 1.66
HOXD9-201ENST00000249499 MAN2A1Q16706 1144 aa25.4■■□□□ 1.66
HOXD9-201ENST00000249499 CEP55Q53EZ4 464 aa25.4■■□□□ 1.66
HOXD9-201ENST00000249499 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa25.4■■□□□ 1.66
HOXD9-201ENST00000249499 LRRC55Q6ZSA7 311 aa25.4■■□□□ 1.66
HOXD9-201ENST00000249499 MCF2L2Q86YR7 1114 aa25.4■■□□□ 1.66
HOXD9-201ENST00000249499 FBXO28Q9NVF7 368 aa25.4■■□□□ 1.66
HOXD9-201ENST00000249499 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
HOXD9-201ENST00000249499 TTC26A0AVF1 554 aa25.4■■□□□ 1.66
HOXD9-201ENST00000249499 PES1O00541 588 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
HOXD9-201ENST00000249499 FDX1P10109 184 aa25.4■■□□□ 1.66
HOXD9-201ENST00000249499 USP14P54578 494 aa25.4■■□□□ 1.66
HOXD9-201ENST00000249499 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
HOXD9-201ENST00000249499 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
HOXD9-201ENST00000249499 OTOP1Q7RTM1 612 aa25.4■■□□□ 1.66
HOXD9-201ENST00000249499 KRT26Q7Z3Y9 468 aa25.4■■□□□ 1.66
HOXD9-201ENST00000249499 TBC1D5Q92609 795 aa25.4■■□□□ 1.66
HOXD9-201ENST00000249499 CEP63Q96MT8 703 aa25.4■■□□□ 1.66
HOXD9-201ENST00000249499 WDR18Q9BV38 432 aa25.4■■□□□ 1.66
HOXD9-201ENST00000249499 TTYH3Q9C0H2 523 aa25.4■■□□□ 1.66
HOXD9-201ENST00000249499 ZNF536O15090 1300 aa25.39■■□□□ 1.66
HOXD9-201ENST00000249499 SLU7O95391 586 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
HOXD9-201ENST00000249499 GNA14O95837 355 aa25.39■■□□□ 1.66
HOXD9-201ENST00000249499 EGFRP00533 1210 aa25.39■■□□□ 1.66
HOXD9-201ENST00000249499 KRT18P05783 430 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
HOXD9-201ENST00000249499 INPP5BP32019 993 aa25.39■■□□□ 1.66
HOXD9-201ENST00000249499 ARSHQ5FYA8 562 aa25.39■■□□□ 1.66
HOXD9-201ENST00000249499 CYP2W1Q8TAV3 490 aa25.39■■□□□ 1.66
HOXD9-201ENST00000249499 ERO1AQ96HE7 468 aa25.39■■□□□ 1.66
HOXD9-201ENST00000249499 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
HOXD9-201ENST00000249499 WDR11Q9BZH6 1224 aa25.39■■□□□ 1.66
HOXD9-201ENST00000249499 DNAI1Q9UI46 699 aa25.39■■□□□ 1.66
HOXD9-201ENST00000249499 HACL1Q9UJ83 578 aa25.39■■□□□ 1.66
HOXD9-201ENST00000249499 CCPG1Q9ULG6 757 aa25.39■■□□□ 1.66
HOXD9-201ENST00000249499 EYA4O95677 639 aa25.38■■□□□ 1.65
HOXD9-201ENST00000249499 MTF1Q14872 753 aa25.38■■□□□ 1.65
HOXD9-201ENST00000249499 VWA3BQ502W6 1294 aa25.38■■□□□ 1.65
HOXD9-201ENST00000249499 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
HOXD9-201ENST00000249499 LRCH2Q5VUJ6 765 aa25.38■■□□□ 1.65
HOXD9-201ENST00000249499 RPTORQ8N122 1335 aa25.38■■□□□ 1.65
HOXD9-201ENST00000249499 MEIS1O00470 390 aa25.38■■□□□ 1.65
HOXD9-201ENST00000249499 NIPA1Q7RTP0 329 aa25.38■■□□□ 1.65
HOXD9-201ENST00000249499 ANKRD7Q92527 254 aa25.38■■□□□ 1.65
HOXD9-201ENST00000249499 HSD17B14Q9BPX1 270 aa25.38■■□□□ 1.65
