RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611415.4

TNS1-220, Transcript of tensin 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TNS1, Length 6,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-220ENST00000611415 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP12.97□□□□□ -0.33
TNS1-220ENST00000611415 ADCY1Q08828 1119 aa12.97□□□□□ -0.33
TNS1-220ENST00000611415 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP12.97□□□□□ -0.33
TNS1-220ENST00000611415 RASGRP4Q8TDF6 673 aa12.97□□□□□ -0.33
TNS1-220ENST00000611415 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP12.97□□□□□ -0.33
TNS1-220ENST00000611415 ANTXR1Q9H6X2 564 aa12.97□□□□□ -0.33
TNS1-220ENST00000611415 NRBP2Q9NSY0 501 aa12.97□□□□□ -0.33
TNS1-220ENST00000611415 EPS15L1Q9UBC2 864 aa12.97□□□□□ -0.33
TNS1-220ENST00000611415 PDE8BO95263 885 aa12.97□□□□□ -0.33
TNS1-220ENST00000611415 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP12.97□□□□□ -0.33
TNS1-220ENST00000611415 FAM160B1Q5W0V3 765 aa12.97□□□□□ -0.33
TNS1-220ENST00000611415 KDM5CP41229 1560 aa12.97□□□□□ -0.33
TNS1-220ENST00000611415 GPC4O75487 556 aa12.97□□□□□ -0.33
TNS1-220ENST00000611415 SCNN1DP51172 638 aa12.97□□□□□ -0.33
TNS1-220ENST00000611415 SLMAPQ14BN4 828 aa12.97□□□□□ -0.33
TNS1-220ENST00000611415 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP12.97□□□□□ -0.33
TNS1-220ENST00000611415 NDUFA10O95299 355 aa12.97□□□□□ -0.33
TNS1-220ENST00000611415 CASP8Q14790 479 aa12.97□□□□□ -0.33
TNS1-220ENST00000611415 PAGE5Q96GU1 130 aa12.97□□□□□ -0.33
TNS1-220ENST00000611415 NCAPGQ9BPX3 1015 aa12.97□□□□□ -0.33
TNS1-220ENST00000611415 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP12.97□□□□□ -0.33
TNS1-220ENST00000611415 TCP10L2B9ZVM9 353 aa12.97□□□□□ -0.33
TNS1-220ENST00000611415 CPP00450 1065 aa12.97□□□□□ -0.33
TNS1-220ENST00000611415 KRT1P04264 644 aa12.97□□□□□ -0.33
TNS1-220ENST00000611415 S100BP04271 92 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
TNS1-220ENST00000611415 ADD2P35612 726 aa12.97□□□□□ -0.33
TNS1-220ENST00000611415 ZBED6P86452 979 aa12.97□□□□□ -0.33
TNS1-220ENST00000611415 PPP2R5AQ15172 486 aa12.97□□□□□ -0.33
TNS1-220ENST00000611415 FAM81BQ96LP2 452 aa12.97□□□□□ -0.33
TNS1-220ENST00000611415 ABCB6Q9NP58 842 aa12.97□□□□□ -0.33
TNS1-220ENST00000611415 PNMA2Q9UL42 364 aa12.97□□□□□ -0.33
TNS1-220ENST00000611415 GFPT2O94808 682 aa12.96□□□□□ -0.33
TNS1-220ENST00000611415 TMOD1P28289 359 aa12.96□□□□□ -0.33
TNS1-220ENST00000611415 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.33
TNS1-220ENST00000611415 CCHCR1Q8TD31 782 aa12.96□□□□□ -0.33
TNS1-220ENST00000611415 KLHL29Q96CT2 875 aa12.96□□□□□ -0.33
TNS1-220ENST00000611415 SMYD2Q9NRG4 433 aa12.96□□□□□ -0.33
TNS1-220ENST00000611415 CCPG1Q9ULG6 757 aa12.96□□□□□ -0.33
TNS1-220ENST00000611415 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa12.96□□□□□ -0.33
TNS1-220ENST00000611415 HSPA6P17066 643 aa12.96□□□□□ -0.33
TNS1-220ENST00000611415 ZNF577Q9BSK1 485 aa12.96□□□□□ -0.33
TNS1-220ENST00000611415 COX16Q9P0S2 106 aa12.96□□□□□ -0.33
TNS1-220ENST00000611415 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.33
TNS1-220ENST00000611415 GOLGA8CPA6NN73 597 aa12.96□□□□□ -0.33
TNS1-220ENST00000611415 PPFIA2O75334 1257 aa12.96□□□□□ -0.33
TNS1-220ENST00000611415 SRGAP2BP0DMP2 458 aa12.96□□□□□ -0.33
TNS1-220ENST00000611415 NR1D1P20393 614 aa12.96□□□□□ -0.33
TNS1-220ENST00000611415 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.33
TNS1-220ENST00000611415 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa12.96□□□□□ -0.33
