RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243056.4

HOXC13-201, Transcript of homeobox C13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXC13, Length 2,423 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13-201ENST00000243056 TIAM2Q8IVF5 1701 aa21.89■■□□□ 1.09
HOXC13-201ENST00000243056 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
HOXC13-201ENST00000243056 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
HOXC13-201ENST00000243056 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
HOXC13-201ENST00000243056 SEC23AQ15436 765 aa21.89■■□□□ 1.09
HOXC13-201ENST00000243056 OGFOD1Q8N543 542 aa21.89■■□□□ 1.09
HOXC13-201ENST00000243056 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
HOXC13-201ENST00000243056 PHKBQ93100 1093 aa21.89■■□□□ 1.09
HOXC13-201ENST00000243056 TMEM87BQ96K49 555 aa21.89■■□□□ 1.09
HOXC13-201ENST00000243056 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
HOXC13-201ENST00000243056 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXC13-201ENST00000243056 ZNF233A6NK53 670 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXC13-201ENST00000243056 PYGBP11216 843 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXC13-201ENST00000243056 RASA1P20936 1047 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXC13-201ENST00000243056 SAMD7Q7Z3H4 446 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXC13-201ENST00000243056 LRRC1Q9BTT6 524 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXC13-201ENST00000243056 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
HOXC13-201ENST00000243056 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
HOXC13-201ENST00000243056 SPDYE3A6NKU9 549 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXC13-201ENST00000243056 CDC25AP30304 524 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXC13-201ENST00000243056 LAMB3Q13751 1172 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXC13-201ENST00000243056 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
HOXC13-201ENST00000243056 RESP18Q5W5W9 173 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXC13-201ENST00000243056 CCDC51Q96ER9 411 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXC13-201ENST00000243056 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
HOXC13-201ENST00000243056 ABHD10Q9NUJ1 306 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXC13-201ENST00000243056 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
HOXC13-201ENST00000243056 SLC12A7Q9Y666 1083 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXC13-201ENST00000243056 SPDYE2BA6NHP3 402 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXC13-201ENST00000243056 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
HOXC13-201ENST00000243056 SPDYE6P0CI01 402 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXC13-201ENST00000243056 EPHB4P54760 987 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXC13-201ENST00000243056 EIF6P56537 245 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
HOXC13-201ENST00000243056 MFN1Q8IWA4 741 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXC13-201ENST00000243056 AIFM3Q96NN9 605 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXC13-201ENST00000243056 ORC4O43929 436 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXC13-201ENST00000243056 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP21.87■■□□□ 1.09
HOXC13-201ENST00000243056 SLC7A5Q01650 507 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXC13-201ENST00000243056 DLGAP5Q15398 846 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXC13-201ENST00000243056 FBXL16Q8N461 479 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXC13-201ENST00000243056 NAV1Q8NEY1 1877 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXC13-201ENST00000243056 ZBTB43O43298 467 aa21.86■■□□□ 1.09
HOXC13-201ENST00000243056 PPARDQ03181 441 aa21.86■■□□□ 1.09