HOXD9-201ENST00000249499 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
HOXD9-201ENST00000249499 BCRP11274 1271 aa25.37■■□□□ 1.65
HOXD9-201ENST00000249499 ERVK-24P63145 666 aa25.37■■□□□ 1.65
HOXD9-201ENST00000249499 GIT2Q14161 759 aa25.37■■□□□ 1.65
HOXD9-201ENST00000249499 MEA1Q16626 185 aa25.37■■□□□ 1.65
HOXD9-201ENST00000249499 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
HOXD9-201ENST00000249499 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
HOXD9-201ENST00000249499 DESI2Q9BSY9 194 aa25.37■■□□□ 1.65
HOXD9-201ENST00000249499 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
HOXD9-201ENST00000249499 MARSP56192 900 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
HOXD9-201ENST00000249499 ZBED6P86452 979 aa25.36■■□□□ 1.65
HOXD9-201ENST00000249499 EDRF1Q3B7T1 1238 aa25.36■■□□□ 1.65
HOXD9-201ENST00000249499 SAMD7Q7Z3H4 446 aa25.36■■□□□ 1.65
HOXD9-201ENST00000249499 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
HOXD9-201ENST00000249499 NDST4Q9H3R1 872 aa25.36■■□□□ 1.65
HOXD9-201ENST00000249499 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa25.36■■□□□ 1.65
HOXD9-201ENST00000249499 ZNF112Q9UJU3 913 aa25.36■■□□□ 1.65
HOXD9-201ENST00000249499 PRELPP51888 382 aa25.36■■□□□ 1.65
HOXD9-201ENST00000249499 LRRC41Q15345 812 aa25.36■■□□□ 1.65
HOXD9-201ENST00000249499 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa25.36■■□□□ 1.65
HOXD9-201ENST00000249499 UIMC1Q96RL1 719 aa25.36■■□□□ 1.65
HOXD9-201ENST00000249499 RIT2Q99578 217 aa25.36■■□□□ 1.65
HOXD9-201ENST00000249499 EMILIN3Q9NT22 766 aa25.36■■□□□ 1.65
HOXD9-201ENST00000249499 PSMC6P62333 389 aa25.35■■□□□ 1.65
HOXD9-201ENST00000249499 RBM10P98175 930 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
HOXD9-201ENST00000249499 CDK17Q00537 523 aa25.35■■□□□ 1.65
HOXD9-201ENST00000249499 RASSF7Q02833 373 aa25.35■■□□□ 1.65
HOXD9-201ENST00000249499 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP25.35■■□□□ 1.65
HOXD9-201ENST00000249499 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
HOXD9-201ENST00000249499 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
HOXD9-201ENST00000249499 AS3MTQ9HBK9 375 aa25.35■■□□□ 1.65
HOXD9-201ENST00000249499 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa25.35■■□□□ 1.65
HOXD9-201ENST00000249499 GJA3Q9Y6H8 435 aa25.35■■□□□ 1.65
HOXD9-201ENST00000249499 SBF1O95248 1867 aa25.35■■□□□ 1.65
HOXD9-201ENST00000249499 EML1O00423 815 aa25.34■■□□□ 1.65
HOXD9-201ENST00000249499 GAS7O60861 476 aa25.34■■□□□ 1.65
HOXD9-201ENST00000249499 GNG11P61952 73 aa25.34■■□□□ 1.65
HOXD9-201ENST00000249499 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
HOXD9-201ENST00000249499 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
HOXD9-201ENST00000249499 B3GNT9Q6UX72 402 aa25.34■■□□□ 1.65
HOXD9-201ENST00000249499 ZNF710Q8N1W2 664 aa25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.8 ms