RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000075084.4

Trim58-201, Transcript of E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trim58, Length 2,192 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58-201ENSMUST00000075084 Lig1P37913 916 aa20.34■□□□□ 0.85
Trim58-201ENSMUST00000075084 Kif5bQ61768 963 aa20.34■□□□□ 0.85
Trim58-201ENSMUST00000075084 Eif3j2Q66JS6 263 aa20.34■□□□□ 0.85
Trim58-201ENSMUST00000075084 Pabpc4Q6PHQ9 660 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
Trim58-201ENSMUST00000075084 Morc2bQ8C5W4 1022 aa20.34■□□□□ 0.85
Trim58-201ENSMUST00000075084 PccaQ91ZA3 724 aa20.34■□□□□ 0.85
Trim58-201ENSMUST00000075084 Smtnl1Q99LM3 459 aa20.34■□□□□ 0.85
Trim58-201ENSMUST00000075084 2310002L09RikQ9D7L5 217 aa20.34■□□□□ 0.85
Trim58-201ENSMUST00000075084 Ttc6G3UYY4 1857 aa20.33■□□□□ 0.85
Trim58-201ENSMUST00000075084 Krt36B1AQ75 473 aa20.33■□□□□ 0.85
Trim58-201ENSMUST00000075084 Akap2O54931 893 aa20.33■□□□□ 0.85
Trim58-201ENSMUST00000075084 Dnajb6O54946 365 aa20.33■□□□□ 0.85
Trim58-201ENSMUST00000075084 AurkbO70126 345 aa20.33■□□□□ 0.85
Trim58-201ENSMUST00000075084 Kifap3P70188 793 aa20.33■□□□□ 0.85
Trim58-201ENSMUST00000075084 Rasip1Q3U0S6 961 aa20.33■□□□□ 0.85
Trim58-201ENSMUST00000075084 Gpr162Q3UN16 588 aa20.33■□□□□ 0.85
Trim58-201ENSMUST00000075084 Psen2Q61144 448 aa20.33■□□□□ 0.85
Trim58-201ENSMUST00000075084 Fbxo10Q7TQF2 950 aa20.33■□□□□ 0.85
Trim58-201ENSMUST00000075084 NkrfQ8BY02 690 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
Trim58-201ENSMUST00000075084 Rfc4Q99J62 364 aa20.33■□□□□ 0.85
Trim58-201ENSMUST00000075084 CoasyQ9DBL7 563 aa20.33■□□□□ 0.85
Trim58-201ENSMUST00000075084 Ipo7Q9EPL8 1038 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
Trim58-201ENSMUST00000075084 Tnip1Q9WUU8 647 aa20.33■□□□□ 0.85
Trim58-201ENSMUST00000075084 Arhgap6O54834 987 aa20.32■□□□□ 0.84
Trim58-201ENSMUST00000075084 Trak2Q6P9N8 913 aa20.32■□□□□ 0.84
Trim58-201ENSMUST00000075084 Spag5Q7TME2 1165 aa20.32■□□□□ 0.84
Trim58-201ENSMUST00000075084 Tmc3Q7TQ69 1130 aa20.32■□□□□ 0.84
Trim58-201ENSMUST00000075084 Gprasp2Q8BUY8 826 aa20.32■□□□□ 0.84
Trim58-201ENSMUST00000075084 Hgh1Q8C3I8 393 aa20.32■□□□□ 0.84
Trim58-201ENSMUST00000075084 Ppfibp1Q8C8U0 969 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
Trim58-201ENSMUST00000075084 Rbm41Q8JZV4 413 aa20.32■□□□□ 0.84
Trim58-201ENSMUST00000075084 Bbs7Q8K2G4 715 aa20.32■□□□□ 0.84
Trim58-201ENSMUST00000075084 Fam13bQ8K2H3 851 aa20.32■□□□□ 0.84
Trim58-201ENSMUST00000075084 Kif17Q99PW8 1038 aa20.32■□□□□ 0.84
Trim58-201ENSMUST00000075084 Arhgef25Q9CWR0 618 aa20.32■□□□□ 0.84
Trim58-201ENSMUST00000075084 Nova2D3YVV7 556 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
Trim58-201ENSMUST00000075084 Nkx2-5P42582 318 aa20.32■□□□□ 0.84
Trim58-201ENSMUST00000075084 NogP97466 232 aa20.32■□□□□ 0.84
Trim58-201ENSMUST00000075084 Wdr70Q3TWF6 657 aa20.32■□□□□ 0.84
Trim58-201ENSMUST00000075084 Sp4Q62445 782 aa20.32■□□□□ 0.84
Trim58-201ENSMUST00000075084 Ctdp1Q7TSG2 960 aa20.32■□□□□ 0.84
Trim58-201ENSMUST00000075084 Defb15Q8R2I5 79 aa20.32■□□□□ 0.84
Trim58-201ENSMUST00000075084 Tpcn1Q9EQJ0 817 aa20.32■□□□□ 0.84
Trim58-201ENSMUST00000075084 Trappc11B2RXC1 1133 aa20.31■□□□□ 0.84
Trim58-201ENSMUST00000075084 H2afxP27661 143 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
Trim58-201ENSMUST00000075084 Znf827Q505G8 1078 aa20.31■□□□□ 0.84
Trim58-201ENSMUST00000075084 WhrnQ80VW5 918 aa20.31■□□□□ 0.84
Trim58-201ENSMUST00000075084 GanQ8CA72 597 aa20.31■□□□□ 0.84
