RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560725.1

TMOD3-208, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 4

Gene TMOD3, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-208ENST00000560725 HECW1Q76N89 1606 aa7.89□□□□□ -1.15
TMOD3-208ENST00000560725 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa7.89□□□□□ -1.15
TMOD3-208ENST00000560725 M0R2C6 588 aa7.89□□□□□ -1.15
TMOD3-208ENST00000560725 NPHS1O60500 1241 aa7.89□□□□□ -1.15
TMOD3-208ENST00000560725 F2P00734 622 aa7.89□□□□□ -1.15
TMOD3-208ENST00000560725 ESR1P03372 595 aa7.89□□□□□ -1.15
TMOD3-208ENST00000560725 CKMP06732 381 aa7.89□□□□□ -1.15
TMOD3-208ENST00000560725 RPL10P27635 214 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
TMOD3-208ENST00000560725 OCRLQ01968 901 aa7.89□□□□□ -1.15
TMOD3-208ENST00000560725 DSG1Q02413 1049 aa7.89□□□□□ -1.15
TMOD3-208ENST00000560725 LSAMPQ13449 338 aa7.89□□□□□ -1.15
TMOD3-208ENST00000560725 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa7.89□□□□□ -1.15
TMOD3-208ENST00000560725 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa7.89□□□□□ -1.15
TMOD3-208ENST00000560725 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa7.89□□□□□ -1.15
TMOD3-208ENST00000560725 AFAP1Q8N556 730 aa7.89□□□□□ -1.15
TMOD3-208ENST00000560725 CHST14Q8NCH0 376 aa7.89□□□□□ -1.15
TMOD3-208ENST00000560725 FBXW5Q969U6 566 aa7.89□□□□□ -1.15
TMOD3-208ENST00000560725 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
TMOD3-208ENST00000560725 MISP3Q96FF7 219 aa7.89□□□□□ -1.15
TMOD3-208ENST00000560725 CHPF2Q9P2E5 772 aa7.89□□□□□ -1.15
TMOD3-208ENST00000560725 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
TMOD3-208ENST00000560725 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa7.89□□□□□ -1.15
TMOD3-208ENST00000560725 ZNF281Q9Y2X9 895 aa7.89□□□□□ -1.15
TMOD3-208ENST00000560725 COQ6Q9Y2Z9 468 aa7.89□□□□□ -1.15
TMOD3-208ENST00000560725 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
TMOD3-208ENST00000560725 TTC37Q6PGP7 1564 aa7.88□□□□□ -1.15
TMOD3-208ENST00000560725 CCDC66A2RUB6 948 aa7.88□□□□□ -1.15
TMOD3-208ENST00000560725 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa7.88□□□□□ -1.15
TMOD3-208ENST00000560725 ST5P78524 1137 aa7.88□□□□□ -1.15
TMOD3-208ENST00000560725 PRKCQQ04759 706 aa7.88□□□□□ -1.15
TMOD3-208ENST00000560725 CPNE8Q86YQ8 564 aa7.88□□□□□ -1.15
TMOD3-208ENST00000560725 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
TMOD3-208ENST00000560725 IPPKQ9H8X2 491 aa7.88□□□□□ -1.15
TMOD3-208ENST00000560725 B4GALT6Q9UBX8 382 aa7.88□□□□□ -1.15
TMOD3-208ENST00000560725 MADDQ8WXG6 1647 aa7.88□□□□□ -1.15
TMOD3-208ENST00000560725 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa7.87□□□□□ -1.15
TMOD3-208ENST00000560725 LMTK3Q96Q04 1460 aa7.87□□□□□ -1.15
TMOD3-208ENST00000560725 C9orf84Q5VXU9 1444 aa7.87□□□□□ -1.15
TMOD3-208ENST00000560725 C7orf72A4D263 438 aa7.87□□□□□ -1.15
TMOD3-208ENST00000560725 H7BY64 318 aa7.87□□□□□ -1.15
TMOD3-208ENST00000560725 NEMP1O14524 444 aa7.87□□□□□ -1.15
TMOD3-208ENST00000560725 ALDH1L1O75891 902 aa7.87□□□□□ -1.15
TMOD3-208ENST00000560725 MECP2P51608 486 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
TMOD3-208ENST00000560725 EPHB1P54762 984 aa7.87□□□□□ -1.15
TMOD3-208ENST00000560725 IL2P60568 153 aa7.87□□□□□ -1.15
TMOD3-208ENST00000560725 TMPRSS15P98073 1019 aa7.87□□□□□ -1.15
TMOD3-208ENST00000560725 C16orf59Q7L2K0 433 aa7.87□□□□□ -1.15
TMOD3-208ENST00000560725 SMC1BQ8NDV3 1235 aa7.87□□□□□ -1.15
