RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552688.5

CS-233, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-233	ENST00000552688	TMCO2	Q7Z6W1	182 aa	Predicted RBP	7.98	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	DHX37	Q8IY37	1157 aa	Known RBP	7.98	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	FBXO22	Q8NEZ5	403 aa		7.98	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	GADD45GIP1	Q8TAE8	222 aa	Predicted RBP	7.98	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	NEK9	Q8TD19	979 aa		7.98	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		7.98	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	DHX38	Q92620	1227 aa	Known RBP	7.98	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	ANKS1A	Q92625	1134 aa		7.98	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	ALG1	Q9BT22	464 aa		7.98	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	7.98	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		7.98	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	CD320	Q9NPF0	282 aa		7.98	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	PRKAG3	Q9UGI9	489 aa		7.98	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	MTUS1	Q9ULD2	1270 aa		7.98	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	GTF3C3	Q9Y5Q9	886 aa		7.98	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	SCN10A	Q9Y5Y9	1956 aa		7.98	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	DNAH12	Q6ZR08	3092 aa		7.98	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	PRRC2B	Q5JSZ5	2229 aa	Known RBP	7.98	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	VCAN	P13611	3396 aa		7.97	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	CDH23	Q9H251	3354 aa		7.97	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	NCOR1	O75376	2440 aa		7.97	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688		H3BNC9	293 aa		7.97	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	GOLGA8H	P0CJ92	632 aa		7.97	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	THPO	P40225	353 aa		7.97	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	MKRN4P	Q13434	485 aa	Predicted RBP	7.97	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	7.97	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	CELF3	Q5SZQ8	465 aa	Known RBP	7.97	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	MYSM1	Q5VVJ2	828 aa		7.97	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	TRAF7	Q6Q0C0	670 aa		7.97	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	SPRED2	Q7Z698	418 aa		7.97	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	ZNF589	Q86UQ0	364 aa	Predicted RBP	7.97	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	FBXO11	Q86XK2	927 aa		7.97	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	ADGRF4	Q8IZF3	695 aa		7.97	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	PNMA1	Q8ND90	353 aa		7.97	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	DBF4B	Q8NFT6	615 aa		7.97	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	SP7	Q8TDD2	431 aa	Predicted RBP	7.97	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	SEPT8	Q92599	483 aa		7.97	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	KHSRP	Q92945	711 aa	Known RBP eCLIP	7.97	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	SPATA33	Q96N06	139 aa		7.97	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		7.97	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	IL25	Q9H293	177 aa		7.97	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	KAT14	Q9H8E8	782 aa		7.97	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		7.97	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	COL20A1	Q9P218	1284 aa		7.97	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	POTEB3	A0JP26	581 aa		7.96	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	C17orf102	A2RUQ5	167 aa		7.96	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	FAM86C2P	A6NEL3	165 aa		7.96	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	ZNF213	O14771	459 aa		7.96	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	DCX	O43602	365 aa		7.96	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	DHX16	O60231	1041 aa	Known RBP	7.96	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	PARP1	P09874	1014 aa	Known RBP	7.96	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	GNAT1	P11488	350 aa		7.96	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	HSD17B4	P51659	736 aa		7.96	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	HAND2	P61296	217 aa		7.96	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	GHRHR	Q02643	423 aa		7.96	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	COL19A1	Q14993	1142 aa		7.96	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	QRICH1	Q2TAL8	776 aa		7.96	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	EPC2	Q52LR7	807 aa		7.96	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	PLEKHG4	Q58EX7	1191 aa		7.96	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	FAM117B	Q6P1L5	589 aa		7.96	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	POTEB	Q6S5H4	581 aa		7.96	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	7.96	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	STOX1	Q6ZVD7	989 aa		7.96	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	ALYREF	Q86V81	257 aa	Known RBP	7.96	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	SERINC5	Q86VE9	423 aa		7.96	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	MYOCD	Q8IZQ8	938 aa		7.96	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	BANK1	Q8NDB2	785 aa		7.96	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	TBC1D5	Q92609	795 aa		7.96	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	APBB2	Q92870	758 aa		7.96	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	ATP6V0A1	Q93050	837 aa		7.96	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	TOP1MT	Q969P6	601 aa		7.96	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	PABPC5	Q96DU9	382 aa	Known RBP	7.96	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	ZSCAN10	Q96SZ4	725 aa	Predicted RBP	7.96	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	YME1L1	Q96TA2	773 aa		7.96	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	C17orf80	Q9BSJ5	609 aa		7.96	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	AMN	Q9BXJ7	453 aa		7.96	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	USP26	Q9BXU7	913 aa		7.96	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	PXMP2	Q9NR77	195 aa		7.96	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	RWDD3	Q9Y3V2	267 aa		7.96	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	TCF20	Q9UGU0	1960 aa	Known RBP	7.96	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	CCDC171	Q6TFL3	1326 aa		7.96	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	GBF1	Q92538	1859 aa		7.96	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	SPTBN5	Q9NRC6	3674 aa	Known RBP	7.96	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688		H3BRB1	525 aa		7.95	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	STAM2	O75886	525 aa		7.95	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	CFB	P00751	764 aa		7.95	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	RB1	P06400	928 aa		7.95	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	ZNF286B	P0CG31	522 aa		7.95	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	IL9	P15248	144 aa		7.95	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	EIF2AK2	P19525	551 aa	Known RBP	7.95	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	7.95	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	GPM6B	Q13491	265 aa		7.95	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	MBTPS1	Q14703	1052 aa		7.95	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	TCTN1	Q2MV58	587 aa		7.95	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		7.95	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	VSIG10L	Q86VR7	867 aa		7.95	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	TMEM192	Q8IY95	271 aa		7.95	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	UIMC1	Q96RL1	719 aa		7.95	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	POP1	Q99575	1024 aa	Known RBP	7.95	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		7.95	□□□□□ -1.14

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