Trim58-201ENSMUST00000075084 Gprc5cQ8K3J9 440 aa20.31■□□□□ 0.84
Trim58-201ENSMUST00000075084 Rpap2Q8VC34 614 aa20.31■□□□□ 0.84
Trim58-201ENSMUST00000075084 Ears2Q9CXJ1 523 aa20.31■□□□□ 0.84
Trim58-201ENSMUST00000075084 FignQ9ERZ6 759 aa20.31■□□□□ 0.84
Trim58-201ENSMUST00000075084 Stk32bQ9JJX8 414 aa20.31■□□□□ 0.84
Trim58-201ENSMUST00000075084 Samd1D3YXK1 519 aa20.31■□□□□ 0.84
Trim58-201ENSMUST00000075084 Nlrx1Q3TL44 975 aa20.31■□□□□ 0.84
Trim58-201ENSMUST00000075084 Rsad1Q5SUV1 442 aa20.31■□□□□ 0.84
Trim58-201ENSMUST00000075084 Zfp341Q6PGC9 846 aa20.31■□□□□ 0.84
Trim58-201ENSMUST00000075084 Naa35Q6PHQ8 725 aa20.31■□□□□ 0.84
Trim58-201ENSMUST00000075084 Drc7Q6V3W6 876 aa20.31■□□□□ 0.84
Trim58-201ENSMUST00000075084 Tmco3Q8BH01 678 aa20.31■□□□□ 0.84
Trim58-201ENSMUST00000075084 Traf3ip3Q8C0G2 513 aa20.31■□□□□ 0.84
Trim58-201ENSMUST00000075084 PurbO35295 324 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
Trim58-201ENSMUST00000075084 Dph1Q5NCQ5 438 aa20.3■□□□□ 0.84
Trim58-201ENSMUST00000075084 Znf532Q6NXK2 1036 aa20.3■□□□□ 0.84
Trim58-201ENSMUST00000075084 Haus4Q8BFT2 363 aa20.3■□□□□ 0.84
Trim58-201ENSMUST00000075084 Phf20l1Q8CCJ9 1013 aa20.3■□□□□ 0.84
Trim58-201ENSMUST00000075084 Appl2Q8K3G9 662 aa20.3■□□□□ 0.84
Trim58-201ENSMUST00000075084 Slc18a1Q8R090 521 aa20.3■□□□□ 0.84
Trim58-201ENSMUST00000075084 Ccdc96Q9CR92 584 aa20.3■□□□□ 0.84
Trim58-201ENSMUST00000075084 Lekr1B2RVN1 116 aa20.29■□□□□ 0.84
Trim58-201ENSMUST00000075084 Apol6B7ZC55 329 aa20.29■□□□□ 0.84
Trim58-201ENSMUST00000075084 Pth1rP41593 591 aa20.29■□□□□ 0.84
Trim58-201ENSMUST00000075084 Bace1P56818 501 aa20.29■□□□□ 0.84
Trim58-201ENSMUST00000075084 Trim43cP86449 446 aa20.29■□□□□ 0.84
Trim58-201ENSMUST00000075084 Meis3P97368 378 aa20.29■□□□□ 0.84
Trim58-201ENSMUST00000075084 Brd9Q3UQU0 596 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
Trim58-201ENSMUST00000075084 Fam183bQ5NC57 135 aa20.29■□□□□ 0.84
Trim58-201ENSMUST00000075084 Tlr13Q6R5N8 991 aa20.29■□□□□ 0.84
Trim58-201ENSMUST00000075084 Maip1Q8BHE8 291 aa20.29■□□□□ 0.84
Trim58-201ENSMUST00000075084 Cdk17Q8K0D0 523 aa20.29■□□□□ 0.84
Trim58-201ENSMUST00000075084 NapgQ9CWZ7 312 aa20.29■□□□□ 0.84
Trim58-201ENSMUST00000075084 Lrp2bpQ9D4C6 346 aa20.29■□□□□ 0.84
Trim58-201ENSMUST00000075084 Extl2Q9ES89 330 aa20.29■□□□□ 0.84
Trim58-201ENSMUST00000075084 Tjp3Q9QXY1 905 aa20.29■□□□□ 0.84
Trim58-201ENSMUST00000075084 Usp31E9Q6Y8 1344 aa20.29■□□□□ 0.84
Trim58-201ENSMUST00000075084 Fyb2A2A995 729 aa20.29■□□□□ 0.84
Trim58-201ENSMUST00000075084 Vmn2r78K7N6U5 853 aa20.29■□□□□ 0.84
Trim58-201ENSMUST00000075084 Parp2O88554 559 aa20.29■□□□□ 0.84
Trim58-201ENSMUST00000075084 Fgfr2P21803 821 aa20.29■□□□□ 0.84
Trim58-201ENSMUST00000075084 Ifnar1P33896 590 aa20.29■□□□□ 0.84
Trim58-201ENSMUST00000075084 Cbx1P83917 185 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
Trim58-201ENSMUST00000075084 Irf6P97431 467 aa20.29■□□□□ 0.84
Trim58-201ENSMUST00000075084 Nlrp4cQ3TKR3 982 aa20.29■□□□□ 0.84
Trim58-201ENSMUST00000075084 Carmil2Q3V3V9 1296 aa20.29■□□□□ 0.84
Trim58-201ENSMUST00000075084 Sema4bQ62179 823 aa20.29■□□□□ 0.84
Trim58-201ENSMUST00000075084 Rhbdf1Q6PIX5 856 aa20.29■□□□□ 0.84
Trim58-201ENSMUST00000075084 PodnQ7TQ62 611 aa20.29■□□□□ 0.84
Trim58-201ENSMUST00000075084 Cdc23Q8BGZ4 597 aa20.29■□□□□ 0.84
Trim58-201ENSMUST00000075084 Rab11fip4Q8BQP8 635 aa20.29■□□□□ 0.84
Trim58-201ENSMUST00000075084 Q8CEZ4 452 aa20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 31.8 ms