TNS1-220ENST00000611415 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa12.96□□□□□ -0.33
TNS1-220ENST00000611415 SUGCTQ9HAC7 445 aa12.96□□□□□ -0.33
TNS1-220ENST00000611415 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.33
TNS1-220ENST00000611415 GCNT4Q9P109 453 aa12.96□□□□□ -0.33
TNS1-220ENST00000611415 LMTK3Q96Q04 1460 aa12.96□□□□□ -0.33
TNS1-220ENST00000611415 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.33
TNS1-220ENST00000611415 SPDYE2Q495Y8 402 aa12.96□□□□□ -0.33
TNS1-220ENST00000611415 TCP11X2Q5H9J9 407 aa12.96□□□□□ -0.33
TNS1-220ENST00000611415 BANK1Q8NDB2 785 aa12.96□□□□□ -0.33
TNS1-220ENST00000611415 GDAP1Q8TB36 358 aa12.96□□□□□ -0.33
TNS1-220ENST00000611415 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.33
TNS1-220ENST00000611415 ARAP3Q8WWN8 1544 aa12.96□□□□□ -0.34
TNS1-220ENST00000611415 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.34
TNS1-220ENST00000611415 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.34
TNS1-220ENST00000611415 STX1BP61266 288 aa12.96□□□□□ -0.34
TNS1-220ENST00000611415 SLC7A5Q01650 507 aa12.96□□□□□ -0.34
TNS1-220ENST00000611415 ABCB5Q2M3G0 1257 aa12.96□□□□□ -0.34
TNS1-220ENST00000611415 SESTD1Q86VW0 696 aa12.96□□□□□ -0.34
TNS1-220ENST00000611415 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.34
TNS1-220ENST00000611415 FBXO41Q8TF61 875 aa12.96□□□□□ -0.34
TNS1-220ENST00000611415 SEMA3EO15041 775 aa12.96□□□□□ -0.34
TNS1-220ENST00000611415 CLIC2O15247 247 aa12.96□□□□□ -0.34
TNS1-220ENST00000611415 TLR3O15455 904 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.34
TNS1-220ENST00000611415 MAP3K7O43318 606 aa12.96□□□□□ -0.34
TNS1-220ENST00000611415 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.34
TNS1-220ENST00000611415 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.34
TNS1-220ENST00000611415 PSMD2Q13200 908 aa12.96□□□□□ -0.34
TNS1-220ENST00000611415 CYP4F22Q6NT55 531 aa12.96□□□□□ -0.34
TNS1-220ENST00000611415 PAGR1Q9BTK6 254 aa12.96□□□□□ -0.34
TNS1-220ENST00000611415 AMNQ9BXJ7 453 aa12.96□□□□□ -0.34
TNS1-220ENST00000611415 WDR70Q9NW82 654 aa12.96□□□□□ -0.34
TNS1-220ENST00000611415 MX2P20592 715 aa12.95□□□□□ -0.34
TNS1-220ENST00000611415 TAF11Q15544 211 aa12.95□□□□□ -0.34
TNS1-220ENST00000611415 TBCKQ8TEA7 893 aa12.95□□□□□ -0.34
TNS1-220ENST00000611415 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
TNS1-220ENST00000611415 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
TNS1-220ENST00000611415 hCG_1984214I3L0E3 225 aa12.95□□□□□ -0.34
TNS1-220ENST00000611415 MCF2LO15068 1137 aa12.95□□□□□ -0.34
TNS1-220ENST00000611415 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
TNS1-220ENST00000611415 TNFAIP1Q13829 316 aa12.95□□□□□ -0.34
TNS1-220ENST00000611415 TFDP1Q14186 410 aa12.95□□□□□ -0.34
TNS1-220ENST00000611415 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
TNS1-220ENST00000611415 ZNF804BA4D1E1 1349 aa12.95□□□□□ -0.34
TNS1-220ENST00000611415 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
TNS1-220ENST00000611415 LARGE1O95461 756 aa12.95□□□□□ -0.34
TNS1-220ENST00000611415 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
TNS1-220ENST00000611415 CASP2P42575 452 aa12.95□□□□□ -0.34
TNS1-220ENST00000611415 DR1Q01658 176 aa12.95□□□□□ -0.34
TNS1-220ENST00000611415 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
TNS1-220ENST00000611415 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
TNS1-220ENST00000611415 MB21D1Q8N884 522 aa12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms