RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618056.4

PMS1-220, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 1,468 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-220ENST00000618056 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
PMS1-220ENST00000618056 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
PMS1-220ENST00000618056 C8orf34Q49A92 452 aa28.54■■■□□ 2.16
PMS1-220ENST00000618056 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
PMS1-220ENST00000618056 MYSM1Q5VVJ2 828 aa28.54■■■□□ 2.16
PMS1-220ENST00000618056 EHMT1Q9H9B1 1298 aa28.54■■■□□ 2.16
PMS1-220ENST00000618056 TBX21Q9UL17 535 aa28.54■■■□□ 2.16
PMS1-220ENST00000618056 ESYT2A0FGR8 921 aa28.53■■■□□ 2.16
PMS1-220ENST00000618056 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa28.53■■■□□ 2.16
PMS1-220ENST00000618056 TLR3O15455 904 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
PMS1-220ENST00000618056 FIBPO43427 364 aa28.53■■■□□ 2.16
PMS1-220ENST00000618056 FOSP01100 380 aaPredicted RBP28.53■■■□□ 2.16
PMS1-220ENST00000618056 CD4P01730 458 aa28.53■■■□□ 2.16
PMS1-220ENST00000618056 SP2Q02086 613 aa28.53■■■□□ 2.16
PMS1-220ENST00000618056 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP28.53■■■□□ 2.16
PMS1-220ENST00000618056 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
PMS1-220ENST00000618056 SLC26A6Q9BXS9 759 aa28.53■■■□□ 2.16
PMS1-220ENST00000618056 RTEL1Q9NZ71 1219 aa28.53■■■□□ 2.16
PMS1-220ENST00000618056 GGPS1O95749 300 aa28.53■■■□□ 2.16
PMS1-220ENST00000618056 CLK2P49760 499 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
PMS1-220ENST00000618056 SEMA3FQ13275 785 aa28.53■■■□□ 2.16
PMS1-220ENST00000618056 DGKDQ16760 1214 aa28.53■■■□□ 2.16
PMS1-220ENST00000618056 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
PMS1-220ENST00000618056 ZMYND12Q9H0C1 365 aa28.53■■■□□ 2.16
PMS1-220ENST00000618056 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP28.52■■■□□ 2.16
PMS1-220ENST00000618056 AP3B2Q13367 1082 aa28.52■■■□□ 2.16
PMS1-220ENST00000618056 ANKRD1Q15327 319 aa28.52■■■□□ 2.16
PMS1-220ENST00000618056 NLRX1Q86UT6 975 aa28.52■■■□□ 2.16
PMS1-220ENST00000618056 ITGB8P26012 769 aa28.51■■■□□ 2.15
PMS1-220ENST00000618056 NFRKBQ6P4R8 1299 aa28.51■■■□□ 2.15
PMS1-220ENST00000618056 TRIM22Q8IYM9 498 aa28.51■■■□□ 2.15
PMS1-220ENST00000618056 GPRASP2Q96D09 838 aa28.51■■■□□ 2.15
PMS1-220ENST00000618056 SENP7Q9BQF6 1050 aa28.51■■■□□ 2.15
PMS1-220ENST00000618056 CPLX1O14810 134 aa28.5■■■□□ 2.15
PMS1-220ENST00000618056 RAG1P15918 1043 aa28.5■■■□□ 2.15
PMS1-220ENST00000618056 NEDD9Q14511 834 aa28.5■■■□□ 2.15
PMS1-220ENST00000618056 BADQ92934 168 aa28.5■■■□□ 2.15
PMS1-220ENST00000618056 SZT2Q5T011 3432 aa28.49■■■□□ 2.15
PMS1-220ENST00000618056 PPFIA4O75335 1185 aa28.49■■■□□ 2.15
PMS1-220ENST00000618056 AK2P54819 239 aa28.49■■■□□ 2.15
PMS1-220ENST00000618056 STK3Q13188 491 aa28.49■■■□□ 2.15
PMS1-220ENST00000618056 NBPF20Q3BBV1 942 aa28.49■■■□□ 2.15
PMS1-220ENST00000618056 HSDL1Q3SXM5 330 aa28.49■■■□□ 2.15
PMS1-220ENST00000618056 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP28.49■■■□□ 2.15
PMS1-220ENST00000618056 CDHR1Q96JP9 859 aa28.49■■■□□ 2.15
PMS1-220ENST00000618056 SPATA33Q96N06 139 aa28.49■■■□□ 2.15
PMS1-220ENST00000618056 ANO3Q9BYT9 981 aa28.49■■■□□ 2.15
PMS1-220ENST00000618056 MLXIPQ9HAP2 919 aa28.49■■■□□ 2.15
PMS1-220ENST00000618056 C6orf50Q9HD87 102 aa28.49■■■□□ 2.15
PMS1-220ENST00000618056 TPCN1Q9ULQ1 816 aa28.49■■■□□ 2.15
PMS1-220ENST00000618056 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa28.49■■■□□ 2.15
PMS1-220ENST00000618056 TIMP1P01033 207 aa28.48■■■□□ 2.15
PMS1-220ENST00000618056 ITGB5P18084 799 aa28.48■■■□□ 2.15
PMS1-220ENST00000618056 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
PMS1-220ENST00000618056 METTL7BQ6UX53 244 aa28.48■■■□□ 2.15
PMS1-220ENST00000618056 TDHQ8IZJ6 230 aa28.48■■■□□ 2.15
PMS1-220ENST00000618056 CCDC148Q8NFR7 591 aa28.48■■■□□ 2.15
PMS1-220ENST00000618056 KAT2BQ92831 832 aa28.48■■■□□ 2.15
PMS1-220ENST00000618056 B4GALT4O60513 344 aa28.47■■■□□ 2.15
PMS1-220ENST00000618056 PPFIA3O75145 1194 aa28.47■■■□□ 2.15
PMS1-220ENST00000618056 GNA11P29992 359 aa28.47■■■□□ 2.15
PMS1-220ENST00000618056 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP28.47■■■□□ 2.15
PMS1-220ENST00000618056 MCTP2Q6DN12 878 aa28.47■■■□□ 2.15
PMS1-220ENST00000618056 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP28.47■■■□□ 2.15
PMS1-220ENST00000618056 SH3GLB2Q9NR46 395 aa28.47■■■□□ 2.15
PMS1-220ENST00000618056 MAFGO15525 162 aa28.46■■■□□ 2.15
PMS1-220ENST00000618056 PFKFB2O60825 505 aa28.46■■■□□ 2.15
PMS1-220ENST00000618056 SREBF1P36956 1147 aa28.46■■■□□ 2.15
PMS1-220ENST00000618056 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP28.46■■■□□ 2.15
PMS1-220ENST00000618056 SCRN1Q12765 414 aa28.46■■■□□ 2.15
PMS1-220ENST00000618056 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP28.46■■■□□ 2.15
PMS1-220ENST00000618056 TRPV6Q9H1D0 765 aa28.46■■■□□ 2.15
PMS1-220ENST00000618056 BCAS3Q9H6U6 928 aa28.46■■■□□ 2.15
PMS1-220ENST00000618056 JADE2Q9NQC1 790 aa28.46■■■□□ 2.15
PMS1-220ENST00000618056 TMEM260Q9NX78 707 aa28.46■■■□□ 2.15
PMS1-220ENST00000618056 DEXIO95424 95 aa28.46■■■□□ 2.15
PMS1-220ENST00000618056 F2P00734 622 aa28.46■■■□□ 2.15
PMS1-220ENST00000618056 PGBD1Q96JS3 809 aa28.46■■■□□ 2.15
PMS1-220ENST00000618056 KATNAL1Q9BW62 490 aa28.46■■■□□ 2.15
PMS1-220ENST00000618056 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP28.45■■■□□ 2.15
PMS1-220ENST00000618056 CDKL5O76039 1030 aa28.45■■■□□ 2.14
PMS1-220ENST00000618056 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa28.45■■■□□ 2.14
PMS1-220ENST00000618056 NEK4P51957 841 aa28.45■■■□□ 2.14
PMS1-220ENST00000618056 MTMR1Q13613 665 aa28.45■■■□□ 2.14
PMS1-220ENST00000618056 CYFIP1Q7L576 1253 aa28.45■■■□□ 2.14
PMS1-220ENST00000618056 SESTD1Q86VW0 696 aa28.45■■■□□ 2.14
PMS1-220ENST00000618056 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP28.45■■■□□ 2.14
PMS1-220ENST00000618056 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.14
PMS1-220ENST00000618056 BICD2Q8TD16 824 aa28.45■■■□□ 2.14
PMS1-220ENST00000618056 SORBS3O60504 671 aa28.44■■■□□ 2.14
PMS1-220ENST00000618056 MFSD5Q6N075 450 aa28.44■■■□□ 2.14
PMS1-220ENST00000618056 MXRA8Q9BRK3 442 aa28.44■■■□□ 2.14
PMS1-220ENST00000618056 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP28.44■■■□□ 2.14
PMS1-220ENST00000618056 VPS54Q9P1Q0 977 aa28.44■■■□□ 2.14
PMS1-220ENST00000618056 KAT6AQ92794 2004 aa28.44■■■□□ 2.14
PMS1-220ENST00000618056 HAS3O00219 553 aa28.43■■■□□ 2.14
PMS1-220ENST00000618056 ZNF286BP0CG31 522 aa28.43■■■□□ 2.14
PMS1-220ENST00000618056 KCNA2P16389 499 aa28.43■■■□□ 2.14
PMS1-220ENST00000618056 FAM47CQ5HY64 1035 aa28.43■■■□□ 2.14
PMS1-220ENST00000618056 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa28.43■■■□□ 2.14
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