RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618610.1

PTPRT-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 3,230 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-211ENST00000618610 HOMER3Q9NSC5 361 aa9□□□□□ -0.97
PTPRT-211ENST00000618610 ZSWIM5Q9P217 1185 aa9□□□□□ -0.97
PTPRT-211ENST00000618610 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa9□□□□□ -0.97
PTPRT-211ENST00000618610 MST1RQ04912 1400 aa9□□□□□ -0.97
PTPRT-211ENST00000618610 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
PTPRT-211ENST00000618610 LAMA4Q16363 1823 aa9□□□□□ -0.97
PTPRT-211ENST00000618610 AHCYL1O43865 530 aa9□□□□□ -0.97
PTPRT-211ENST00000618610 RNF8O76064 485 aa9□□□□□ -0.97
PTPRT-211ENST00000618610 FESP07332 822 aa9□□□□□ -0.97
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PTPRT-211ENST00000618610 HSD17B3P37058 310 aa9□□□□□ -0.97
PTPRT-211ENST00000618610 MFSD6Q6ZSS7 791 aa9□□□□□ -0.97
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PTPRT-211ENST00000618610 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
PTPRT-211ENST00000618610 CCDC197Q8NCU1 140 aa9□□□□□ -0.97
PTPRT-211ENST00000618610 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP9□□□□□ -0.97
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PTPRT-211ENST00000618610 OCEL1Q9H607 264 aa9□□□□□ -0.97
PTPRT-211ENST00000618610 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
PTPRT-211ENST00000618610 C5P01031 1676 aa9□□□□□ -0.97
PTPRT-211ENST00000618610 KIF1AQ12756 1690 aa9□□□□□ -0.97
PTPRT-211ENST00000618610 ITIH6Q6UXX5 1313 aa9□□□□□ -0.97
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PTPRT-211ENST00000618610 TLDC2A0PJX2 215 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRT-211ENST00000618610 UBOX5O94941 541 aa8.99□□□□□ -0.97
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PTPRT-211ENST00000618610 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
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PTPRT-211ENST00000618610 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
PTPRT-211ENST00000618610 RTN1Q16799 776 aa8.99□□□□□ -0.97
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PTPRT-211ENST00000618610 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
PTPRT-211ENST00000618610 SPATA21Q7Z572 469 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRT-211ENST00000618610 KSR1Q8IVT5 923 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRT-211ENST00000618610 SYCP3Q8IZU3 236 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRT-211ENST00000618610 MB21D1Q8N884 522 aa8.99□□□□□ -0.97
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PTPRT-211ENST00000618610 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
PTPRT-211ENST00000618610 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
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PTPRT-211ENST00000618610 HYOU1Q9Y4L1 999 aa8.99□□□□□ -0.97
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PTPRT-211ENST00000618610 RAD51CO43502 376 aa8.99□□□□□ -0.97
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PTPRT-211ENST00000618610 WTAPQ15007 396 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRT-211ENST00000618610 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa8.99□□□□□ -0.97
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PTPRT-211ENST00000618610 TXNRD3Q86VQ6 643 aa8.99□□□□□ -0.97
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PTPRT-211ENST00000618610 KIAA0825Q8IV33 1275 aa8.99□□□□□ -0.97
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PTPRT-211ENST00000618610 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
PTPRT-211ENST00000618610 NEUROG2Q9H2A3 272 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRT-211ENST00000618610 GOLPH3Q9H4A6 298 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRT-211ENST00000618610 RGL1Q9NZL6 768 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRT-211ENST00000618610 LRP2BPQ9P2M1 347 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRT-211ENST00000618610 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
PTPRT-211ENST00000618610 SLIT3O75094 1523 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRT-211ENST00000618610 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRT-211ENST00000618610 H0Y3Z8 333 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRT-211ENST00000618610 RFC5P40937 340 aa8.98□□□□□ -0.97
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PTPRT-211ENST00000618610 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
PTPRT-211ENST00000618610 ADGRA1Q86SQ6 560 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRT-211ENST00000618610 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
PTPRT-211ENST00000618610 MTMR8Q96EF0 704 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRT-211ENST00000618610 TLR10Q9BXR5 811 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRT-211ENST00000618610 TRIM4Q9C037 500 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRT-211ENST00000618610 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
PTPRT-211ENST00000618610 ECT2Q9H8V3 914 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRT-211ENST00000618610 LY9Q9HBG7 655 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRT-211ENST00000618610 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
PTPRT-211ENST00000618610 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
PTPRT-211ENST00000618610 GGA2Q9UJY4 613 aa8.98□□□□□ -0.97
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