HOXC13-201ENST00000243056 CYP26C1Q6V0L0 522 aa21.86■■□□□ 1.09
HOXC13-201ENST00000243056 MLKLQ8NB16 471 aa21.86■■□□□ 1.09
HOXC13-201ENST00000243056 OSBPL9Q96SU4 736 aa21.86■■□□□ 1.09
HOXC13-201ENST00000243056 NEFHP12036 1026 aa21.86■■□□□ 1.09
HOXC13-201ENST00000243056 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
HOXC13-201ENST00000243056 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
HOXC13-201ENST00000243056 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
HOXC13-201ENST00000243056 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
HOXC13-201ENST00000243056 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
HOXC13-201ENST00000243056 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa21.86■■□□□ 1.09
HOXC13-201ENST00000243056 DNAJC18Q9H819 358 aa21.86■■□□□ 1.09
HOXC13-201ENST00000243056 MYH1P12882 1939 aa21.86■■□□□ 1.09
HOXC13-201ENST00000243056 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa21.85■■□□□ 1.09
HOXC13-201ENST00000243056 PES1O00541 588 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
HOXC13-201ENST00000243056 TSPY3P0CV98 308 aa21.85■■□□□ 1.09
HOXC13-201ENST00000243056 TSPY8P0CW00 308 aa21.85■■□□□ 1.09
HOXC13-201ENST00000243056 MORC3Q14149 939 aa21.85■■□□□ 1.09
HOXC13-201ENST00000243056 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
HOXC13-201ENST00000243056 C16orf86Q6ZW13 317 aa21.85■■□□□ 1.09
HOXC13-201ENST00000243056 WDR19Q8NEZ3 1342 aa21.85■■□□□ 1.09
HOXC13-201ENST00000243056 GOLGA8AA7E2F4 631 aa21.85■■□□□ 1.09
HOXC13-201ENST00000243056 PPFIA2O75334 1257 aa21.85■■□□□ 1.09
HOXC13-201ENST00000243056 UPP2O95045 317 aa21.85■■□□□ 1.09
HOXC13-201ENST00000243056 LIFRP42702 1097 aa21.85■■□□□ 1.09
HOXC13-201ENST00000243056 MTA1Q13330 715 aa21.85■■□□□ 1.09
HOXC13-201ENST00000243056 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
HOXC13-201ENST00000243056 EMBQ6PCB8 327 aa21.85■■□□□ 1.09
HOXC13-201ENST00000243056 SGMS1Q86VZ5 419 aa21.85■■□□□ 1.09
HOXC13-201ENST00000243056 ZNF654Q8IZM8 581 aa21.85■■□□□ 1.09
HOXC13-201ENST00000243056 EHBP1Q8NDI1 1231 aa21.85■■□□□ 1.09
HOXC13-201ENST00000243056 CAVIN3Q969G5 261 aa21.85■■□□□ 1.09
HOXC13-201ENST00000243056 HVCN1Q96D96 273 aa21.85■■□□□ 1.09
HOXC13-201ENST00000243056 CHP1Q99653 195 aa21.85■■□□□ 1.09
HOXC13-201ENST00000243056 EPAS1Q99814 870 aa21.85■■□□□ 1.09
HOXC13-201ENST00000243056 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
HOXC13-201ENST00000243056 STX8Q9UNK0 236 aa21.85■■□□□ 1.09
HOXC13-201ENST00000243056 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
HOXC13-201ENST00000243056 A6NHS1 94 aa21.84■■□□□ 1.09
HOXC13-201ENST00000243056 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
HOXC13-201ENST00000243056 KIF4AO95239 1232 aa21.84■■□□□ 1.09
HOXC13-201ENST00000243056 BLMHQ13867 455 aa21.84■■□□□ 1.09
HOXC13-201ENST00000243056 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
HOXC13-201ENST00000243056 MMGT1Q8N4V1 131 aa21.84■■□□□ 1.09
HOXC13-201ENST00000243056 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
HOXC13-201ENST00000243056 KCNH3Q9ULD8 1083 aa21.84■■□□□ 1.09
HOXC13-201ENST00000243056 WNT10BO00744 389 aa21.84■■□□□ 1.09
HOXC13-201ENST00000243056 CPLX1O14810 134 aa21.84■■□□□ 1.09
HOXC13-201ENST00000243056 GNAT1P11488 350 aa21.84■■□□□ 1.09
HOXC13-201ENST00000243056 USP4Q13107 963 aa21.84■■□□□ 1.09
HOXC13-201ENST00000243056 PTPAQ15257 358 aa21.84■■□□□ 1.09
HOXC13-201ENST00000243056 PIK3R5Q8WYR1 880 aa21.84■■□□□ 1.09
HOXC13-201ENST00000243056 SEC16BQ96JE7 1060 aa21.84■■□□□ 1.09
HOXC13-201ENST00000243056 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
HOXC13-201ENST00000243056 MRIQ9BWK5 157 aa21.84■■□□□ 1.09
HOXC13-201ENST00000243056 VPS33BQ9H267 617 aa21.84■■□□□ 1.09
HOXC13-201ENST00000243056 FZD9O00144 591 aa21.83■■□□□ 1.09
HOXC13-201ENST00000243056 MYBL1P10243 752 aa21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms