RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000573600.5

CTDNEP1-208, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,724 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-208ENST00000573600 RNF207Q6ZRF8 634 aa32.6■■■□□ 2.81
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CTDNEP1-208ENST00000573600 KCTD17Q8N5Z5 321 aa32.6■■■□□ 2.81
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CTDNEP1-208ENST00000573600 MXRA8Q9BRK3 442 aa32.6■■■□□ 2.81
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CTDNEP1-208ENST00000573600 OTOP1Q7RTM1 612 aa32.56■■■□□ 2.8
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CTDNEP1-208ENST00000573600 MB21D1Q8N884 522 aa32.52■■■□□ 2.8
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CTDNEP1-208ENST00000573600 DNM3Q9UQ16 869 aa32.52■■■□□ 2.8
CTDNEP1-208ENST00000573600 ITGB5P18084 799 aa32.51■■■□□ 2.8
CTDNEP1-208ENST00000573600 MUTP22033 750 aa32.51■■■□□ 2.8
CTDNEP1-208ENST00000573600 PSMD2Q13200 908 aa32.51■■■□□ 2.8
CTDNEP1-208ENST00000573600 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP32.51■■■□□ 2.8
CTDNEP1-208ENST00000573600 DYMQ7RTS9 669 aa32.51■■■□□ 2.8
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