RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559557.1

MRPS11-208, Transcript of mitochondrial ribosomal protein S11, human

TSL 3

Gene MRPS11, Length 447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPS11-208	ENST00000559557	BTG4	Q9NY30	223 aa		7.03	□□□□□ -1.28
MRPS11-208	ENST00000559557	MARCH2	Q9P0N8	246 aa		7.03	□□□□□ -1.28
MRPS11-208	ENST00000559557	APEX2	Q9UBZ4	518 aa		7.03	□□□□□ -1.28
MRPS11-208	ENST00000559557	PLA2G2D	Q9UNK4	145 aa		7.03	□□□□□ -1.28
MRPS11-208	ENST00000559557	KDM5C	P41229	1560 aa		7.03	□□□□□ -1.28
MRPS11-208	ENST00000559557	AKNA	Q7Z591	1439 aa		7.02	□□□□□ -1.29
MRPS11-208	ENST00000559557	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		7.02	□□□□□ -1.29
MRPS11-208	ENST00000559557	MYO1B	O43795	1136 aa		7.02	□□□□□ -1.29
MRPS11-208	ENST00000559557	SARS	P49591	514 aa	Known RBP	7.02	□□□□□ -1.29
MRPS11-208	ENST00000559557	SPATS1	Q496A3	300 aa		7.02	□□□□□ -1.29
MRPS11-208	ENST00000559557	TNNI3K	Q59H18	835 aa		7.02	□□□□□ -1.29
MRPS11-208	ENST00000559557	ZFYVE27	Q5T4F4	411 aa		7.02	□□□□□ -1.29
MRPS11-208	ENST00000559557	ETV3L	Q6ZN32	361 aa		7.02	□□□□□ -1.29
MRPS11-208	ENST00000559557	HOMEZ	Q8IX15	550 aa		7.02	□□□□□ -1.29
MRPS11-208	ENST00000559557	ADGRG2	Q8IZP9	1017 aa		7.02	□□□□□ -1.29
MRPS11-208	ENST00000559557	ZBTB8A	Q96BR9	441 aa		7.02	□□□□□ -1.29
MRPS11-208	ENST00000559557	ACBD3	Q9H3P7	528 aa		7.02	□□□□□ -1.29
MRPS11-208	ENST00000559557	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		7.02	□□□□□ -1.29
MRPS11-208	ENST00000559557	CNOT11	Q9UKZ1	510 aa	Known RBP	7.02	□□□□□ -1.29
MRPS11-208	ENST00000559557	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		7.02	□□□□□ -1.29
MRPS11-208	ENST00000559557	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		7.01	□□□□□ -1.29
MRPS11-208	ENST00000559557	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		7.01	□□□□□ -1.29
MRPS11-208	ENST00000559557	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	7.01	□□□□□ -1.29
MRPS11-208	ENST00000559557	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		7.01	□□□□□ -1.29
MRPS11-208	ENST00000559557		A0A1B0GTL3	188 aa		7.01	□□□□□ -1.29
MRPS11-208	ENST00000559557	SSB	P05455	408 aa	Known RBP eCLIP	7.01	□□□□□ -1.29
MRPS11-208	ENST00000559557	ADRB1	P08588	477 aa		7.01	□□□□□ -1.29
MRPS11-208	ENST00000559557	GTF2A2	P52657	109 aa		7.01	□□□□□ -1.29
MRPS11-208	ENST00000559557	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
MRPS11-208	ENST00000559557	RTP5	Q14D33	572 aa		7.01	□□□□□ -1.29
MRPS11-208	ENST00000559557	GTF2IRD2B	Q6EKJ0	949 aa		7.01	□□□□□ -1.29
MRPS11-208	ENST00000559557	GTF2IRD2	Q86UP8	949 aa		7.01	□□□□□ -1.29
MRPS11-208	ENST00000559557	TRIM59	Q8IWR1	403 aa		7.01	□□□□□ -1.29
MRPS11-208	ENST00000559557	FAM169B	Q8N8A8	192 aa		7.01	□□□□□ -1.29
MRPS11-208	ENST00000559557	SEC14L1	Q92503	715 aa		7.01	□□□□□ -1.29
MRPS11-208	ENST00000559557	YIPF4	Q9BSR8	244 aa		7.01	□□□□□ -1.29
MRPS11-208	ENST00000559557	GPRC5C	Q9NQ84	441 aa		7.01	□□□□□ -1.29
MRPS11-208	ENST00000559557	FBLN5	Q9UBX5	448 aa		7.01	□□□□□ -1.29
MRPS11-208	ENST00000559557	PALD1	Q9ULE6	856 aa		7.01	□□□□□ -1.29
MRPS11-208	ENST00000559557	ABCC1	P33527	1531 aa		7.01	□□□□□ -1.29
MRPS11-208	ENST00000559557	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		7.01	□□□□□ -1.29
MRPS11-208	ENST00000559557	C3	P01024	1663 aa		7	□□□□□ -1.29
MRPS11-208	ENST00000559557	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		7	□□□□□ -1.29
MRPS11-208	ENST00000559557	C22orf46	C9J442	243 aa		7	□□□□□ -1.29
MRPS11-208	ENST00000559557		K7ESM1	405 aa		7	□□□□□ -1.29
MRPS11-208	ENST00000559557	THBD	P07204	575 aa		7	□□□□□ -1.29
MRPS11-208	ENST00000559557	RPL11	P62913	178 aa	Known RBP	7	□□□□□ -1.29
MRPS11-208	ENST00000559557	MROH9	Q5TGP6	573 aa		7	□□□□□ -1.29
MRPS11-208	ENST00000559557	E4F1	Q66K89	784 aa	Predicted RBP	7	□□□□□ -1.29
MRPS11-208	ENST00000559557	FAM124A	Q86V42	546 aa		7	□□□□□ -1.29
MRPS11-208	ENST00000559557	NKX2-4	Q9H2Z4	354 aa		7	□□□□□ -1.29
