RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557261.1

FOXN3-215, Transcript of forkhead box N3, humanhuman

TSL 4

Gene FOXN3, Length 625 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3-215ENST00000557261 GRIK5Q16478 980 aa7.33□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa7.33□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 NSMFQ6X4W1 530 aa7.33□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa7.33□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 DEFB132Q7Z7B7 95 aa7.33□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 FAM13CQ8NE31 585 aa7.33□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 CORO1BQ9BR76 489 aa7.33□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 KLHL25Q9H0H3 589 aa7.33□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 FBRSQ9HAH7 460 aa7.33□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 TRHDEQ9UKU6 1024 aa7.33□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 TNNQ9UQP3 1299 aa7.33□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 HIF3AQ9Y2N7 669 aa7.33□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 TAF1LQ8IZX4 1826 aa7.33□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 ADCY9O60503 1353 aa7.33□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 SCN7AQ01118 1682 aa7.32□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 LRP5O75197 1615 aa7.32□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 ANKRD34BA5PLL1 514 aa7.32□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 AGRPO00253 132 aa7.32□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 KCNQ3O43525 872 aa7.32□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 SIN3BO75182 1162 aa7.32□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 ARHGEF15O94989 841 aa7.32□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 GNAI3P08754 354 aa7.32□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 TMPRSS15P98073 1019 aa7.32□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 RELTQ969Z4 430 aa7.32□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa7.32□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 HDAC5Q9UQL6 1122 aa7.32□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa7.32□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 LAMB2P55268 1798 aa7.32□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 UTYO14607 1347 aa7.31□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 TNKSO95271 1327 aa7.31□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 NEMP1O14524 444 aa7.31□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 GABRDO14764 452 aa7.31□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 CAND2O75155 1236 aa7.31□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 LDHAP00338 332 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 ETF1P62495 437 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 RASSF7Q02833 373 aa7.31□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 C19orf57Q0VDD7 668 aa7.31□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 PCSK7Q16549 785 aa7.31□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 NKG7Q16617 165 aa7.31□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 PPP4R4Q6NUP7 873 aa7.31□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 KSR2Q6VAB6 950 aa7.31□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 G2E3Q7L622 706 aa7.31□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 PODNQ7Z5L7 613 aa7.31□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 PHACTR4Q8IZ21 702 aa7.31□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 DNAAF4Q8WXU2 420 aa7.31□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 BRF1Q92994 677 aa7.31□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 GCC1Q96CN9 775 aa7.31□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 KLHDC7BQ96G42 594 aa7.31□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 MDFIQ99750 246 aa7.31□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 CDH19Q9H159 772 aa7.31□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 KRT82Q9NSB4 513 aa7.31□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa7.31□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 BRWD3Q6RI45 1802 aa7.31□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa7.31□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 MYH3P11055 1940 aa7.31□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 NUP98P52948 1817 aa7.3□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 TM4SF5O14894 197 aa7.3□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 DLX3O60479 287 aa7.3□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 KRT18P05783 430 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 FGFR1P11362 822 aa7.3□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 PAX3P23760 479 aa7.3□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 RING1Q06587 406 aa7.3□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 PDE4BQ07343 736 aa7.3□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 SLC39A6Q13433 755 aa7.3□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 NTRK3Q16288 839 aa7.3□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa7.3□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 TRIM61Q5EBN2 209 aa7.3□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 LYPD4Q6UWN0 246 aa7.3□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 FCHSD1Q86WN1 690 aa7.3□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 TMEM151AQ8N4L1 468 aa7.3□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 CNTD1Q8N815 330 aa7.3□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 ANKRD44Q8N8A2 993 aa7.3□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 ADCY4Q8NFM4 1077 aa7.3□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 BTN2A2Q8WVV5 523 aa7.3□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 PIGBQ92521 554 aa7.3□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 TNFRSF25Q93038 417 aa7.3□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 TMEM87BQ96K49 555 aa7.3□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 WNT10AQ9GZT5 417 aa7.3□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 ADAM30Q9UKF2 790 aa7.3□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 STARD13Q9Y3M8 1113 aa7.3□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.4 ms