RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 MROH2AA6NES4 1674 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRB-210ENST00000551525 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
PTPRB-210ENST00000551525 POTEIP0CG38 1075 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRB-210ENST00000551525 GUCY2FP51841 1108 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRB-210ENST00000551525 CORO7P57737 925 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRB-210ENST00000551525 ASPRV1Q53RT3 343 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRB-210ENST00000551525 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRB-210ENST00000551525 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
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PTPRB-210ENST00000551525 ECE2O60344 883 aa6.86□□□□□ -1.31
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PTPRB-210ENST00000551525 TCP10Q12799 353 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRB-210ENST00000551525 UBE3CQ15386 1083 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRB-210ENST00000551525 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
PTPRB-210ENST00000551525 AGBL3Q8NEM8 1001 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRB-210ENST00000551525 DCTPP1Q9H773 170 aa6.86□□□□□ -1.31
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PTPRB-210ENST00000551525 RHBDL2Q9NX52 303 aa6.86□□□□□ -1.31
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PTPRB-210ENST00000551525 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa6.86□□□□□ -1.31
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PTPRB-210ENST00000551525 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRB-210ENST00000551525 GOLGA8OA6NCC3 632 aa6.86□□□□□ -1.31
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PTPRB-210ENST00000551525 ZBBXA8MT70 800 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRB-210ENST00000551525 GOLGA8NF8WBI6 632 aa6.86□□□□□ -1.31
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PTPRB-210ENST00000551525 PDE1AP54750 535 aa6.86□□□□□ -1.31
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PTPRB-210ENST00000551525 KMT5BQ4FZB7 885 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRB-210ENST00000551525 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRB-210ENST00000551525 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
PTPRB-210ENST00000551525 NME8Q8N427 588 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRB-210ENST00000551525 SUN5Q8TC36 379 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRB-210ENST00000551525 TAF4BQ92750 862 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRB-210ENST00000551525 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
PTPRB-210ENST00000551525 PCSK1NQ9UHG2 260 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRB-210ENST00000551525 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
PTPRB-210ENST00000551525 WDR46O15213 610 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
PTPRB-210ENST00000551525 RAD17O75943 681 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF445P59923 1031 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRB-210ENST00000551525 KLC1Q07866 573 aa6.86□□□□□ -1.31
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PTPRB-210ENST00000551525 NDUFA5Q16718 116 aa6.86□□□□□ -1.31
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PTPRB-210ENST00000551525 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
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PTPRB-210ENST00000551525 HOMER2Q9NSB8 354 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRB-210ENST00000551525 KLHL42Q9P2K6 505 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRB-210ENST00000551525 STXBP3O00186 592 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRB-210ENST00000551525 HOXA2O43364 376 aa6.85□□□□□ -1.31
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PTPRB-210ENST00000551525 TAF11Q15544 211 aa6.85□□□□□ -1.31
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PTPRB-210ENST00000551525 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF232Q9UNY5 417 aa6.85□□□□□ -1.31
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PTPRB-210ENST00000551525 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRB-210ENST00000551525 STMND1H3BQB6 276 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRB-210ENST00000551525 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRB-210ENST00000551525 CCDC15Q0P6D6 951 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRB-210ENST00000551525 LETM2Q2VYF4 491 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRB-210ENST00000551525 KCNV1Q6PIU1 500 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRB-210ENST00000551525 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRB-210ENST00000551525 BRAPQ7Z569 592 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRB-210ENST00000551525 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa6.85□□□□□ -1.31
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