TMOD3-208ENST00000560725 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa7.87□□□□□ -1.15
TMOD3-208ENST00000560725 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa7.87□□□□□ -1.15
TMOD3-208ENST00000560725 ADGRE2Q9UHX3 823 aa7.87□□□□□ -1.15
TMOD3-208ENST00000560725 VAV3Q9UKW4 847 aa7.87□□□□□ -1.15
TMOD3-208ENST00000560725 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
TMOD3-208ENST00000560725 LSSP48449 732 aa7.86□□□□□ -1.15
TMOD3-208ENST00000560725 HSPA2P54652 639 aa7.86□□□□□ -1.15
TMOD3-208ENST00000560725 DUSP4Q13115 394 aa7.86□□□□□ -1.15
TMOD3-208ENST00000560725 ARHGAP44Q17R89 818 aa7.86□□□□□ -1.15
TMOD3-208ENST00000560725 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa7.86□□□□□ -1.15
TMOD3-208ENST00000560725 Q8N1Y9 231 aa7.86□□□□□ -1.15
TMOD3-208ENST00000560725 MAP6Q96JE9 813 aa7.86□□□□□ -1.15
TMOD3-208ENST00000560725 CHAMP1Q96JM3 812 aa7.86□□□□□ -1.15
TMOD3-208ENST00000560725 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa7.86□□□□□ -1.15
TMOD3-208ENST00000560725 CLDND1Q9NY35 253 aa7.86□□□□□ -1.15
TMOD3-208ENST00000560725 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa7.86□□□□□ -1.15
TMOD3-208ENST00000560725 ARHGAP5Q13017 1502 aa7.85□□□□□ -1.15
TMOD3-208ENST00000560725 PRR19A6NJB7 356 aa7.85□□□□□ -1.15
TMOD3-208ENST00000560725 TRAF5O00463 557 aa7.85□□□□□ -1.15
TMOD3-208ENST00000560725 KATNA1O75449 491 aa7.85□□□□□ -1.15
TMOD3-208ENST00000560725 ITGB2P05107 769 aa7.85□□□□□ -1.15
TMOD3-208ENST00000560725 PYGMP11217 842 aa7.85□□□□□ -1.15
TMOD3-208ENST00000560725 BCL6P41182 706 aa7.85□□□□□ -1.15
TMOD3-208ENST00000560725 ADCYAP1R1P41586 468 aa7.85□□□□□ -1.15
TMOD3-208ENST00000560725 DNM2P50570 870 aa7.85□□□□□ -1.15
TMOD3-208ENST00000560725 CORO7P57737 925 aa7.85□□□□□ -1.15
TMOD3-208ENST00000560725 MTMR1Q13613 665 aa7.85□□□□□ -1.15
TMOD3-208ENST00000560725 DOC2BQ14184 412 aa7.85□□□□□ -1.15
TMOD3-208ENST00000560725 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
TMOD3-208ENST00000560725 CRY1Q16526 586 aa7.85□□□□□ -1.15
TMOD3-208ENST00000560725 AOC3Q16853 763 aa7.85□□□□□ -1.15
TMOD3-208ENST00000560725 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
TMOD3-208ENST00000560725 NKAPLQ5M9Q1 402 aa7.85□□□□□ -1.15
TMOD3-208ENST00000560725 ZPBP2Q6X784 338 aa7.85□□□□□ -1.15
TMOD3-208ENST00000560725 OVCH1Q7RTY7 1134 aa7.85□□□□□ -1.15
TMOD3-208ENST00000560725 C11orf74Q86VG3 221 aa7.85□□□□□ -1.15
TMOD3-208ENST00000560725 STK11IPQ8N1F8 1099 aa7.85□□□□□ -1.15
TMOD3-208ENST00000560725 MTMR8Q96EF0 704 aa7.85□□□□□ -1.15
TMOD3-208ENST00000560725 FBXL7Q9UJT9 491 aa7.85□□□□□ -1.15
TMOD3-208ENST00000560725 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
TMOD3-208ENST00000560725 EID1Q9Y6B2 187 aa7.85□□□□□ -1.15
TMOD3-208ENST00000560725 CCDC18Q5T9S5 1454 aa7.85□□□□□ -1.15
TMOD3-208ENST00000560725 KIF14Q15058 1648 aa7.85□□□□□ -1.15
TMOD3-208ENST00000560725 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
TMOD3-208ENST00000560725 MLH3Q9UHC1 1453 aa7.84□□□□□ -1.15
TMOD3-208ENST00000560725 FKBP9O95302 570 aa7.84□□□□□ -1.15
TMOD3-208ENST00000560725 GDF11O95390 407 aa7.84□□□□□ -1.15
TMOD3-208ENST00000560725 GSK3AP49840 483 aa7.84□□□□□ -1.15
TMOD3-208ENST00000560725 ITKQ08881 620 aa7.84□□□□□ -1.15
TMOD3-208ENST00000560725 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
TMOD3-208ENST00000560725 FKBP9P1Q75LS8 142 aa7.84□□□□□ -1.15
TMOD3-208ENST00000560725 NLRP10Q86W26 655 aa7.84□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.9 ms