MRPS11-208	ENST00000559557	NGRN	Q9NPE2	291 aa	Known RBP	7	□□□□□ -1.29
MRPS11-208	ENST00000559557	ACTR10	Q9NZ32	417 aa		7	□□□□□ -1.29
MRPS11-208	ENST00000559557	FMN1	Q68DA7	1419 aa		7	□□□□□ -1.29
MRPS11-208	ENST00000559557	STRC	Q7RTU9	1775 aa		7	□□□□□ -1.29
MRPS11-208	ENST00000559557	PPP1R11	O60927	126 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
MRPS11-208	ENST00000559557	SV2C	Q496J9	727 aa		6.99	□□□□□ -1.29
MRPS11-208	ENST00000559557	ZNF513	Q8N8E2	541 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
MRPS11-208	ENST00000559557	CCDC140	Q96MF4	163 aa		6.99	□□□□□ -1.29
MRPS11-208	ENST00000559557	COA3	Q9Y2R0	106 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
MRPS11-208	ENST00000559557	TIMM13	Q9Y5L4	95 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
MRPS11-208	ENST00000559557	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		6.99	□□□□□ -1.29
MRPS11-208	ENST00000559557	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		6.99	□□□□□ -1.29
MRPS11-208	ENST00000559557	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		6.98	□□□□□ -1.29
MRPS11-208	ENST00000559557	ATF4	P18848	351 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
MRPS11-208	ENST00000559557	HOXC12	P31275	282 aa		6.98	□□□□□ -1.29
MRPS11-208	ENST00000559557	SLC6A11	P48066	632 aa		6.98	□□□□□ -1.29
MRPS11-208	ENST00000559557	KCNAB2	Q13303	367 aa		6.98	□□□□□ -1.29
MRPS11-208	ENST00000559557	CHRNA2	Q15822	529 aa		6.98	□□□□□ -1.29
MRPS11-208	ENST00000559557	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
MRPS11-208	ENST00000559557	CD300LD	Q6UXZ3	194 aa		6.98	□□□□□ -1.29
MRPS11-208	ENST00000559557	TEX2	Q8IWB9	1127 aa		6.98	□□□□□ -1.29
MRPS11-208	ENST00000559557	PLEKHO2	Q8TD55	490 aa		6.98	□□□□□ -1.29
MRPS11-208	ENST00000559557	DIO2	Q92813	273 aa		6.98	□□□□□ -1.29
MRPS11-208	ENST00000559557	TRMT2B	Q96GJ1	504 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
MRPS11-208	ENST00000559557	SIT1	Q9Y3P8	196 aa		6.98	□□□□□ -1.29
MRPS11-208	ENST00000559557	PLCH2	O75038	1416 aa		6.98	□□□□□ -1.29
MRPS11-208	ENST00000559557	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
MRPS11-208	ENST00000559557	PRICKLE3	O43900	615 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
MRPS11-208	ENST00000559557	CP	P00450	1065 aa		6.97	□□□□□ -1.29
MRPS11-208	ENST00000559557	SNRPB2	P08579	225 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
MRPS11-208	ENST00000559557	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		6.97	□□□□□ -1.29
MRPS11-208	ENST00000559557	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
MRPS11-208	ENST00000559557	SMAD4	Q13485	552 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
MRPS11-208	ENST00000559557	ZNF827	Q17R98	1081 aa		6.97	□□□□□ -1.29
MRPS11-208	ENST00000559557	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		6.97	□□□□□ -1.29
MRPS11-208	ENST00000559557	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
MRPS11-208	ENST00000559557	MILR1	Q7Z6M3	343 aa		6.97	□□□□□ -1.29
MRPS11-208	ENST00000559557	FERMT3	Q86UX7	667 aa		6.97	□□□□□ -1.29
MRPS11-208	ENST00000559557	TTLL6	Q8N841	843 aa		6.97	□□□□□ -1.29
MRPS11-208	ENST00000559557	DDX1	Q92499	740 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
MRPS11-208	ENST00000559557	MRGPRX3	Q96LB0	322 aa		6.97	□□□□□ -1.29
MRPS11-208	ENST00000559557	NOX5	Q96PH1	765 aa		6.97	□□□□□ -1.29
MRPS11-208	ENST00000559557	KRTAP9-3	Q9BYQ3	159 aa		6.97	□□□□□ -1.29
MRPS11-208	ENST00000559557	KIAA1522	Q9P206	1035 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
MRPS11-208	ENST00000559557	RERE	Q9P2R6	1566 aa		6.97	□□□□□ -1.29
MRPS11-208	ENST00000559557	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		6.97	□□□□□ -1.29
MRPS11-208	ENST00000559557	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		6.96	□□□□□ -1.29
MRPS11-208	ENST00000559557	AGRP	O00253	132 aa		6.96	□□□□□ -1.3
MRPS11-208	ENST00000559557	SMAD7	O15105	426 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3

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